Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr14 | 55408408 | . | C | A | CCDS9721.1:NM_007086.3:c.3190Gtg>Ttg_NP_009017.1:p.1064V>L | Homo sapiens WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 (WDHD1), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 7pfo | 17 | O75717 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-11-10 | VAL | Q:1095 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | R:1095 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | S:1095 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7plo | 15 | O75717 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-11-10 | VAL | O:1095 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | P:1095 | I:1064 | 57.0 | NA | H | -64.2 | -53.3 | 57.0 | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | Q:1095 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6xty | 12 | O75717 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2020-05-27 | VAL | L:1106 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | M:1106 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | N:1106 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-o75717-f1 | 1 | O75717 | 100.0 | 0.0 | VAL | A:1064 | A:1064 | 92.0 | 0.594 | H | -57.1 | -47.1 | |