Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr13 38924057 . A C CCDS9366.1:NM_016617.2:c.1Atg>Ctg_NP_057701.1:p.1M>L Homo sapiens ubiquitin fold modifier 1 (UFM1), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
5ia7 1 P61960 100.0 4e-56 X-RAY
 2017-03-08 MET A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5iaa 2 P61960 100.0 4e-56 X-RAY
 2016-09-28 MET C:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET D:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5ia8 1 E7EQ61,P61960 100.0 5e-56 X-RAY
 2017-03-08 MET A:15 A:1 83.0 0.449 -80.7 155.0 83.0 0.449 0.0 HOH
 3.118
 N
 O
MET B:15 B:1 145.0 0.784 -75.0 164.1 NA NA NA
6h77 2 P61960 100.0 9e-52 X-RAY
 2018-10-31 MET E:1 Q:1 241.0 1.0 360.0 -89.1 241.0 1.0 0.0 HOH
 6.742
 C
 O
MET F:1 R:1 169.0 0.914 360.0 -175.6 NA NA NA
MET G:1 S:1 236.0 1.0 360.0 -79.7 NA NA NA
MET H:1 T:1 232.0 1.0 360.0 -132.5 232.0 1.0 0.0 HOH
 4.446
 N
 O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p61960-f1 1 P61960 100.0 2e-58 MET A:1 A:1 206.0 1.0 360.0 122.0