Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr14 | 20822353 | . | C | A | CCDS41910.1:NM_005484.3:c.749gCc>gAc_NP_005475.2:p.250A>D | Homo sapiens poly(ADP-ribose) polymerase 2 (PARP2), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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EM |
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ALA | C:257 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6x0m | 2 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | ALA | B:257 | P:237 | 19.0 | 0.165 | H | -65.9 | -34.9 | 19.0 | 0.165 | 0.0 | ||||||
ALA | D:257 | p:237 | 14.0 | 0.122 | H | -65.3 | -32.7 | 14.0 | 0.122 | 0.0 | |||||||||||||
6x0n | 8 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | ALA | V:257 | P:237 | 29.0 | 0.252 | H | -62.6 | -34.6 | 29.0 | 0.252 | 0.0 | ||||||
ALA | W:257 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6usj | 7 | Q9UGN5 | 97.36 | 0.0 |
EM |
2020-10-14 | ALA | U:257 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | V:257 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
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X-RAY |
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4zzx | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-12 | ALA | A:30 | A:250 | 12.0 | 0.104 | H | -60.9 | -39.3 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
2.867 |
O |
O |
||
ALA | B:30 | B:250 | 27.0 | 0.235 | H | -60.8 | -37.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4zzy | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-12 | ALA | A:30 | A:250 | 27.0 | 0.235 | H | -58.8 | -34.9 | 27.0 | 0.235 | 0.0 |
HOH |
4.015 |
CB |
O |
||
3kcz | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-10 | ALA | A:39 | A:250 | 24.0 | 0.209 | H | -72.6 | -33.0 | 24.0 | 0.209 | 0.0 |
HOH |
2.975 |
O |
O |
||
ALA | B:39 | B:250 | 24.0 | 0.209 | H | -59.7 | -38.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3kjd | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-17 | ALA | A:39 | A:250 | 23.0 | 0.2 | H | -57.4 | -39.4 | 23.0 | 0.2 | 0.0 |
HOH |
2.937 |
O |
O |
||
ALA | B:39 | B:250 | 27.0 | 0.235 | H | -64.4 | -39.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4pjv | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2014-09-24 | ALA | A:39 | A:250 | 26.0 | 0.226 | H | -60.7 | -49.4 | 26.0 | 0.226 | 0.0 |
HOH |
3.950 |
CB |
O |
||
ALA | B:39 | B:250 | 23.0 | 0.2 | H | -64.5 | -48.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4tvj | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2015-07-08 | ALA | A:39 | A:250 | 22.0 | 0.191 | H | -66.5 | -40.2 | 22.0 | 0.191 | 0.0 |
HOH |
3.670 |
CB |
O |
||
ALA | B:39 | B:250 | 21.0 | 0.183 | H | -65.2 | -35.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
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X-RAY |
2002-12-19 | THR | A:20 | A:226 | 16.0 | 0.114 | H | -47.7 | -37.0 | 16.0 | 0.114 | 0.0 | ||||||
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X-RAY |
2016-07-27 | ALA | A:41 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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X-RAY |
2020-02-19 | ALA | A:41 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q9ugn5-f1 | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 | ALA | A:250 | A:250 | 28.0 | 0.243 | H | -66.3 | -34.5 |