Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr12 | 69203020 | . | C | A | CCDS8986.2:NM_002392.5:c.47aCt>aAt_NP_002383.2:p.16T>N | Homo sapiens MDM2 proto-oncogene (MDM2), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5swk | 1 | Q00987 | 99.34 | 3e-105 |
X-RAY |
2017-10-18 | THR | A:13 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:13 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2lzg | 1 | Q00987 | 100.0 | 2e-86 |
NMR |
2012-11-07 | THR | A:10 | A:10 | 140.0 | 1.0 | S | -119.5 | -54.0 | 140.0 | 1.0 | 0.0 | ||||||
| 5j7f | 1 | Q00987 | 100.0 | 2e-86 |
X-RAY |
2017-05-17 | THR | A:10 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:10 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | C:10 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | D:10 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4hbm | 1 | Q00987 | 100.0 | 5e-82 |
X-RAY |
2012-10-17 | THR | A:5 | A:10 | 95.0 | 0.679 | -152.0 | 157.2 | 95.0 | 0.679 | 0.0 |
HOH |
2.791 |
OG1 |
O |
|||
| THR | B:5 | B:10 | 99.0 | 0.707 | -148.0 | 143.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | C:5 | C:10 | 103.0 | 0.736 | -132.6 | 166.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | D:5 | D:10 | 95.0 | 0.679 | -142.3 | 163.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | E:5 | E:10 | 89.0 | 0.636 | -143.2 | 164.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | F:5 | F:10 | 91.0 | 0.65 | -143.6 | 160.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | G:5 | G:10 | 92.0 | 0.657 | -135.2 | 162.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | H:5 | H:10 | 93.0 | 0.664 | -142.8 | 150.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5wts | 2 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2017-12-20 | THR | B:7 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6aaw | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-07-24 | THR | A:7 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6im9 | 2 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-03-20 | THR | B:7 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6kzu | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-10-16 | THR | A:7 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4umn | 1 | Q00987 | 99.17 | 6e-81 |
X-RAY |
2014-05-28 | THR | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5xxk | 1 | Q00987 | 99.17 | 1e-80 |
X-RAY |
2017-12-27 | THR | A:7 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:7 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5trf | 1 | Q00987 | 100.0 | 1e-73 |
X-RAY |
2016-11-09 | THR | A:1 | A:10 | 127.0 | 0.907 | 360.0 | 115.5 | 127.0 | 0.907 | 0.0 |
HOH |
7.061 |
C |
O |
|||
| THR | B:1 | B:10 | 152.0 | 1.0 | 360.0 | 121.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | C:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | D:1 | D:10 | 119.0 | 0.85 | 360.0 | 112.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | E:1 | E:10 | 196.0 | 1.0 | 360.0 | -98.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2mps | 1 | Q00987 | 100.0 | 8e-73 |
NMR |
2015-06-03 | THR | A:8 | A:10 | 132.0 | 0.943 | -82.2 | 82.3 | 132.0 | 0.943 | 0.0 | |||||||
| 4ode | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | THR | A:5 | A:10 | 72.0 | 0.514 | S | -138.8 | 175.5 | 72.0 | 0.514 | 0.0 |
2U0 HOH |
8.075 2.704 |
O OG1 |
C29 O |
||
| 4odf | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | THR | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4ogn | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | THR | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4ogt | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | THR | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4wt2 | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-12-03 | THR | A:5 | A:10 | 71.0 | 0.507 | E | -140.1 | 176.5 | 71.0 | 0.507 | 0.0 |
3UD HOH |
7.939 2.765 |
O OG1 |
C15 O |
||
| 2ruh | 1 | Q00987 | 98.98 | 2e-64 |
NMR |
2014-10-15 | THR | A:28 | A:16 | 142.0 | 1.0 | -64.6 | 152.4 | 142.0 | 1.0 | 0.0 | |||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q00987-f1 | 1 | Q00987 | 100.0 | 0.0 | THR | A:10 | A:10 | 131.0 | 0.936 | -87.3 | 143.9 | ||