Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr14 | 66208832 | . | A | C | CCDS9775.1:NM_178155.2:c.1432Att>Ctt_NP_835368.1:p.478I>L | Homo sapiens fucosyltransferase 8 (FUT8), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
6x5h | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-07 | ILE | A:438 | A:478 | 14.0 | 0.08 | H | -60.8 | -39.1 | 14.0 | 0.08 | 0.0 |
HOH |
3.723 |
CG2 |
O |
||
ILE | B:438 | B:478 | 15.0 | 0.086 | H | -59.9 | -40.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:438 | C:478 | 16.0 | 0.091 | H | -60.5 | -38.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:438 | D:478 | 18.0 | 0.103 | H | -62.4 | -39.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6x5r | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-07 | ILE | A:438 | A:478 | 17.0 | 0.097 | H | -60.0 | -39.9 | NA | NA | NA | ||||||
ILE | B:438 | B:478 | 17.0 | 0.097 | H | -60.8 | -40.1 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
HOH |
3.458 |
CG2 |
O |
|||||||||
6x5t | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-07 | ILE | A:438 | A:478 | 19.0 | 0.109 | H | -57.6 | -40.5 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
4.496 |
CG2 |
O |
||
ILE | B:438 | B:478 | 18.0 | 0.103 | H | -57.4 | -39.9 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
4.401 |
CD1 |
O |
|||||||||
ILE | C:438 | C:478 | 21.0 | 0.12 | H | -57.4 | -40.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:438 | D:478 | 19.0 | 0.109 | H | -57.1 | -40.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:438 | E:478 | 19.0 | 0.109 | H | -57.0 | -40.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | F:438 | F:478 | 22.0 | 0.126 | H | -57.7 | -41.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | G:438 | G:478 | 19.0 | 0.109 | H | -57.2 | -40.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | H:438 | H:478 | 20.0 | 0.114 | H | -57.2 | -40.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6x5u | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-07 | ILE | A:438 | A:478 | 16.0 | 0.091 | H | -63.5 | -34.6 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
3.973 |
CG2 |
O |
||
ILE | B:438 | B:478 | 17.0 | 0.097 | H | -63.8 | -33.9 | 17.0 | 0.097 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | C:438 | C:478 | 16.0 | 0.091 | H | -64.4 | -33.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:438 | D:478 | 13.0 | 0.074 | H | -64.5 | -34.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:438 | E:478 | 18.0 | 0.103 | H | -63.6 | -34.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | F:438 | F:478 | 18.0 | 0.103 | H | -63.5 | -33.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | G:438 | G:478 | 16.0 | 0.091 | H | -63.7 | -33.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | H:438 | H:478 | 15.0 | 0.086 | H | -64.2 | -33.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2de0 | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-26 | ILE | A:416 | X:478 | 19.0 | 0.109 | H | -67.9 | -43.2 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
6.441 |
C |
O |
||
6vlf | 1 | Q9WTS2 | 96.07 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-26 | ILE | A:446 | A:478 | 14.0 | 0.08 | H | -61.3 | -38.3 | 14.0 | 0.08 | 0.0 |
HOH |
3.671 |
CG2 |
O |
||
ILE | B:446 | B:478 | 15.0 | 0.086 | H | -62.8 | -37.0 | 15.0 | 0.086 | 0.0 |
EDO HOH |
4.104 3.799 |
CG2 CG2 |
O2 O |
|||||||||
6vlg | 1 | Q9WTS2 | 96.07 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-26 | ILE | A:446 | A:478 | 15.0 | 0.086 | H | -61.1 | -37.5 | NA | NA | NA | ||||||
ILE | B:446 | B:478 | 15.0 | 0.086 | H | -57.9 | -38.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:446 | C:478 | 17.0 | 0.097 | H | -57.5 | -40.2 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
HOH |
3.557 |
CG2 |
O |
|||||||||
ILE | D:446 | D:478 | 19.0 | 0.109 | H | -55.7 | -38.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6vld | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-26 | ILE | A:374 | A:478 | 18.0 | 0.103 | H | -59.6 | -38.9 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
3.633 |
CG2 |
O |
||
ILE | B:374 | B:478 | 16.0 | 0.091 | H | -59.0 | -37.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:374 | G:478 | 13.0 | 0.074 | H | -59.5 | -34.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:374 | H:478 | 14.0 | 0.08 | H | -59.5 | -39.3 | 14.0 | 0.08 | 0.0 |
HOH |
3.668 |
CG2 |
O |
|||||||||
6vle | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-26 | ILE | A:374 | A:478 | 17.0 | 0.097 | H | -62.7 | -36.9 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
HOH |
3.566 |
CG2 |
O |
||
ILE | B:374 | B:478 | 19.0 | 0.109 | H | -62.2 | -32.6 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
3.680 |
CG2 |
O |
|||||||||
6tkv | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-01-29 | ILE | A:372 | A:478 | 19.0 | 0.109 | H | -60.6 | -44.3 | NA | NA | NA | ||||||
6x5s | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-07 | ILE | A:371 | A:478 | 20.0 | 0.114 | H | -62.7 | -36.1 | 20.0 | 0.114 | 0.0 |
HOH |
7.520 |
O |
O |
||
ILE | B:371 | B:478 | 18.0 | 0.103 | H | -61.2 | -34.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6tkv | 2 | Q9BYC5 | 96.79 | 0.0 |
X-RAY |
2020-01-29 | ILE | B:356 | B:478 | 17.0 | 0.097 | H | -66.3 | -41.7 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
GOL HOH |
8.508 3.556 |
O CG2 |
C2 O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q9byc5-f1 | 1 | Q9BYC5 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:478 | A:478 | 16.0 | 0.091 | H | -61.5 | -40.7 |