Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr12 | 69218161 | . | C | A | CCDS8986.2:NM_002392.5:c.377aCa>aAa_NP_002383.2:p.126T>K | Homo sapiens MDM2 proto-oncogene (MDM2), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5swk | 1 | Q00987 | 99.34 | 3e-105 |
X-RAY |
2017-10-18 | THR | A:123 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:123 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2lzg | 1 | Q00987 | 100.0 | 2e-86 |
NMR |
2012-11-07 | THR | A:120 | A:120 | 125.0 | 0.893 | -140.0 | 112.8 | 125.0 | 0.893 | 0.0 | |||||||
| 5j7f | 1 | Q00987 | 100.0 | 2e-86 |
X-RAY |
2017-05-17 | THR | A:120 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:120 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | C:120 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | D:120 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4hbm | 1 | Q00987 | 100.0 | 5e-82 |
X-RAY |
2012-10-17 | THR | A:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | C:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | D:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | E:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | F:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | G:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | H:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5wts | 2 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2017-12-20 | THR | B:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6aaw | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-07-24 | THR | A:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6im9 | 2 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-03-20 | THR | B:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6kzu | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-10-16 | THR | A:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4umn | 1 | Q00987 | 99.17 | 6e-81 |
X-RAY |
2014-05-28 | THR | A:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5xxk | 1 | Q00987 | 99.17 | 1e-80 |
X-RAY |
2017-12-27 | THR | A:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2axi | 1 | Q9UMT8 | 98.21 | 3e-74 |
X-RAY |
2006-03-21 | THR | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2m86 | 2 | Q00987 | 100.0 | 3e-73 |
NMR |
2013-07-31 | THR | B:124 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1ycr | 1 | Q00987 | 100.0 | 3e-73 |
X-RAY |
1997-11-19 | THR | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7aye | 1 | Q00987 | 100.0 | 3e-73 |
X-RAY |
2021-08-18 | THR | A:107 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1t4f | 1 | Q00987 | 100.0 | 4e-73 |
X-RAY |
2005-02-08 | THR | A:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2gv2 | 1 | Q9UMT8 | 100.0 | 4e-73 |
X-RAY |
2006-09-05 | THR | A:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3jzr | 1 | Q00987 | 100.0 | 4e-73 |
X-RAY |
2009-11-10 | THR | A:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7na2 | 1 | Q00987 | 100.0 | 4e-73 |
X-RAY |
2021-11-10 | THR | A:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7na3 | 1 | Q00987 | 100.0 | 4e-73 |
X-RAY |
2021-11-10 | THR | A:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7na4 | 1 | Q00987 | 100.0 | 4e-73 |
X-RAY |
2021-11-10 | THR | A:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3g03 | 1 | Q00987 | 100.0 | 1e-72 |
X-RAY |
2009-04-14 | THR | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5j7g | 1 | Q00987 | 100.0 | 1e-72 |
X-RAY |
2017-05-17 | THR | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | D:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3tu1 | 1 | Q00987 | 100.0 | 1e-72 |
X-RAY |
2011-11-02 | THR | A:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4hfz | 1 | Q00987 | 98.17 | 7e-72 |
X-RAY |
2013-07-31 | THR | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5hmk | 1 | Q00987 | 98.17 | 9e-72 |
X-RAY |
2016-04-06 | THR | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7na1 | 1 | Q00987 | 98.17 | 9e-72 |
X-RAY |
2021-11-10 | THR | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7bj0 | 1 | Q00987 | 95.61 | 1e-63 |
X-RAY |
2021-04-07 | THR | A:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4ud7 | 1 | Q00987 | 94.74 | 7e-63 |
X-RAY |
2016-01-13 | THR | A:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | C:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | D:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4ue1 | 1 | Q00987 | 94.74 | 7e-63 |
X-RAY |
2016-01-13 | THR | A:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| THR | B:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | C:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| THR | D:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7bit | 1 | Q00987 | 94.74 | 7e-63 |
X-RAY |
2021-04-07 | THR | A:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q00987-f1 | 1 | Q00987 | 100.0 | 0.0 | THR | A:120 | A:120 | 142.0 | 1.0 | -103.7 | 123.9 | ||