Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr15 | 63634275 | . | A | C | CCDS10185.1:NM_001218.3:c.451Tca>Gca_NP_001209.1:p.151S>A | Homo sapiens carbonic anhydrase XII (CA12), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1jcz | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2001-08-17 | SER | A:123 | A:125 | 35.0 | 0.304 | T | -77.6 | -9.9 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.587 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:125 | 35.0 | 0.304 | T | -79.1 | -9.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.669 |
OG |
O |
|||||||||
1jd0 | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2001-08-17 | SER | A:123 | A:125 | 35.0 | 0.304 | T | -77.4 | -11.0 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.645 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:125 | 37.0 | 0.322 | T | -79.6 | -10.3 | 37.0 | 0.322 | 0.0 |
HOH |
2.707 |
OG |
O |
|||||||||
6qn0 | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-26 | SER | A:123 | A:125 | 35.0 | 0.304 | T | -76.5 | -12.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.676 |
O |
O |
||
SER | B:123 | B:125 | 36.0 | 0.313 | T | -81.2 | -17.2 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.500 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:125 | 36.0 | 0.313 | T | -74.7 | -9.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:125 | 36.0 | 0.313 | T | -74.4 | -16.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6qng | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-04 | SER | A:123 | A:125 | 36.0 | 0.313 | T | -80.2 | -12.8 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.495 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:125 | 36.0 | 0.313 | T | -79.0 | -16.1 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.677 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:125 | 36.0 | 0.313 | T | -81.6 | -17.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:125 | 35.0 | 0.304 | T | -81.1 | -17.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6qnl | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-04 | SER | A:123 | A:125 | 35.0 | 0.304 | T | -81.8 | -15.8 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.638 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:125 | 36.0 | 0.313 | T | -84.0 | -11.6 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.487 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:125 | 38.0 | 0.33 | T | -80.9 | -12.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:125 | 37.0 | 0.322 | T | -81.9 | -16.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4ht2 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-04-10 | SER | A:123 | A:123 | 33.0 | 0.287 | T | -88.4 | -10.8 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
HOH |
2.894 |
O |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -84.0 | -17.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | C:123 | C:123 | 35.0 | 0.304 | T | -86.6 | -10.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 33.0 | 0.287 | T | -85.2 | -5.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4kp5 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-11-06 | SER | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.304 | T | -82.5 | -11.2 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.710 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -72.8 | -13.8 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.644 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 37.0 | 0.322 | T | -83.2 | -15.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -75.6 | -11.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4kp8 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-11-06 | SER | A:123 | A:123 | 36.0 | 0.313 | T | -90.8 | -12.6 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.882 |
O |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -78.9 | -11.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.705 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 36.0 | 0.313 | T | -86.9 | -6.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 33.0 | 0.287 | T | -83.5 | -5.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4q0l | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-01-28 | SER | A:123 | A:123 | 16.0 | 0.139 | T | -92.7 | 4.3 | 16.0 | 0.139 | 0.0 |
HOH |
3.906 |
O |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 39.0 | 0.339 | T | -93.2 | 5.3 | 39.0 | 0.339 | 0.0 |
HOH |
3.519 |
CB |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 17.0 | 0.148 | T | -92.7 | -0.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 45.0 | 0.391 | T | -91.2 | -5.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4qj0 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-15 | SER | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.304 | T | -88.4 | -13.0 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
5.571 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 33.0 | 0.287 | T | -76.0 | -22.2 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
HOH |
3.765 |
CB |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 36.0 | 0.313 | T | -84.1 | -19.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -83.1 | -4.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4qjo | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-15 | SER | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.304 | T | -81.7 | -13.2 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.724 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 36.0 | 0.313 | T | -84.0 | -12.7 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.821 |
O |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 33.0 | 0.287 | T | -89.7 | -11.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 31.0 | 0.27 | T | -77.5 | -13.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4qjw | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-15 | SER | A:123 | A:123 | 36.0 | 0.313 | T | -84.9 | -17.7 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
3.905 |
CB |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 36.0 | 0.313 | T | -82.6 | -12.0 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
EDO HOH |
9.696 2.593 |
CB OG |
O1 O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 35.0 | 0.304 | T | -88.5 | -8.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 34.0 | 0.296 | T | -81.8 | -5.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4ww8 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-07-01 | SER | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.304 | T | -85.6 | -10.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
EDO HOH |
9.575 2.694 |
CB OG |
O2 O |
||
SER | B:123 | B:123 | 37.0 | 0.322 | T | -81.3 | -11.9 | 37.0 | 0.322 | 0.0 |
HOH |
2.696 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 35.0 | 0.304 | T | -82.1 | -14.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -76.9 | -8.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5ll5 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | SER | A:123 | A:123 | 36.0 | 0.313 | T | -87.5 | -12.3 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.745 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -76.9 | -13.6 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.733 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 36.0 | 0.313 | T | -85.1 | -13.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 36.0 | 0.313 | T | -81.8 | -10.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5ll9 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | SER | A:123 | A:123 | 37.0 | 0.322 | T | -85.4 | -11.6 | 37.0 | 0.322 | 0.0 |
HOH |
2.695 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 36.0 | 0.313 | T | -81.6 | -11.8 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.750 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 35.0 | 0.304 | T | -82.9 | -13.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -77.4 | -9.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5llo | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | SER | A:123 | A:123 | 37.0 | 0.322 | T | -90.3 | -14.1 | 37.0 | 0.322 | 0.0 |
HOH |
2.668 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 34.0 | 0.296 | T | -83.8 | -8.2 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
HOH |
2.646 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 21.0 | 0.183 | T | -87.8 | -8.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 35.0 | 0.304 | T | -86.0 | -8.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5llp | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | SER | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.304 | T | -80.6 | -16.0 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.713 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 33.0 | 0.287 | T | -84.0 | -13.7 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
HOH |
2.636 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 35.0 | 0.304 | T | -84.4 | -10.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 38.0 | 0.33 | T | -81.3 | -4.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5msa | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-17 | SER | A:123 | A:123 | 36.0 | 0.313 | T | -83.0 | -10.5 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
EDO HOH |
9.489 2.680 |
CB OG |
O2 O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -81.5 | -13.9 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.644 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 36.0 | 0.313 | T | -82.9 | -12.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 38.0 | 0.33 | T | -83.8 | -8.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5msb | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-17 | SER | A:123 | A:123 | 38.0 | 0.33 | T | -83.9 | -10.6 | 38.0 | 0.33 | 0.0 |
HOH |
2.703 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -84.2 | -13.9 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.663 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 38.0 | 0.33 | T | -81.9 | -11.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -81.7 | -6.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6g5l | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-03-13 | SER | A:123 | A:123 | 34.0 | 0.296 | T | -75.4 | -16.8 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
HOH |
2.692 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 34.0 | 0.296 | T | -76.8 | -16.8 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
HOH |
2.678 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 34.0 | 0.296 | T | -77.0 | -15.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 36.0 | 0.313 | T | -81.5 | -8.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6g7a | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-03-13 | SER | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.304 | T | -83.3 | -10.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.731 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -82.1 | -10.0 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.662 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 35.0 | 0.304 | T | -85.7 | -8.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 36.0 | 0.313 | T | -80.7 | -6.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6r6y | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-08 | SER | A:123 | A:123 | 34.0 | 0.296 | T | -83.4 | -14.8 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
EDO HOH |
9.544 2.751 |
CB OG |
O2 O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -84.3 | -11.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.723 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 36.0 | 0.313 | T | -84.5 | -10.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -81.3 | -8.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6r71 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-08 | SER | A:123 | A:123 | 34.0 | 0.296 | T | -82.8 | -15.8 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
HOH |
2.781 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 37.0 | 0.322 | T | -87.4 | -12.1 | 37.0 | 0.322 | 0.0 |
HOH |
2.958 |
OG |
O |
|||||||||
6t5p | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-14 | SER | A:123 | A:123 | 36.0 | 0.313 | T | -86.9 | -13.4 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.720 |
O |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 33.0 | 0.287 | T | -89.3 | -24.4 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
HOH |
4.155 |
O |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 37.0 | 0.322 | T | -86.2 | -14.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 36.0 | 0.313 | T | -80.9 | -7.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6t5q | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-14 | SER | A:123 | A:123 | 34.0 | 0.296 | T | -80.5 | -15.8 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
HOH |
2.542 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 33.0 | 0.287 | T | -87.0 | -12.7 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
HOH |
2.678 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 38.0 | 0.33 | T | -85.6 | -5.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -87.5 | -7.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7puu | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | SER | A:123 | A:123 | 36.0 | 0.313 | T | -84.0 | -15.4 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.724 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 35.0 | 0.304 | T | -80.1 | -11.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.585 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 35.0 | 0.304 | T | -85.2 | -15.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 36.0 | 0.313 | T | -80.5 | -8.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7puv | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | SER | A:123 | A:123 | 37.0 | 0.322 | T | -85.1 | -11.4 | 37.0 | 0.322 | 0.0 |
HOH |
2.648 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 36.0 | 0.313 | T | -83.1 | -6.4 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.559 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 36.0 | 0.313 | T | -82.4 | -10.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 37.0 | 0.322 | T | -83.9 | -7.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7puw | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | SER | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.304 | T | -82.4 | -13.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.716 |
OG |
O |
||
SER | B:123 | B:123 | 36.0 | 0.313 | T | -83.6 | -11.6 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
2.664 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:123 | C:123 | 36.0 | 0.313 | T | -82.8 | -16.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:123 | D:123 | 38.0 | 0.33 | T | -76.2 | -12.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6rps | 1 | O43570 | 96.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-13 | SER | A:122 | A:125 | 38.0 | 0.33 | T | -84.7 | -6.4 | 38.0 | 0.33 | 0.0 | ||||||
SER | B:122 | B:125 | 37.0 | 0.322 | T | -84.2 | -6.9 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-o43570-f1 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 | SER | A:151 | A:151 | 36.0 | 0.313 | T | -82.4 | -11.7 |