Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr12 21531208 . T A CCDS8688.1:NM_000415.2:c.118Tgt>Agt_NP_000406.1:p.40C>S Homo sapiens islet amyloid polypeptide (IAPP), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6ucj 1 P10997 100.0 3e-45 NMR
 2020-02-26 CYS A:18 A:18 28.0 0.207 H -63.2 -27.7 28.0 0.207 0.0
6uck 1 P10997 100.0 3e-45 NMR
 2020-02-26 CYS A:18 A:18 16.0 0.119 H -58.6 -50.7 16.0 0.119 0.0
6vw2 1 Q12306,P10997 86.96 1e-22 EM
 2020-06-10 CYS A:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS F:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS H:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS J:125 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2g48 2 P10997 100.0 2e-20 X-RAY
 2006-10-24 CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3hgz 2 P10997 100.0 2e-20 X-RAY
 2009-12-08 CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 E:7 138.0 1.0 360.0 101.5 NA NA NA
5k5g 1 P10997 100.0 2e-20 NMR
 2016-10-26 CYS A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6y1a 1 P10997 100.0 2e-20 EM
 2020-03-04 CYS A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS F:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS H:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS J:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS K:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS L:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS M:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS N:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS O:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS P:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2l86 1 P10997 100.0 3e-20 NMR
 2011-07-13 CYS A:7 A:7 44.0 0.326 H -51.0 -31.0 44.0 0.326 0.0
7m61 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 CYS A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS F:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS H:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS J:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7m62 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 CYS A:7 A:7 124.0 0.919 -140.1 157.1 51.0 0.378 0.541 F:P10997:0.17
D:P10997:0.356
E:P10997:0.022
B:P10997:0.089
CYS B:7 B:7 124.0 0.919 -140.1 157.2 51.0 0.378 0.541 F:P10997:0.022
C:P10997:0.356
A:P10997:0.089
E:P10997:0.156
CYS C:7 C:7 123.0 0.911 -140.1 157.2 51.0 0.378 0.533 H:P10997:0.363
D:P10997:0.089
A:P10997:0.015
B:P10997:0.156
CYS D:7 D:7 125.0 0.926 -140.1 157.2 50.0 0.37 0.556 C:P10997:0.089
G:P10997:0.363
A:P10997:0.17
B:P10997:0.022
CYS E:7 E:7 125.0 0.926 -140.1 157.1 50.0 0.37 0.556 F:P10997:0.089
I:P10997:0.022
J:P10997:0.163
B:P10997:0.37
CYS F:7 F:7 123.0 0.911 -140.0 157.1 51.0 0.378 0.533 I:P10997:0.163
A:P10997:0.356
J:P10997:0.015
E:P10997:0.081
CYS G:7 G:7 126.0 0.933 -140.1 157.2 90.0 0.667 0.266 H:P10997:0.096
C:P10997:0.03
D:P10997:0.17
CYS H:7 H:7 121.0 0.896 -140.2 157.2 87.0 0.644 0.252 C:P10997:0.163
G:P10997:0.089
D:P10997:0.015
CYS I:7 I:7 122.0 0.904 -140.2 157.1 72.0 0.533 0.371 F:P10997:0.356
J:P10997:0.081
CYS J:7 J:7 125.0 0.926 -140.1 157.2 73.0 0.541 0.385 I:P10997:0.089
E:P10997:0.37
7m64 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 CYS A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS F:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS H:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS J:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7m65 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 CYS A:7 A:7 138.0 1.0 -99.1 125.8 62.0 0.459 0.541 G:P10997:0.452
I:P10997:0.104
CYS B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:7 C:7 140.0 1.0 -99.1 125.8 125.0 0.926 0.074 E:P10997:0.111
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:7 E:7 138.0 1.0 -99.1 125.8 64.0 0.474 0.526 C:P10997:0.43
G:P10997:0.111
CYS F:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:7 G:7 138.0 1.0 -99.1 125.8 63.0 0.467 0.533 A:P10997:0.111
E:P10997:0.444
CYS H:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:7 I:7 142.0 1.0 -99.1 125.8 78.0 0.578 0.422 A:P10997:0.474
CYS J:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g7v 1 P0AEX9,P10997 100.0 1e-19 X-RAY
 2009-06-23 CYS A:378 A:377 52.0 0.385 -71.6 158.9 52.0 0.385 0.0 HOH
 2.930
 N
 O
CYS B:378 B:377 50.0 0.37 -69.6 157.2 50.0 0.37 0.0 HOH
 2.863
 N
 O
CYS C:378 C:377 53.0 0.393 -68.9 157.2 NA NA NA
CYS D:378 D:377 61.0 0.452 -56.5 147.0 NA NA NA
5mgq 1 P10997 100.0 4e-19 NMR
 2017-03-29 CYS A:7 A:7 37.0 0.274 T -129.9 -41.5 37.0 0.274 0.0
6zrf 1 P10997 100.0 4e-19 EM
 2020-09-30 CYS A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS F:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS H:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS J:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS K:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS L:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6zrq 1 P10997 97.22 2e-18 EM
 2020-09-30 CYS A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS F:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS H:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS J:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS K:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS L:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6zrr 1 P10997 97.22 2e-18 EM
 2020-09-30 CYS A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS E:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS F:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS G:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS H:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS I:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS J:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS K:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS L:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS M:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS N:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS O:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS P:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS Q:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS R:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7bg0 1 P0AEX9,P10997 86.11 1e-14 X-RAY
 2021-08-04 CYS A:378 A:403 37.0 0.274 H -72.9 -34.4 37.0 0.274 0.0
CYS B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS C:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS D:378 E:403 38.0 0.281 H -66.1 -32.8 NA NA NA
3g7w 1 P0AEX9,P10997 100.0 6e-09 X-RAY
 2009-06-23 CYS A:378 A:377 4.0 0.03 59.6 38.3 4.0 0.03 0.0 GLC
SO4
SO4
SO4
GOL
HOH
 8.302
3.144
9.432
6.778
9.100
3.703
 N
C
SG
O
C
SG
 O3
O2
O1
O3
O1
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p10997-f1 1 P10997 100.0 1e-61 CYS A:40 A:40 17.0 0.126 H -64.0 -30.1