Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr14 | 20825913 | . | G | A | CCDS41910.1:NM_005484.3:c.1709cGg>cAg_NP_005475.2:p.570R>Q | Homo sapiens poly(ADP-ribose) polymerase 2 (PARP2), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
6x0l | 2 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | ARG | B:577 | P:557 | 46.0 | 0.204 | E | -131.4 | -41.7 | 46.0 | 0.204 | 0.0 | ||||||
ARG | C:577 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6x0m | 2 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | ARG | B:577 | P:557 | 59.0 | 0.262 | E | -129.1 | -39.0 | 59.0 | 0.262 | 0.0 | ||||||
ARG | D:577 | p:557 | 48.0 | 0.213 | E | -106.0 | -59.0 | 48.0 | 0.213 | 0.0 | |||||||||||||
6x0n | 8 | Q9UGN5 | 97.71 | 0.0 |
EM |
2020-09-16 | ARG | V:577 | P:557 | 46.0 | 0.204 | E | -131.4 | -41.7 | 46.0 | 0.204 | 0.0 | ||||||
ARG | W:577 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6usj | 7 | Q9UGN5 | 97.36 | 0.0 |
EM |
2020-10-14 | ARG | U:577 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | V:577 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7aeo | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-05-19 | ARG | A:483 | A:570 | 24.0 | 0.107 | E | -111.3 | -40.4 | 24.0 | 0.107 | 0.0 | ||||||
4zzx | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-12 | ARG | A:350 | A:570 | 36.0 | 0.16 | E | -126.7 | -43.7 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
HOH |
3.564 |
CG |
O |
||
ARG | B:350 | B:570 | 25.0 | 0.111 | E | -132.5 | -42.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4zzy | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-12 | ARG | A:350 | A:570 | 28.0 | 0.124 | E | -138.2 | -43.1 | 28.0 | 0.124 | 0.0 |
HOH |
2.800 |
NE |
O |
||
3kcz | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-10 | ARG | A:359 | A:570 | 30.0 | 0.133 | E | -134.0 | -40.7 | 30.0 | 0.133 | 0.0 |
HOH |
3.456 |
NE |
O |
||
ARG | B:359 | B:570 | 22.0 | 0.098 | E | -131.0 | -38.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3kjd | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-17 | ARG | A:359 | A:570 | 22.0 | 0.098 | E | -130.1 | -37.7 | 22.0 | 0.098 | 0.0 |
HOH |
2.727 |
NE |
O |
||
ARG | B:359 | B:570 | 19.0 | 0.084 | E | -129.0 | -41.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4pjv | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2014-09-24 | ARG | A:359 | A:570 | 16.0 | 0.071 | E | -139.9 | -47.7 | 16.0 | 0.071 | 0.0 |
HOH |
4.258 |
NH2 |
O |
||
ARG | B:359 | B:570 | 12.0 | NA | E | -130.1 | -33.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4tvj | 1 | Q9UGN5 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2015-07-08 | ARG | A:359 | A:570 | 19.0 | 0.084 | E | -138.3 | -43.9 | 19.0 | 0.084 | 0.0 |
HOH |
2.523 |
NH1 |
O |
||
ARG | B:359 | B:570 | 19.0 | 0.084 | E | -122.9 | -40.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1gs0 | 1 | O88554 | 90.31 | 0.0 |
X-RAY |
2002-12-19 | ARG | A:340 | A:546 | 19.0 | 0.084 | E | -119.9 | -55.5 | 19.0 | 0.084 | 0.0 |
HOH |
7.076 |
NH1 |
O |
||
ARG | B:340 | B:546 | 20.0 | 0.089 | E | -119.5 | -58.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5dsy | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 1e-176 |
X-RAY |
2016-07-27 | ARG | A:267 | A:557 | 27.0 | 0.12 | E | -134.1 | -42.6 | 27.0 | 0.12 | 0.0 |
HOH |
6.875 |
N |
O |
||
ARG | B:267 | B:557 | 39.0 | 0.173 | E | -132.0 | -43.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | C:267 | C:557 | 30.0 | 0.133 | E | -133.4 | -44.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:267 | D:557 | 29.0 | 0.129 | E | -130.4 | -43.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6tx3 | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 1e-176 |
X-RAY |
2020-02-19 | ARG | A:267 | B:557 | 43.0 | 0.191 | E | -130.4 | -42.6 | 43.0 | 0.191 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q9ugn5-f1 | 1 | Q9UGN5 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:570 | A:570 | 35.0 | 0.156 | E | -125.2 | -42.6 |