Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr12 | 6924146 | . | A | C | CCDS8562.1:NM_000616.4:c.595Atc>Ctc_NP_000607.1:p.199I>L | Homo sapiens CD4 molecule (CD4), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 7t0o | 4 | P01730 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2022-01-12 | ILE | G:174 | H:174 | 6.0 | 0.034 | -128.8 | 129.1 | 5.0 | 0.029 | 0.005 |
H:None:0.006 |
||||||
| ILE | I:174 | L:174 | 12.0 | 0.069 | -129.0 | 127.6 | 9.0 | 0.051 | 0.018 |
J:None:0.017 |
|||||||||||||
| ILE | K:174 | M:174 | 12.0 | 0.069 | -128.9 | 127.6 | 9.0 | 0.051 | 0.018 |
L:None:0.017 |
|||||||||||||
| 7t0r | 3 | P01730 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | ILE | C:174 | A:174 | 5.0 | 0.029 | -121.4 | 129.3 | 4.0 | 0.023 | 0.006 |
G:None:0.006 |
||||||
| ILE | F:174 | D:174 | 7.0 | 0.04 | -123.5 | 125.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 1wio | 1 | P01730 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
1997-07-07 | ILE | A:174 | A:174 | 4.0 | 0.023 | E | -139.3 | 106.4 | 4.0 | 0.023 | 0.0 | ||||||
| ILE | B:174 | B:174 | 4.0 | 0.023 | E | -135.8 | 106.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1wip | 1 | P01730 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
1997-07-07 | ILE | A:174 | A:174 | 5.0 | 0.029 | E | -139.3 | 106.4 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | ||||||
| ILE | B:174 | B:174 | 5.0 | 0.029 | E | -135.8 | 106.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1wiq | 1 | P01730 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
1997-07-07 | ILE | A:174 | A:174 | 5.0 | 0.029 | E | -139.3 | 106.4 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | ||||||
| ILE | B:174 | B:174 | 4.0 | 0.023 | E | -135.7 | 106.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5u1f | 5 | P01730 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2017-02-22 | ILE | I:174 | M:1174 | 52.0 | NA | E | -114.3 | 127.3 | 52.0 | NA | NA | ||||||
| 6met | 2 | P01730 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-12-12 | ILE | B:174 | A:174 | 23.0 | 0.131 | -123.5 | 119.8 | 23.0 | 0.131 | 0.0 | |||||||
| 3t0e | 5 | P01730 | 99.45 | 0.0 |
X-RAY |
2012-03-07 | ILE | E:174 | E:174 | 26.0 | 0.149 | -130.7 | -61.9 | 26.0 | 0.149 | 0.0 | |||||||
| 4q6i | 3 | P01730 | 100.0 | 1e-148 |
X-RAY |
2014-07-23 | ILE | C:199 | C:174 | 12.0 | 0.069 | E | -129.1 | 136.9 | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | I:199 | I:174 | 11.0 | 0.063 | E | -128.2 | 137.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | J:199 | J:174 | 12.0 | 0.069 | E | -128.5 | 137.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | K:199 | K:174 | 13.0 | 0.074 | E | -128.2 | 137.4 | 13.0 | 0.074 | 0.0 | |||||||||||||
| 1g9m | 2 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
2000-12-27 | ILE | B:174 | C:174 | 4.0 | 0.023 | E | -128.5 | 154.7 | 4.0 | 0.023 | 0.0 |
HOH |
3.955 |
CD1 |
O |
||
| 1g9n | 2 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
2000-12-27 | ILE | B:174 | C:174 | 5.0 | 0.029 | -128.6 | 143.0 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | |||||||
| 1gc1 | 2 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
1998-07-08 | ILE | B:174 | C:174 | 1.0 | 0.006 | E | -115.3 | 143.1 | 1.0 | 0.006 | 0.0 |
HOH |
4.973 |
CD1 |
O |
||
| 1rzj | 2 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
2004-02-03 | ILE | B:174 | C:174 | 3.0 | 0.017 | E | -136.2 | 152.9 | 3.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
4.351 |
CD1 |
O |
||
| 1rzk | 2 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
2004-02-03 | ILE | B:174 | C:174 | 5.0 | 0.029 | -127.4 | 140.6 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | |||||||
| 3j70 | 3 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
EM |
2015-08-26 | ILE | C:174 | C:174 | 0.0 | 0.0 | E | -115.0 | 129.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||
| ILE | H:174 | O:174 | 0.0 | 0.0 | E | -115.0 | 129.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | |||||||||||||
| ILE | M:174 | T:174 | 0.0 | 0.0 | E | -115.0 | 129.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | |||||||||||||
| 4h8w | 4 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
2014-04-09 | ILE | D:174 | C:174 | 2.0 | 0.011 | E | -115.9 | 143.5 | 2.0 | 0.011 | 0.0 |
HOH |
7.100 |
CD1 |
O |
||
| 4jm2 | 6 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
2013-05-29 | ILE | F:174 | F:174 | 40.0 | 0.229 | -173.4 | 134.2 | 40.0 | 0.229 | 0.0 | |||||||
| 4rqs | 1 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
X-RAY |
2014-12-31 | ILE | A:174 | B:174 | 4.0 | 0.023 | E | -118.4 | 127.0 | 4.0 | 0.023 | 0.0 | ||||||
| 5a8h | 2 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
EM |
2015-08-05 | ILE | B:174 | B:174 | 5.0 | 0.029 | -127.4 | 140.6 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | |||||||
| ILE | H:174 | H:174 | 6.0 | 0.034 | -127.4 | 140.7 | 6.0 | 0.034 | 0.0 | ||||||||||||||
| ILE | N:174 | N:174 | 5.0 | 0.029 | -127.4 | 140.6 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | ||||||||||||||
| 5vn3 | 4 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
EM |
2017-07-12 | ILE | D:174 | C:174 | 26.0 | 0.149 | -129.3 | 108.8 | 26.0 | 0.149 | 0.0 | |||||||
| ILE | I:174 | E:174 | 27.0 | 0.154 | -129.2 | 108.8 | 27.0 | 0.154 | 0.0 | ||||||||||||||
| ILE | N:174 | F:174 | 26.0 | 0.149 | -129.3 | 108.8 | 26.0 | 0.149 | 0.0 | ||||||||||||||
| 6edu | 3 | P01730 | 99.46 | 6e-129 |
EM |
2018-10-17 | ILE | G:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | H:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | I:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2nxy | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 9.0 | 0.051 | E | -118.2 | 134.7 | 9.0 | 0.051 | 0.0 |
HOH |
3.208 |
O |
O |
||
| 2nxz | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 7.0 | 0.04 | E | -121.7 | 128.3 | 7.0 | 0.04 | 0.0 |
HOH |
3.447 |
CD1 |
O |
||
| 2ny0 | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 8.0 | 0.046 | E | -117.5 | 135.4 | 8.0 | 0.046 | 0.0 |
HOH |
5.183 |
CA |
O |
||
| 2ny1 | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 2.0 | 0.011 | E | -122.0 | 128.8 | 2.0 | 0.011 | 0.0 |
HOH |
4.087 |
CD1 |
O |
||
| 2ny2 | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 9.0 | 0.051 | E | -120.7 | 130.6 | 9.0 | 0.051 | 0.0 |
HOH |
3.033 |
O |
O |
||
| 2ny3 | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 9.0 | 0.051 | E | -119.1 | 135.5 | 9.0 | 0.051 | 0.0 |
HOH |
3.099 |
O |
O |
||
| 2ny4 | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 10.0 | 0.057 | E | -116.4 | 135.2 | 10.0 | 0.057 | 0.0 |
HOH |
3.759 |
CA |
O |
||
| 2ny5 | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | C:1174 | 11.0 | 0.063 | E | -100.9 | 132.3 | 11.0 | 0.063 | 0.0 |
HOH |
3.934 |
CA |
O |
||
| 2ny6 | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2007-02-06 | ILE | B:175 | B:1174 | 9.0 | 0.051 | E | -101.3 | 143.4 | 9.0 | 0.051 | 0.0 |
HOH |
3.945 |
CD1 |
O |
||
| 3jwd | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2009-12-29 | ILE | B:175 | C:1174 | 12.0 | 0.069 | E | -98.3 | 123.8 | 12.0 | 0.069 | 0.0 |
HOH |
8.797 |
O |
O |
||
| ILE | F:175 | D:1174 | 14.0 | 0.08 | -90.7 | 132.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3jwo | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2009-12-29 | ILE | B:175 | C:1174 | 13.0 | 0.074 | E | -98.4 | 123.8 | 13.0 | 0.074 | 0.0 | ||||||
| 4r2g | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2014-10-08 | ILE | B:175 | F:174 | 16.0 | 0.091 | E | -122.4 | 158.0 | 16.0 | 0.091 | 0.0 | ||||||
| ILE | E:175 | B:174 | 17.0 | 0.097 | E | -137.1 | 141.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | H:175 | H:174 | 11.0 | 0.063 | -120.7 | 143.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | K:175 | L:174 | 18.0 | 0.103 | E | -127.2 | 143.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5cay | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-129 |
X-RAY |
2015-12-09 | ILE | B:175 | B:174 | 214.0 | 1.0 | -120.4 | 360.0 | 214.0 | 1.0 | 0.0 | |||||||
| 3o2d | 3 | P01730 | 100.0 | 3e-128 |
X-RAY |
2010-12-22 | ILE | C:174 | A:174 | 3.0 | 0.017 | E | -128.7 | 128.6 | 3.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
6.590 |
CD1 |
O |
||
| 3cd4 | 1 | P01730 | 100.0 | 3e-128 |
X-RAY |
1993-10-31 | ILE | A:174 | A:174 | 14.0 | 0.08 | E | -104.1 | 136.2 | 14.0 | 0.08 | 0.0 | ||||||
| 3lqa | 1 | P01730 | 100.0 | 4e-128 |
X-RAY |
2010-04-07 | ILE | A:174 | C:174 | 36.0 | 0.206 | -120.1 | 127.9 | 36.0 | 0.206 | 0.0 | |||||||
| 5thr | 3 | P01730 | 100.0 | 4e-128 |
EM |
2016-11-16 | ILE | G:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | H:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | I:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6cm3 | 3 | P01730 | 100.0 | 4e-128 |
EM |
2018-10-17 | ILE | G:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | H:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | I:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u0l | 2 | P01730 | 100.0 | 4e-128 |
EM |
2019-12-11 | ILE | D:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | E:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | F:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u0n | 2 | P01730 | 100.0 | 4e-128 |
EM |
2019-12-11 | ILE | D:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | E:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | F:174 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2b4c | 2 | P01730 | 100.0 | 2e-127 |
X-RAY |
2005-11-15 | ILE | B:174 | C:174 | 20.0 | 0.114 | E | -123.0 | 125.3 | 20.0 | 0.114 | 0.0 | ||||||
| 2qad | 2 | P01730 | 100.0 | 2e-127 |
X-RAY |
2007-09-25 | ILE | B:174 | B:174 | 9.0 | 0.051 | E | -131.1 | 122.9 | 9.0 | 0.051 | 0.0 | ||||||
| ILE | F:174 | F:174 | 9.0 | 0.051 | E | -131.5 | 124.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5a7x | 2 | P01730 | 100.0 | 2e-127 |
EM |
2015-08-05 | ILE | B:174 | B:174 | 5.0 | 0.029 | -127.4 | 140.7 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | |||||||
| ILE | F:174 | F:174 | 6.0 | 0.034 | -127.5 | 140.7 | 6.0 | 0.034 | 0.0 | ||||||||||||||
| ILE | J:174 | J:174 | 5.0 | 0.029 | -127.4 | 140.7 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | ||||||||||||||
| 4p9h | 1 | P01730 | 99.45 | 3e-127 |
X-RAY |
2014-05-21 | ILE | A:174 | C:174 | 41.0 | 0.234 | -134.5 | -175.9 | 41.0 | 0.234 | 0.0 | |||||||
| 6opn | 3 | P01730 | 98.37 | 8e-126 |
EM |
2020-10-21 | ILE | C:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | F:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | I:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6opo | 4 | P01730 | 98.37 | 8e-126 |
EM |
2020-10-21 | ILE | D:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | I:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | N:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6opp | 4 | P01730 | 98.37 | 8e-126 |
EM |
2020-10-21 | ILE | D:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | M:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | O:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6opq | 4 | P01730 | 98.37 | 8e-126 |
EM |
2020-10-21 | ILE | D:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | I:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | N:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6x5b | 4 | P01730 | 98.37 | 8e-126 |
EM |
2020-10-21 | ILE | D:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | I:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | N:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6x5c | 3 | P01730 | 98.37 | 8e-126 |
EM |
2020-10-21 | ILE | C:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | F:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | I:194 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1cdi | 1 | P01730 | 100.0 | 6e-125 |
X-RAY |
1994-04-30 | ILE | A:175 | A:174 | 5.0 | 0.029 | E | -118.6 | 139.5 | 5.0 | 0.029 | 0.0 | ||||||
| 1cdh | 1 | P01730 | 100.0 | 7e-125 |
X-RAY |
1994-04-30 | ILE | A:174 | A:174 | 3.0 | 0.017 | -108.2 | 131.6 | 3.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
3.595 |
O |
O |
|||
| 1cdj | 1 | P01730 | 100.0 | 7e-125 |
X-RAY |
1997-04-01 | ILE | A:174 | A:174 | 2.0 | 0.011 | -126.0 | 157.0 | 2.0 | 0.011 | 0.0 |
HOH |
3.642 |
CD1 |
O |
|||
| 1jl4 | 4 | P01730 | 100.0 | 7e-125 |
X-RAY |
2001-09-19 | ILE | D:174 | D:174 | 12.0 | 0.069 | E | -104.1 | 136.1 | 12.0 | 0.069 | 0.0 | ||||||
| 4r4h | 2 | P01730 | 100.0 | 7e-125 |
X-RAY |
2014-09-17 | ILE | B:174 | B:174 | 11.0 | 0.063 | E | -118.1 | 123.0 | 11.0 | 0.063 | 0.0 | ||||||
| 6l1y | 2 | P01730 | 100.0 | 4e-124 |
X-RAY |
2020-05-20 | ILE | B:174 | C:174 | 7.0 | 0.04 | E | -122.7 | 141.5 | 7.0 | 0.04 | 0.0 |
HOH |
8.734 |
CG2 |
O |
||
| 1cdy | 1 | P01730 | 99.44 | 6e-124 |
X-RAY |
1997-04-01 | ILE | A:174 | A:174 | 2.0 | 0.011 | E | -86.7 | 117.9 | 2.0 | 0.011 | 0.0 |
HOH |
2.759 |
CA |
O |
||
| 1cdu | 1 | P01730 | 99.44 | 8e-124 |
X-RAY |
1997-04-01 | ILE | A:174 | A:174 | 1.0 | 0.006 | E | -106.7 | 116.9 | 1.0 | 0.006 | 0.0 |
HOH |
5.246 |
O |
O |
||
| 6meo | 2 | P01730 | 100.0 | 2e-123 |
EM |
2018-12-12 | ILE | B:174 | A:174 | 22.0 | 0.126 | -123.5 | 124.2 | 22.0 | 0.126 | 0.0 | |||||||
| 3jcb | 4 | P01730 | 100.0 | 7e-123 |
EM |
2017-05-10 | ILE | D:174 | D:174 | 21.0 | 0.12 | E | -123.1 | 125.3 | 21.0 | 0.12 | 0.0 | ||||||
| 3jcc | 4 | P01730 | 100.0 | 7e-123 |
EM |
2017-05-10 | ILE | D:174 | D:174 | 16.0 | 0.091 | E | -124.6 | 141.5 | 16.0 | 0.091 | 0.0 | ||||||
| 3s4s | 4 | P01730 | 98.88 | 9e-123 |
X-RAY |
2011-09-21 | ILE | D:178 | G:174 | 19.0 | 0.109 | E | -107.9 | 145.3 | 19.0 | 0.109 | 0.0 | ||||||
| ILE | H:178 | H:174 | 24.0 | 0.137 | E | -90.8 | 127.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3s5l | 4 | P01730 | 97.74 | 3e-119 |
X-RAY |
2011-09-21 | ILE | G:178 | G:174 | 18.0 | 0.103 | E | -105.1 | 151.0 | 18.0 | 0.103 | 0.0 | ||||||
| ILE | H:178 | H:174 | 19.0 | 0.109 | E | -123.9 | 138.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6tyb | 2 | F6XGD3 | 87.64 | 3e-101 |
X-RAY |
2019-10-02 | ILE | B:174 | C:174 | 30.0 | 0.171 | E | -127.5 | 146.5 | 30.0 | 0.171 | 0.0 |
HOH |
3.971 |
CD1 |
O |
||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p01730-f1 | 1 | P01730 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:199 | A:199 | 1.0 | 0.006 | E | -119.7 | 129.3 | |