Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr12 6976735 . C A CCDS53740.1:NM_001159287.1:c.116gCg>gAg_NP_001152759.1:p.39A>E Homo sapiens triosephosphate isomerase 1 (TPI1), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6up1 1 P60174 100.0 0.0 X-RAY
 2020-07-01 ALA A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6up5 1 P60174 100.0 0.0 X-RAY
 2020-07-01 ALA A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4poc 1 P60174 100.0 0.0 X-RAY
 2015-01-14 ALA A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6c2g 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2018-03-21 ALA A:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4pod 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2015-01-14 ALA A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1wyi 1 P60174 100.0 0.0 X-RAY
 2005-04-12 ALA A:3 A:1 120.0 1.0 360.0 79.3 120.0 1.0 0.0 HOH
 3.198
 O
 O
ALA B:3 B:1 98.0 0.852 360.0 103.7 98.0 0.852 0.0 HOH
 2.690
 O
 O
2jk2 1 P60174 100.0 0.0 X-RAY
 2008-07-01 ALA A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6up8 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2020-07-01 ALA A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6upf 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2020-07-01 ALA A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1hti 1 P60174 100.0 0.0 X-RAY
 1995-01-26 ALA A:1 A:1 136.0 1.0 360.0 144.4 136.0 1.0 0.0
ALA B:1 B:1 116.0 1.0 360.0 -177.5 116.0 1.0 0.0
4zvj 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2016-03-09 ALA A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2vom 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2008-06-17 ALA A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4unk 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2015-02-04 ALA A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4unl 1 P60174 99.6 0.0 X-RAY
 2015-02-04 ALA A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1r2r 1 P00939 98.39 0.0 X-RAY
 2003-12-23 ALA A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1r2s 1 P00939 98.39 0.0 X-RAY
 2003-12-23 ALA A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1r2t 1 P00939 98.39 0.0 X-RAY
 2003-12-23 ALA A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4owg 1 P00939 98.39 0.0 X-RAY
 2014-03-05 ALA A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1sw3 1 P00940 89.16 1e-162 X-RAY
 2004-08-24 ALA A:2 A:2 125.0 1.0 360.0 -46.2 125.0 1.0 0.0 HOH
 2.975
 O
 O
ALA B:2 B:2 135.0 1.0 360.0 -53.5 135.0 1.0 0.0 HOH
 7.263
 O
 O
1sw7 1 P00940 88.35 8e-162 X-RAY
 2004-08-24 ALA A:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1sw0 1 P00940 88.76 6e-161 X-RAY
 2004-08-24 ALA A:2 A:2 143.0 1.0 360.0 -61.6 143.0 1.0 0.0 HOH
 5.677
 O
 O
ALA B:2 B:2 142.0 1.0 360.0 -68.8 142.0 1.0 0.0 HOH
 4.895
 O
 O
4p61 1 P00940 88.76 2e-160 X-RAY
 2014-08-27 ALA A:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:2 B:2 143.0 1.0 360.0 -46.7 143.0 1.0 0.0 HOH
 2.961
 O
 O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p60174-f1 1 P60174 100.0 0.0 ALA A:2 A:2 73.0 0.635 -58.3 132.8