Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr12 | 54059160 | . | G | A | CCDS8863.2:NM_005176.5:c.535Ctc>Ttc_NP_005167.2:p.179L>F | Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C2 (subunit 9) (ATP5G2), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
6z1r | 7 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
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K:P07926:0.371 |
||||||||||||
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L:P07926:0.347 |
||||||||||||
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M:P07926:0.382 |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
6z1u | 7 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | K:56 | K:56 | 111.0 | 0.653 | H | -80.4 | -7.4 | 46.0 | 0.271 | 0.382 |
Q:P07926:0.382 |
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||||||||||||
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L:P07926:0.312 |
||||||||||||
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M:P07926:0.4 |
||||||||||||
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U:P07926:0.494 |
||||||||||||
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O:P07926:0.5 |
||||||||||||
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P:P07926:0.265 |
||||||||||||
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EM |
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|||||
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B:P32876:0.288 |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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H:P32876:0.441 |
||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | D:56 | R:56 | 110.0 | 0.647 | H | -67.8 | -22.5 | 39.0 | 0.229 | 0.418 |
J:P07926:0.418 |
|||||
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D:P07926:0.382 |
||||||||||||
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E:P07926:0.418 |
||||||||||||
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F:P07926:0.441 |
||||||||||||
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G:P07926:0.412 |
||||||||||||
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K:P07926:0.324 |
||||||||||||
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||||||||||||
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H:P07926:0.418 |
||||||||||||
6zg8 | 4 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | D:56 | K:56 | 104.0 | 0.612 | H | -66.2 | -40.3 | 30.0 | 0.176 | 0.436 |
K:P07926:0.435 |
|||||
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D:P07926:0.394 |
||||||||||||
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||||||||||||
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F:P07926:0.4 |
||||||||||||
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G:P07926:0.371 |
||||||||||||
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H:P07926:0.459 |
||||||||||||
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I:P07926:0.382 |
||||||||||||
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J:P07926:0.435 |
||||||||||||
6zik | 4 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | D:56 | K:56 | 118.0 | 0.694 | H | -72.4 | -19.6 | 32.0 | 0.188 | 0.506 |
J:P07926:0.506 |
|||||
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D:P07926:0.406 |
||||||||||||
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E:P07926:0.412 |
||||||||||||
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F:P07926:0.376 |
||||||||||||
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K:P07926:0.324 |
||||||||||||
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H:P07926:0.441 |
||||||||||||
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I:P07926:0.382 |
||||||||||||
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G:P07926:0.306 |
||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | I:56 | M:56 | 116.0 | 0.682 | H | -69.0 | -45.3 | 65.0 | 0.382 | 0.3 |
B:P00847:0.3 |
|||||
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||||||||||||
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||||||||||||
6zit | 9 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | I:56 | R:56 | 122.0 | 0.718 | H | -64.2 | -43.7 | 88.0 | 0.518 | 0.2 |
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|||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | B:56 | K:56 | 103.0 | 0.606 | H | -56.5 | -62.5 | 35.0 | 0.206 | 0.4 |
I:F1RWF6:0.4 |
|||||
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B:F1RWF6:0.282 |
||||||||||||
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C:F1RWF6:0.335 |
||||||||||||
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D:F1RWF6:0.294 |
||||||||||||
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||||||||||||
LEU | G:56 | P:56 | 107.0 | 0.629 | H | -59.2 | -49.1 | 39.0 | 0.229 | 0.4 |
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||||||||||||
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G:F1RWF6:0.412 J:Q35915:0.247 |
||||||||||||
LEU | I:56 | R:56 | 119.0 | 0.7 | H | -69.7 | -11.1 | 37.0 | 0.218 | 0.482 |
H:F1RWF6:0.482 |
||||||||||||
6zna | 2 | F1RWF6 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | B:56 | AK:56 | 65.0 | NA | H | -60.8 | -49.3 | 54.0 | NA | NA |
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|||||
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||||||||||||
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C:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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D:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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E:F1RWF6:0.129 |
||||||||||||
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F:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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G:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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H:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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Z:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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U:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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Y:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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QA:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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JA:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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KA:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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||||||||||||
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MA:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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NA:F1RWF6:NA |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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LEU | M:55 | M:56 | 67.0 | NA | H | -74.3 | -15.8 | 57.0 | NA | NA |
L:P32876:NA |
||||||||||||
LEU | N:55 | N:56 | 67.0 | NA | T | -81.5 | -2.2 | 56.0 | NA | NA |
M:P32876:NA |
||||||||||||
LEU | O:55 | O:56 | 66.0 | NA | T | -92.4 | 7.0 | 50.0 | NA | NA |
N:P32876:NA |
||||||||||||
LEU | P:55 | P:56 | 69.0 | NA | T | -79.9 | -9.7 | 60.0 | NA | NA |
O:P32876:NA |
||||||||||||
LEU | Q:55 | Q:56 | 62.0 | NA | H | -67.2 | -24.8 | 54.0 | NA | NA |
P:P32876:NA |
||||||||||||
6j54 | 10 | Q4VT52 | 98.61 | 3e-44 |
EM |
2019-06-26 | LEU | J:55 | K:56 | 110.0 | 0.647 | H | -103.9 | -31.8 | 36.0 | 0.212 | 0.435 |
Q:Q4VT52:0.435 |
|||||
LEU | K:55 | L:56 | 123.0 | 0.724 | H | -78.2 | -14.2 | 29.0 | 0.171 | 0.553 |
J:Q4VT52:0.424 I:Q35915:0.129 |
||||||||||||
LEU | L:55 | M:56 | 126.0 | 0.741 | T | -88.0 | 11.6 | 46.0 | 0.271 | 0.47 |
K:Q4VT52:0.347 I:Q35915:0.124 |
||||||||||||
LEU | M:55 | N:56 | 123.0 | 0.724 | H | -74.4 | -18.9 | 12.0 | 0.071 | 0.653 |
I:Q35915:0.182 L:Q4VT52:0.5 |
||||||||||||
LEU | N:55 | O:56 | 107.0 | 0.629 | H | -88.6 | -31.8 | 36.0 | 0.212 | 0.417 |
I:Q35915:0.024 M:Q4VT52:0.4 |
||||||||||||
LEU | O:55 | P:56 | 112.0 | 0.659 | H | -76.7 | -55.9 | 31.0 | 0.182 | 0.477 |
N:Q4VT52:0.476 |
||||||||||||
LEU | P:55 | Q:56 | 111.0 | 0.653 | H | -74.5 | -43.4 | 46.0 | 0.271 | 0.382 |
O:Q4VT52:0.382 |
||||||||||||
LEU | Q:55 | R:56 | 125.0 | 0.735 | H | -87.8 | -28.0 | 56.0 | 0.329 | 0.406 |
P:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
6j5a | 10 | Q4VT52 | 98.61 | 3e-44 |
EM |
2019-06-26 | LEU | J:55 | K:56 | 111.0 | 0.653 | H | -103.9 | -31.8 | 37.0 | 0.218 | 0.435 |
Q:Q4VT52:0.435 |
|||||
LEU | K:55 | L:56 | 123.0 | 0.724 | H | -78.2 | -14.2 | 52.0 | 0.306 | 0.418 |
J:Q4VT52:0.418 |
||||||||||||
LEU | L:55 | M:56 | 127.0 | 0.747 | T | -88.1 | 11.7 | 41.0 | 0.241 | 0.506 |
K:Q4VT52:0.353 I:Q35915:0.159 |
||||||||||||
LEU | M:55 | N:56 | 123.0 | 0.724 | H | -74.4 | -18.9 | 4.0 | 0.024 | 0.7 |
I:Q35915:0.253 L:Q4VT52:0.494 |
||||||||||||
LEU | N:55 | O:56 | 108.0 | 0.635 | H | -88.6 | -31.8 | 19.0 | 0.112 | 0.523 |
I:Q35915:0.129 M:Q4VT52:0.412 |
||||||||||||
LEU | O:55 | P:56 | 112.0 | 0.659 | H | -76.7 | -56.0 | 31.0 | 0.182 | 0.477 |
N:Q4VT52:0.476 |
||||||||||||
LEU | P:55 | Q:56 | 111.0 | 0.653 | H | -74.5 | -43.4 | 45.0 | 0.265 | 0.388 |
O:Q4VT52:0.388 |
||||||||||||
LEU | Q:55 | R:56 | 123.0 | 0.724 | H | -87.8 | -28.0 | 54.0 | 0.318 | 0.406 |
P:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
6j5i | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 3e-44 |
EM |
2019-06-26 | LEU | V:55 | K:56 | 111.0 | 0.653 | H | -103.9 | -31.8 | 38.0 | 0.224 | 0.429 |
CA:Q4VT52:0.429 |
|||||
LEU | W:55 | L:56 | 121.0 | 0.712 | H | -78.2 | -14.2 | 52.0 | 0.306 | 0.406 |
V:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
LEU | X:55 | M:56 | 127.0 | 0.747 | T | -88.1 | 11.6 | 42.0 | 0.247 | 0.5 |
U:Q35915:0.159 W:Q4VT52:0.341 |
||||||||||||
LEU | Y:55 | N:56 | 123.0 | 0.724 | H | -74.4 | -18.9 | 5.0 | 0.029 | 0.695 |
U:Q35915:0.259 X:Q4VT52:0.488 |
||||||||||||
LEU | Z:55 | O:56 | 107.0 | 0.629 | H | -88.6 | -31.9 | 20.0 | 0.118 | 0.511 |
U:Q35915:0.118 Y:Q4VT52:0.4 |
||||||||||||
LEU | AA:55 | P:56 | 112.0 | 0.659 | H | -76.6 | -56.0 | 32.0 | 0.188 | 0.471 |
Z:Q4VT52:0.471 |
||||||||||||
LEU | BA:55 | Q:56 | 110.0 | 0.647 | H | -74.6 | -43.4 | 46.0 | 0.271 | 0.376 |
AA:Q4VT52:0.376 |
||||||||||||
LEU | CA:55 | R:56 | 123.0 | 0.724 | H | -87.7 | -28.1 | 54.0 | 0.318 | 0.406 |
BA:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
6j5j | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 3e-44 |
EM |
2019-06-26 | LEU | V:55 | K:56 | 113.0 | 0.665 | H | -104.0 | -31.8 | 39.0 | 0.229 | 0.436 |
CA:Q4VT52:0.435 |
|||||
LEU | W:55 | L:56 | 121.0 | 0.712 | H | -78.2 | -14.1 | 30.0 | 0.176 | 0.536 |
U:Q35915:0.118 V:Q4VT52:0.412 |
||||||||||||
LEU | X:55 | M:56 | 126.0 | 0.741 | T | -88.0 | 11.5 | 45.0 | 0.265 | 0.476 |
U:Q35915:0.124 W:Q4VT52:0.353 |
||||||||||||
LEU | Y:55 | N:56 | 123.0 | 0.724 | H | -74.4 | -18.9 | 13.0 | 0.076 | 0.648 |
X:Q4VT52:0.494 U:Q35915:0.182 |
||||||||||||
LEU | Z:55 | O:56 | 107.0 | 0.629 | H | -88.6 | -31.8 | 35.0 | 0.206 | 0.423 |
U:Q35915:0.024 Y:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
LEU | AA:55 | P:56 | 112.0 | 0.659 | H | -76.7 | -55.9 | 33.0 | 0.194 | 0.465 |
Z:Q4VT52:0.465 |
||||||||||||
LEU | BA:55 | Q:56 | 111.0 | 0.653 | H | -74.5 | -43.4 | 48.0 | 0.282 | 0.371 |
AA:Q4VT52:0.371 |
||||||||||||
LEU | CA:55 | R:56 | 122.0 | 0.718 | H | -87.8 | -28.0 | 54.0 | 0.318 | 0.4 |
BA:Q4VT52:0.4 |
||||||||||||
6j5k | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 3e-44 |
EM |
2019-06-26 | LEU | V:55 | K:56 | 111.0 | 0.653 | H | -104.0 | -31.8 | 37.0 | 0.218 | 0.435 |
CA:Q4VT52:0.435 |
|||||
LEU | W:55 | L:56 | 120.0 | 0.706 | H | -78.2 | -14.1 | 31.0 | 0.182 | 0.524 |
U:Q35915:0.112 V:Q4VT52:0.412 |
||||||||||||
LEU | X:55 | M:56 | 125.0 | 0.735 | T | -88.1 | 11.5 | 47.0 | 0.276 | 0.459 |
U:Q35915:0.124 W:Q4VT52:0.335 |
||||||||||||
LEU | Y:55 | N:56 | 123.0 | 0.724 | H | -74.4 | -18.9 | 12.0 | 0.071 | 0.653 |
X:Q4VT52:0.488 U:Q35915:0.194 |
||||||||||||
LEU | Z:55 | O:56 | 108.0 | 0.635 | H | -88.6 | -31.8 | 37.0 | 0.218 | 0.417 |
U:Q35915:0.029 Y:Q4VT52:0.4 |
||||||||||||
LEU | AA:55 | P:56 | 111.0 | 0.653 | H | -76.7 | -55.9 | 31.0 | 0.182 | 0.471 |
Z:Q4VT52:0.471 |
||||||||||||
LEU | BA:55 | Q:56 | 111.0 | 0.653 | H | -74.5 | -43.4 | 46.0 | 0.271 | 0.382 |
AA:Q4VT52:0.382 |
||||||||||||
LEU | CA:55 | R:56 | 124.0 | 0.729 | H | -87.7 | -28.0 | 55.0 | 0.324 | 0.405 |
BA:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
LEU | ZA:55 | AK:56 | 113.0 | 0.665 | H | -104.0 | -31.8 | 36.0 | 0.212 | 0.453 |
GB:Q4VT52:0.453 |
||||||||||||
LEU | AB:55 | AL:56 | 124.0 | 0.729 | H | -78.3 | -14.1 | 30.0 | 0.176 | 0.553 |
YA:Q35915:0.135 ZA:Q4VT52:0.418 |
||||||||||||
LEU | BB:55 | AM:56 | 126.0 | 0.741 | T | -88.0 | 11.5 | 46.0 | 0.271 | 0.47 |
YA:Q35915:0.129 AB:Q4VT52:0.347 |
||||||||||||
LEU | CB:55 | AN:56 | 125.0 | 0.735 | H | -74.4 | -18.9 | 13.0 | 0.076 | 0.659 |
BB:Q4VT52:0.5 YA:Q35915:0.182 |
||||||||||||
LEU | DB:55 | AO:56 | 107.0 | 0.629 | H | -88.6 | -31.8 | 35.0 | 0.206 | 0.423 |
CB:Q4VT52:0.406 YA:Q35915:0.024 |
||||||||||||
LEU | EB:55 | AP:56 | 114.0 | 0.671 | H | -76.7 | -55.9 | 34.0 | 0.2 | 0.471 |
DB:Q4VT52:0.471 |
||||||||||||
LEU | FB:55 | AQ:56 | 111.0 | 0.653 | H | -74.5 | -43.4 | 47.0 | 0.276 | 0.377 |
EB:Q4VT52:0.376 |
||||||||||||
LEU | GB:55 | AR:56 | 123.0 | 0.724 | H | -87.8 | -28.0 | 54.0 | 0.318 | 0.406 |
FB:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
LEU | DC:55 | BK:56 | 111.0 | 0.653 | H | -103.8 | -31.8 | 37.0 | 0.218 | 0.435 |
KC:Q4VT52:0.435 |
||||||||||||
LEU | EC:55 | BL:56 | 122.0 | 0.718 | H | -78.3 | -14.2 | 51.0 | 0.3 | 0.418 |
DC:Q4VT52:0.418 |
||||||||||||
LEU | FC:55 | BM:56 | 123.0 | 0.724 | T | -88.0 | 11.6 | 38.0 | 0.224 | 0.5 |
EC:Q4VT52:0.341 CC:Q35915:0.159 |
||||||||||||
LEU | GC:55 | BN:56 | 125.0 | 0.735 | H | -74.5 | -18.9 | 4.0 | 0.024 | 0.711 |
FC:Q4VT52:0.5 CC:Q35915:0.265 |
||||||||||||
LEU | HC:55 | BO:56 | 106.0 | 0.624 | H | -88.6 | -31.9 | 20.0 | 0.118 | 0.506 |
CC:Q35915:0.118 GC:Q4VT52:0.4 |
||||||||||||
LEU | IC:55 | BP:56 | 110.0 | 0.647 | H | -76.6 | -56.0 | 32.0 | 0.188 | 0.459 |
HC:Q4VT52:0.459 |
||||||||||||
LEU | JC:55 | BQ:56 | 110.0 | 0.647 | H | -74.6 | -43.4 | 47.0 | 0.276 | 0.371 |
IC:Q4VT52:0.371 |
||||||||||||
LEU | KC:55 | BR:56 | 124.0 | 0.729 | H | -87.7 | -28.1 | 55.0 | 0.324 | 0.405 |
JC:Q4VT52:0.406 |
||||||||||||
LEU | HD:55 | CK:56 | 112.0 | 0.659 | H | -103.9 | -31.8 | 37.0 | 0.218 | 0.441 |
OD:Q4VT52:0.441 |
||||||||||||
LEU | ID:55 | CL:56 | 122.0 | 0.718 | H | -78.2 | -14.2 | 50.0 | 0.294 | 0.424 |
HD:Q4VT52:0.424 |
||||||||||||
LEU | JD:55 | CM:56 | 126.0 | 0.741 | T | -88.1 | 11.7 | 41.0 | 0.241 | 0.5 |
GD:Q35915:0.159 ID:Q4VT52:0.347 |
||||||||||||
LEU | KD:55 | CN:56 | 126.0 | 0.741 | H | -74.3 | -18.9 | 4.0 | 0.024 | 0.717 |
JD:Q4VT52:0.5 GD:Q35915:0.259 |
||||||||||||
LEU | LD:55 | CO:56 | 108.0 | 0.635 | H | -88.5 | -31.9 | 19.0 | 0.112 | 0.523 |
KD:Q4VT52:0.406 GD:Q35915:0.129 |
||||||||||||
LEU | MD:55 | CP:56 | 112.0 | 0.659 | H | -76.6 | -56.0 | 31.0 | 0.182 | 0.477 |
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||||||||||||
LEU | ND:55 | CQ:56 | 110.0 | 0.647 | H | -74.6 | -43.4 | 45.0 | 0.265 | 0.382 |
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||||||||||||
LEU | OD:55 | CR:56 | 123.0 | 0.724 | H | -87.7 | -28.1 | 54.0 | 0.318 | 0.406 |
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