Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr12 21531220 . C A CCDS8688.1:NM_000415.2:c.130Cgc>Agc_NP_000406.1:p.44R>S Homo sapiens islet amyloid polypeptide (IAPP), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6ucj 1 P10997 100.0 3e-45 NMR
 2020-02-26 ARG A:22 A:22 174.0 0.773 H -67.1 -26.3 174.0 0.773 0.0
6uck 1 P10997 100.0 3e-45 NMR
 2020-02-26 ARG A:22 A:22 161.0 0.716 H -67.7 -44.8 161.0 0.716 0.0
6vw2 1 Q12306,P10997 86.96 1e-22 EM
 2020-06-10 ARG A:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2g48 2 P10997 100.0 2e-20 X-RAY
 2006-10-24 ARG C:11 C:11 98.0 NA -76.8 158.3 98.0 NA NA HOH
 5.866
 CB
 O
ARG D:11 D:11 153.0 NA 360.0 138.7 NA NA NA
3hgz 2 P10997 100.0 2e-20 X-RAY
 2009-12-08 ARG C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5k5g 1 P10997 100.0 2e-20 NMR
 2016-10-26 ARG A:11 A:11 195.0 0.867 -139.4 136.9 115.0 0.511 0.356 C:None:0.356
6y1a 1 P10997 100.0 2e-20 EM
 2020-03-04 ARG A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG K:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG M:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG N:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG O:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG P:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2l86 1 P10997 100.0 3e-20 NMR
 2011-07-13 ARG A:11 A:11 141.0 0.627 H -55.5 -63.1 141.0 0.627 0.0
7m61 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 ARG A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7m62 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 ARG A:11 A:11 236.0 1.0 -131.1 84.9 104.0 0.462 0.538 F:P10997:0.218
D:P10997:0.373
ARG B:11 B:11 235.0 1.0 -131.1 84.9 104.0 0.462 0.538 C:P10997:0.373
E:P10997:0.204
ARG C:11 C:11 234.0 1.0 -131.1 84.9 103.0 0.458 0.542 H:P10997:0.373
B:P10997:0.209
ARG D:11 D:11 238.0 1.0 -131.1 84.9 104.0 0.462 0.538 G:P10997:0.378
A:P10997:0.222
ARG E:11 E:11 235.0 1.0 -131.2 84.9 106.0 0.471 0.529 J:P10997:0.2
B:P10997:0.373
ARG F:11 F:11 236.0 1.0 -131.2 84.9 105.0 0.467 0.533 I:P10997:0.209
A:P10997:0.369
ARG G:11 G:11 236.0 1.0 -131.1 84.9 187.0 0.831 0.169 D:P10997:0.218
ARG H:11 H:11 235.0 1.0 -131.1 84.9 189.0 0.84 0.16 C:P10997:0.204
ARG I:11 I:11 237.0 1.0 -131.1 84.9 154.0 0.684 0.316 F:P10997:0.369
ARG J:11 J:11 234.0 1.0 -131.1 84.9 150.0 0.667 0.333 E:P10997:0.373
7m64 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 ARG A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7m65 1 P10997 100.0 3e-20 EM
 2021-09-22 ARG A:11 A:11 253.0 1.0 -138.4 88.5 128.0 0.569 0.431 G:P10997:0.32
I:P10997:0.236
ARG B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:11 C:11 254.0 1.0 -138.5 88.5 199.0 0.884 0.116 E:P10997:0.244
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:11 E:11 252.0 1.0 -138.4 88.5 129.0 0.573 0.427 C:P10997:0.311
G:P10997:0.24
ARG F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:11 G:11 249.0 1.0 -138.5 88.5 125.0 0.556 0.444 A:P10997:0.236
E:P10997:0.316
ARG H:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:11 I:11 255.0 1.0 -138.5 88.5 181.0 0.804 0.196 A:P10997:0.329
ARG J:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g7v 1 P0AEX9,P10997 100.0 1e-19 X-RAY
 2009-06-23 ARG A:382 A:381 76.0 0.338 H -59.8 -42.9 43.0 0.191 0.147 B:P0AEX9+P10997:0.147
 SO4
HOH
 7.728
2.962
 NH2
NH2
 O1
O
ARG B:382 B:381 76.0 0.338 H -63.4 -37.8 42.0 0.187 0.151 A:P0AEX9+P10997:0.151
 SO4
HOH
 7.748
3.543
 NH2
NH1
 O1
O
ARG C:382 C:381 76.0 0.338 H -63.4 -40.6 NA NA NA
ARG D:382 D:381 75.0 0.333 H -59.6 -42.7 NA NA NA
5mgq 1 P10997 100.0 4e-19 NMR
 2017-03-29 ARG A:11 A:11 145.0 0.644 H -65.9 -37.1 145.0 0.644 0.0
6zrf 1 P10997 100.0 4e-19 EM
 2020-09-30 ARG A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG K:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6zrq 1 P10997 97.22 2e-18 EM
 2020-09-30 ARG A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG K:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6zrr 1 P10997 97.22 2e-18 EM
 2020-09-30 ARG A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG K:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG M:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG N:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG O:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG P:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG Q:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG R:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7bg0 1 P0AEX9,P10997 86.11 1e-14 X-RAY
 2021-08-04 ARG A:382 A:407 54.0 0.24 H -65.9 -39.3 54.0 0.24 0.0
ARG B:382 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:382 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:382 E:407 54.0 0.24 H -64.9 -39.8 NA NA NA
3g7w 1 P0AEX9,P10997 100.0 6e-09 X-RAY
 2009-06-23 ARG A:382 A:381 89.0 0.396 G -71.8 -14.1 89.0 0.396 0.0 GLC
SO4
SO4
SO4
GOL
HOH
 6.784
4.970
9.870
2.950
3.220
2.818
 NH2
N
N
NE
NH2
NH1
 O4
O2
O1
O3
O2
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p10997-f1 1 P10997 100.0 1e-61 ARG A:44 A:44 175.0 0.778 H -63.4 -36.2