Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr12 | 50453627 | . | A | C | CCDS8796.1:NM_020039.3:c.448Aaa>Caa_NP_064423.2:p.150K>Q | Homo sapiens acid sensing ion channel subunit 1 (ASIC1), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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EM |
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EM |
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EM |
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| LYS | C:151 | B:151 | 116.0 | 0.58 | -104.5 | 158.2 | 116.0 | 0.58 | 0.0 | ||||||||||||||
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EM |
2020-03-11 | LYS | A:151 | A:151 | 45.0 | NA | -113.1 | 155.7 | 45.0 | NA | NA | |||||||
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| LYS | C:151 | B:151 | 45.0 | NA | -113.1 | 155.7 | 45.0 | NA | NA | ||||||||||||||
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EM |
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EM |
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X-RAY |
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X-RAY |
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O |
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O |
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CE |
O |
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CE |
O |
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HOH |
9.581 |
CG |
O |
||||||||||
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GOL HOH |
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O CB |
O1 O |
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NZ |
O |
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NZ |
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HOH |
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CG |
O |
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X-RAY |
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X-RAY |
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X-RAY |
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X-RAY |
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X-RAY |
2018-08-08 | LYS | A:127 | A:151 | 50.0 | NA | -122.3 | 159.7 | 50.0 | NA | NA | |||||||
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X-RAY |
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NZ |
O |
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NZ |
O |
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HOH |
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CB |
O |
||||||||||
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NZ |
O |
|||
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O |
||||||||||
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X-RAY |
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AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p78348-f1 | 1 | P78348 | 91.99 | 0.0 | LYS | A:150 | A:150 | 144.0 | 0.72 | -96.1 | 158.3 | ||