Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr14 | 20822347 | . | T | A | CCDS41910.1:NM_005484.3:c.743gTt>gAt_NP_005475.2:p.248V>D | Homo sapiens poly(ADP-ribose) polymerase 2 (PARP2), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
6x0l | 2 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | VAL | B:255 | P:235 | 43.0 | 0.277 | H | -65.2 | -43.0 | 43.0 | 0.277 | 0.0 | ||||||
VAL | C:255 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6x0m | 2 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | VAL | B:255 | P:235 | 54.0 | 0.348 | H | -63.8 | -35.6 | 54.0 | 0.348 | 0.0 | ||||||
VAL | D:255 | p:235 | 41.0 | 0.265 | H | -65.1 | -37.0 | 41.0 | 0.265 | 0.0 | |||||||||||||
6x0n | 8 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | VAL | V:255 | P:235 | 41.0 | 0.265 | H | -65.3 | -43.0 | 41.0 | 0.265 | 0.0 | ||||||
VAL | W:255 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6usj | 7 | Q9UGN5 | 97.36 | 0.0 |
EM |
2020-10-14 | VAL | U:255 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
VAL | V:255 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7aeo | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-05-19 | VAL | A:161 | A:248 | 37.0 | 0.239 | H | -57.8 | -50.2 | 37.0 | 0.239 | 0.0 | ||||||
4zzx | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-12 | VAL | A:28 | A:248 | 58.0 | 0.374 | H | -62.1 | -40.2 | 58.0 | 0.374 | 0.0 |
HOH |
4.939 |
N |
O |
||
VAL | B:28 | B:248 | 40.0 | 0.258 | H | -67.5 | -39.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4zzy | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-12 | VAL | A:28 | A:248 | 42.0 | 0.271 | H | -65.2 | -49.5 | 42.0 | 0.271 | 0.0 |
HOH |
4.869 |
N |
O |
||
3kcz | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-10 | VAL | A:37 | A:248 | 54.0 | 0.348 | H | -77.2 | -34.4 | 54.0 | 0.348 | 0.0 |
HOH |
3.193 |
N |
O |
||
VAL | B:37 | B:248 | 41.0 | 0.265 | H | -72.2 | -34.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3kjd | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-17 | VAL | A:37 | A:248 | 40.0 | 0.258 | H | -70.6 | -34.6 | 40.0 | 0.258 | 0.0 |
HOH |
3.473 |
N |
O |
||
VAL | B:37 | B:248 | 39.0 | 0.252 | H | -74.6 | -27.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4pjv | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2014-09-24 | VAL | A:37 | A:248 | 51.0 | 0.329 | H | -63.9 | -33.2 | 51.0 | 0.329 | 0.0 |
HOH |
4.301 |
N |
O |
||
VAL | B:37 | B:248 | 52.0 | 0.335 | H | -65.2 | -44.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4tvj | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2015-07-08 | VAL | A:37 | A:248 | 45.0 | 0.29 | H | -74.0 | -33.2 | 45.0 | 0.29 | 0.0 |
HOH |
4.397 |
C |
O |
||
VAL | B:37 | B:248 | 42.0 | 0.271 | H | -71.7 | -36.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1gs0 | 1 | O88554 | 90.31 | 0.0 |
X-RAY |
2002-12-19 | VAL | A:18 | A:224 | 72.0 | 0.465 | H | -75.3 | -25.7 | 72.0 | 0.465 | 0.0 | ||||||
VAL | B:18 | B:224 | 77.0 | 0.497 | H | -73.7 | -27.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5dsy | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 8e-07 |
X-RAY |
2016-07-27 | VAL | A:39 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
VAL | B:39 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | C:39 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | D:39 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6tx3 | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 8e-07 |
X-RAY |
2020-02-19 | VAL | A:39 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q9ugn5-f1 | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 | VAL | A:248 | A:248 | 51.0 | 0.329 | H | -57.7 | -36.7 |