Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr15 100185798 . G A CCDS45362.1:NM_005587.2:c.87atG>atA_NP_005578.2:p.29M>I Homo sapiens myocyte enhancer factor 2A (MEF2A), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
5f28 1 Q8CFN5 96.84 5e-62 X-RAY
 2016-07-13 MET A:29 A:29 37.0 0.2 H -66.7 -41.7 0.0 0.0 0.2 B:Q8CFN5:0.2
 HOH
 8.237
 N
 O
MET B:29 B:29 34.0 0.184 H -63.0 -34.2 0.0 0.0 0.184 A:Q8CFN5:0.184
 HOH
 9.757
 O
 O
MET C:29 C:29 38.0 0.205 H -71.3 -37.3 NA NA NA
MET D:29 D:29 34.0 0.184 H -65.1 -35.0 NA NA NA
6byy 1 Q02078,Q02080 92.63 5e-60 X-RAY
 2018-01-31 MET A:29 A:29 37.0 0.2 H -66.3 -38.4 1.0 0.005 0.195 B:Q02078+Q02080:0.195
 DA
DT
HOH
 7.933
7.701
5.710
 C
N
SD
 OP1
OP2
O
MET B:29 B:29 36.0 0.195 H -67.0 -33.7 1.0 0.005 0.19 A:Q02078+Q02080:0.189
 DA
DT
1PG
HOH
 7.933
7.623
7.443
3.257
 C
N
CE
SD
 OP1
OP2
C10
O
MET C:29 C:29 33.0 0.178 H -65.1 -46.8 NA NA NA
MET D:29 D:29 40.0 0.216 H -61.3 -41.1 NA NA NA
6wc2 1 Q02078,Q02080 92.63 5e-60 X-RAY
 2020-07-22 MET A:29 A:29 32.0 0.173 H -65.3 -36.4 0.0 0.0 0.173 B:Q02078+Q02080:0.173
 DA
DT
HOH
 7.987
7.689
3.345
 C
N
SD
 OP1
OP2
O
MET B:29 B:29 32.0 0.173 H -62.9 -38.3 0.0 0.0 0.173 A:Q02078+Q02080:0.173
 DT
DA
HOH
 8.027
7.561
6.145
 C
N
N
 OP1
OP2
O
MET C:29 C:29 34.0 0.184 H -65.2 -35.3 NA NA NA
MET D:29 D:29 32.0 0.173 H -65.0 -35.4 NA NA NA
MET I:29 I:29 41.0 0.222 H -66.9 -34.9 NA NA NA
MET J:29 J:29 33.0 0.178 H -64.9 -36.4 NA NA NA
3kov 1 Q02078 100.0 2e-59 X-RAY
 2010-02-16 MET A:28 A:29 38.0 0.205 H -64.9 -38.7 1.0 0.005 0.2 B:Q02078:0.2
 DA
DT
DA
DT
 8.436
8.511
8.039
7.257
 C
N
C
N
 OP1
OP2
OP1
OP1
MET B:28 B:29 38.0 0.205 H -57.5 -38.0 1.0 0.005 0.2 A:Q02078:0.2
 DA
DT
DA
DT
 8.485
8.106
8.032
7.908
 C
N
C
N
 OP1
OP2
C5'
OP1
MET C:28 I:29 37.0 0.2 H -61.5 -37.5 NA NA NA
MET D:28 J:29 38.0 0.205 H -61.6 -35.8 NA NA NA
3p57 1 Q02078 100.0 2e-59 X-RAY
 2011-08-10 MET A:28 A:29 36.0 0.195 H -62.1 -35.0 0.0 0.0 0.195 B:Q02078:0.195
 DA
DT
HOH
 7.906
7.882
3.497
 C
N
SD
 OP1
OP2
O
MET B:28 B:29 39.0 0.211 H -58.7 -39.0 0.0 0.0 0.211 A:Q02078:0.211
 DA
DT
HOH
 7.789
7.717
5.442
 C
N
SD
 OP1
OP2
O
MET C:28 C:29 38.0 0.205 H -68.4 -38.4 1.0 0.005 0.2 D:Q02078:0.2
 DA
DT
HOH
 7.943
7.727
6.184
 C
N
N
 OP1
OP2
O
MET D:28 D:29 40.0 0.216 H -69.3 -35.4 3.0 0.016 0.2 C:Q02078:0.2
 DA
DT
HOH
 7.835
7.617
6.277
 C
N
N
 OP1
OP2
O
MET E:28 I:29 39.0 0.211 H -64.7 -32.1 1.0 0.005 0.206 F:Q02078:0.205
 DA
DA
DT
HOH
 9.901
7.933
7.698
6.192
 SD
C
N
N
 O5'
OP1
OP2
O
MET F:28 J:29 40.0 0.216 H -70.4 -38.9 4.0 0.022 0.194 E:Q02078:0.195
 DA
DT
HOH
 7.792
7.421
5.971
 C
N
N
 OP1
OP2
O
6bz1 1 Q02078,Q02080 91.58 1e-58 X-RAY
 2018-02-07 MET A:29 C:29 41.0 0.222 H -65.4 -39.5 4.0 0.022 0.2 B:Q02078+Q02080:0.2
 DA
DT
 8.081
7.764
 C
N
 OP1
OP2
MET B:29 D:29 42.0 0.227 H -65.2 -39.8 4.0 0.022 0.205 A:Q02078+Q02080:0.205
 DA
DT
 8.196
7.874
 C
N
 OP1
OP1
MET E:29 A:29 39.0 0.211 H -65.3 -39.7 NA NA NA
MET F:29 B:29 37.0 0.2 H -64.7 -40.1 NA NA NA
1tqe 3 Q02080 85.71 2e-53 X-RAY
 2004-12-21 MET E:29 P:29 31.0 0.168 H -56.0 -34.4 0.0 0.0 0.168 F:Q02080:0.168
 DA
DT
 8.088
8.057
 C
N
 OP1
OP1
MET F:29 Q:29 32.0 0.173 H -55.0 -33.9 0.0 0.0 0.173 E:Q02080:0.173
 DA
DT
 8.359
7.997
 C
N
 OP1
OP2
MET H:29 R:29 31.0 0.168 H -55.0 -34.4 NA NA NA
MET I:29 S:29 32.0 0.173 H -54.6 -34.7 NA NA NA
6c9l 1 Q02080 85.71 2e-53 X-RAY
 2018-02-07 MET A:29 A:29 38.0 0.205 H -63.8 -41.1 1.0 0.005 0.2 B:Q02080:0.2
 HOH
 6.424
 N
 O
MET B:29 B:29 53.0 0.286 H -64.0 -40.7 10.0 0.054 0.232 A:Q02080:0.232
 HOH
 4.336
 CE
 O
MET C:29 C:29 36.0 0.195 H -64.2 -40.5 NA NA NA
MET D:29 D:29 38.0 0.205 H -64.5 -40.5 NA NA NA
MET E:29 E:29 35.0 0.189 H -63.9 -41.3 NA NA NA
MET F:29 F:29 46.0 0.249 H -63.7 -41.2 NA NA NA
6wc5 1 Q02080 85.56 1e-52 X-RAY
 2020-07-22 MET A:28 A:29 40.0 0.216 H -64.4 -38.1 1.0 0.005 0.211 B:Q02080:0.211
 DA
DT
HOH
 7.947
7.899
8.666
 C
N
O
 OP1
OP2
O
MET B:28 B:29 43.0 0.232 H -63.9 -38.3 3.0 0.016 0.216 A:Q02080:0.216
 DT
DA
HOH
 7.884
7.537
6.513
 C
N
N
 OP1
OP2
O
MET C:28 C:29 40.0 0.216 H -63.3 -38.9 NA NA NA
MET D:28 D:29 41.0 0.222 H -63.7 -38.6 NA NA NA
1n6j 3 Q02080 85.56 1e-52 X-RAY
 2003-11-11 MET C:28 A:29 44.0 0.238 H -65.1 -42.7 3.0 0.016 0.222 D:Q02080:0.222
 DA
DT
HOH
 8.094
8.014
3.968
 C
N
CE
 OP1
OP2
O
MET D:28 B:29 46.0 0.249 H -64.4 -42.7 4.0 0.022 0.227 C:Q02080:0.227
 DA
DT
HOH
 8.010
7.716
4.229
 C
N
CE
 OP1
OP2
O
1egw 3 Q02078 100.0 6e-50 X-RAY
 2000-03-20 MET E:28 A:29 41.0 0.222 H -68.7 -33.2 41.0 0.222 0.0 DT
DT
DA
DT
HOH
 7.889
7.761
7.912
7.791
3.310
 C
N
C
N
CE
 OP1
OP2
OP1
OP2
O
MET F:28 B:29 38.0 0.205 H -68.4 -34.4 38.0 0.205 0.0 DT
DT
DA
DT
HOH
 7.932
7.794
7.826
7.633
3.364
 C
N
C
N
CE
 OP1
OP2
OP1
OP2
O
MET G:28 C:29 40.0 0.216 H -67.4 -33.9 NA NA NA
MET H:28 D:29 39.0 0.211 H -66.8 -34.8 NA NA NA
3mu6 1 Q02078 98.59 1e-43 X-RAY
 2011-11-02 MET A:28 A:29 43.0 0.232 H -68.4 -39.6 43.0 0.232 0.0 DT
DT
 7.967
7.862
 C
N
 OP1
OP2
MET B:28 B:29 45.0 0.243 H -65.9 -39.5 45.0 0.243 0.0 DA
DT
 7.997
7.738
 C
N
 OP1
OP2
MET E:28 C:29 44.0 0.238 H -67.4 -39.3 NA NA NA
MET F:28 D:29 44.0 0.238 H -66.5 -39.6 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q02078-f1 1 Q02078 98.42 0.0 MET A:29 A:29 28.0 0.151 H -60.4 -40.7