Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr15 63634275 . A C CCDS10185.1:NM_001218.3:c.451Tca>Gca_NP_001209.1:p.151S>A Homo sapiens carbonic anhydrase XII (CA12), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1jcz 1 O43570 99.62 0.0 X-RAY
2001-08-17 SER A:123 A:125 35.0 0.304 T -77.6 -9.9 35.0 0.304 0.0 HOH
2.587
OG
O
SER B:123 B:125 35.0 0.304 T -79.1 -9.7 35.0 0.304 0.0 HOH
2.669
OG
O
1jd0 1 O43570 99.62 0.0 X-RAY
2001-08-17 SER A:123 A:125 35.0 0.304 T -77.4 -11.0 35.0 0.304 0.0 HOH
2.645
OG
O
SER B:123 B:125 37.0 0.322 T -79.6 -10.3 37.0 0.322 0.0 HOH
2.707
OG
O
6qn0 1 O43570 99.62 0.0 X-RAY
2020-02-26 SER A:123 A:125 35.0 0.304 T -76.5 -12.7 35.0 0.304 0.0 HOH
2.676
O
O
SER B:123 B:125 36.0 0.313 T -81.2 -17.2 36.0 0.313 0.0 HOH
2.500
OG
O
SER C:123 C:125 36.0 0.313 T -74.7 -9.7 NA NA NA
SER D:123 D:125 36.0 0.313 T -74.4 -16.7 NA NA NA
6qng 1 O43570 99.62 0.0 X-RAY
2020-03-04 SER A:123 A:125 36.0 0.313 T -80.2 -12.8 36.0 0.313 0.0 HOH
2.495
OG
O
SER B:123 B:125 36.0 0.313 T -79.0 -16.1 36.0 0.313 0.0 HOH
2.677
OG
O
SER C:123 C:125 36.0 0.313 T -81.6 -17.4 NA NA NA
SER D:123 D:125 35.0 0.304 T -81.1 -17.4 NA NA NA
6qnl 1 O43570 99.62 0.0 X-RAY
2020-03-04 SER A:123 A:125 35.0 0.304 T -81.8 -15.8 35.0 0.304 0.0 HOH
2.638
OG
O
SER B:123 B:125 36.0 0.313 T -84.0 -11.6 36.0 0.313 0.0 HOH
2.487
OG
O
SER C:123 C:125 38.0 0.33 T -80.9 -12.2 NA NA NA
SER D:123 D:125 37.0 0.322 T -81.9 -16.1 NA NA NA
4ht2 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2013-04-10 SER A:123 A:123 33.0 0.287 T -88.4 -10.8 33.0 0.287 0.0 HOH
2.894
O
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -84.0 -17.4 NA NA NA
SER C:123 C:123 35.0 0.304 T -86.6 -10.1 NA NA NA
SER D:123 D:123 33.0 0.287 T -85.2 -5.2 NA NA NA
4kp5 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2013-11-06 SER A:123 A:123 35.0 0.304 T -82.5 -11.2 35.0 0.304 0.0 HOH
2.710
OG
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -72.8 -13.8 35.0 0.304 0.0 HOH
2.644
OG
O
SER C:123 C:123 37.0 0.322 T -83.2 -15.8 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -75.6 -11.0 NA NA NA
4kp8 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2013-11-06 SER A:123 A:123 36.0 0.313 T -90.8 -12.6 36.0 0.313 0.0 HOH
2.882
O
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -78.9 -11.7 35.0 0.304 0.0 HOH
2.705
OG
O
SER C:123 C:123 36.0 0.313 T -86.9 -6.3 NA NA NA
SER D:123 D:123 33.0 0.287 T -83.5 -5.9 NA NA NA
4q0l 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2015-01-28 SER A:123 A:123 16.0 0.139 T -92.7 4.3 16.0 0.139 0.0 HOH
3.906
O
O
SER B:123 B:123 39.0 0.339 T -93.2 5.3 39.0 0.339 0.0 HOH
3.519
CB
O
SER C:123 C:123 17.0 0.148 T -92.7 -0.2 NA NA NA
SER D:123 D:123 45.0 0.391 T -91.2 -5.5 NA NA NA
4qj0 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2015-04-15 SER A:123 A:123 35.0 0.304 T -88.4 -13.0 35.0 0.304 0.0 HOH
5.571
OG
O
SER B:123 B:123 33.0 0.287 T -76.0 -22.2 33.0 0.287 0.0 HOH
3.765
CB
O
SER C:123 C:123 36.0 0.313 T -84.1 -19.1 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -83.1 -4.6 NA NA NA
4qjo 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2015-04-15 SER A:123 A:123 35.0 0.304 T -81.7 -13.2 35.0 0.304 0.0 HOH
2.724
OG
O
SER B:123 B:123 36.0 0.313 T -84.0 -12.7 36.0 0.313 0.0 HOH
2.821
O
O
SER C:123 C:123 33.0 0.287 T -89.7 -11.5 NA NA NA
SER D:123 D:123 31.0 0.27 T -77.5 -13.8 NA NA NA
4qjw 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2015-04-15 SER A:123 A:123 36.0 0.313 T -84.9 -17.7 36.0 0.313 0.0 HOH
3.905
CB
O
SER B:123 B:123 36.0 0.313 T -82.6 -12.0 36.0 0.313 0.0 EDO
HOH
9.696
2.593
CB
OG
O1
O
SER C:123 C:123 35.0 0.304 T -88.5 -8.0 NA NA NA
SER D:123 D:123 34.0 0.296 T -81.8 -5.6 NA NA NA
4ww8 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2015-07-01 SER A:123 A:123 35.0 0.304 T -85.6 -10.7 35.0 0.304 0.0 EDO
HOH
9.575
2.694
CB
OG
O2
O
SER B:123 B:123 37.0 0.322 T -81.3 -11.9 37.0 0.322 0.0 HOH
2.696
OG
O
SER C:123 C:123 35.0 0.304 T -82.1 -14.5 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -76.9 -8.2 NA NA NA
5ll5 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2017-08-16 SER A:123 A:123 36.0 0.313 T -87.5 -12.3 36.0 0.313 0.0 HOH
2.745
OG
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -76.9 -13.6 35.0 0.304 0.0 HOH
2.733
OG
O
SER C:123 C:123 36.0 0.313 T -85.1 -13.4 NA NA NA
SER D:123 D:123 36.0 0.313 T -81.8 -10.9 NA NA NA
5ll9 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2017-08-16 SER A:123 A:123 37.0 0.322 T -85.4 -11.6 37.0 0.322 0.0 HOH
2.695
OG
O
SER B:123 B:123 36.0 0.313 T -81.6 -11.8 36.0 0.313 0.0 HOH
2.750
OG
O
SER C:123 C:123 35.0 0.304 T -82.9 -13.5 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -77.4 -9.0 NA NA NA
5llo 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2017-08-16 SER A:123 A:123 37.0 0.322 T -90.3 -14.1 37.0 0.322 0.0 HOH
2.668
OG
O
SER B:123 B:123 34.0 0.296 T -83.8 -8.2 34.0 0.296 0.0 HOH
2.646
OG
O
SER C:123 C:123 21.0 0.183 T -87.8 -8.3 NA NA NA
SER D:123 D:123 35.0 0.304 T -86.0 -8.2 NA NA NA
5llp 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2017-08-16 SER A:123 A:123 35.0 0.304 T -80.6 -16.0 35.0 0.304 0.0 HOH
2.713
OG
O
SER B:123 B:123 33.0 0.287 T -84.0 -13.7 33.0 0.287 0.0 HOH
2.636
OG
O
SER C:123 C:123 35.0 0.304 T -84.4 -10.8 NA NA NA
SER D:123 D:123 38.0 0.33 T -81.3 -4.8 NA NA NA
5msa 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2018-01-17 SER A:123 A:123 36.0 0.313 T -83.0 -10.5 36.0 0.313 0.0 EDO
HOH
9.489
2.680
CB
OG
O2
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -81.5 -13.9 35.0 0.304 0.0 HOH
2.644
OG
O
SER C:123 C:123 36.0 0.313 T -82.9 -12.6 NA NA NA
SER D:123 D:123 38.0 0.33 T -83.8 -8.0 NA NA NA
5msb 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2018-01-17 SER A:123 A:123 38.0 0.33 T -83.9 -10.6 38.0 0.33 0.0 HOH
2.703
OG
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -84.2 -13.9 35.0 0.304 0.0 HOH
2.663
OG
O
SER C:123 C:123 38.0 0.33 T -81.9 -11.8 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -81.7 -6.2 NA NA NA
6g5l 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2019-03-13 SER A:123 A:123 34.0 0.296 T -75.4 -16.8 34.0 0.296 0.0 HOH
2.692
OG
O
SER B:123 B:123 34.0 0.296 T -76.8 -16.8 34.0 0.296 0.0 HOH
2.678
OG
O
SER C:123 C:123 34.0 0.296 T -77.0 -15.2 NA NA NA
SER D:123 D:123 36.0 0.313 T -81.5 -8.6 NA NA NA
6g7a 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2019-03-13 SER A:123 A:123 35.0 0.304 T -83.3 -10.7 35.0 0.304 0.0 HOH
2.731
OG
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -82.1 -10.0 35.0 0.304 0.0 HOH
2.662
OG
O
SER C:123 C:123 35.0 0.304 T -85.7 -8.0 NA NA NA
SER D:123 D:123 36.0 0.313 T -80.7 -6.4 NA NA NA
6r6y 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2020-04-08 SER A:123 A:123 34.0 0.296 T -83.4 -14.8 34.0 0.296 0.0 EDO
HOH
9.544
2.751
CB
OG
O2
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -84.3 -11.7 35.0 0.304 0.0 HOH
2.723
OG
O
SER C:123 C:123 36.0 0.313 T -84.5 -10.2 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -81.3 -8.0 NA NA NA
6r71 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2020-04-08 SER A:123 A:123 34.0 0.296 T -82.8 -15.8 34.0 0.296 0.0 HOH
2.781
OG
O
SER B:123 B:123 37.0 0.322 T -87.4 -12.1 37.0 0.322 0.0 HOH
2.958
OG
O
6t5p 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2020-10-14 SER A:123 A:123 36.0 0.313 T -86.9 -13.4 36.0 0.313 0.0 HOH
2.720
O
O
SER B:123 B:123 33.0 0.287 T -89.3 -24.4 33.0 0.287 0.0 HOH
4.155
O
O
SER C:123 C:123 37.0 0.322 T -86.2 -14.5 NA NA NA
SER D:123 D:123 36.0 0.313 T -80.9 -7.6 NA NA NA
6t5q 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2020-10-14 SER A:123 A:123 34.0 0.296 T -80.5 -15.8 34.0 0.296 0.0 HOH
2.542
OG
O
SER B:123 B:123 33.0 0.287 T -87.0 -12.7 33.0 0.287 0.0 HOH
2.678
OG
O
SER C:123 C:123 38.0 0.33 T -85.6 -5.3 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -87.5 -7.6 NA NA NA
7puu 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2022-01-12 SER A:123 A:123 36.0 0.313 T -84.0 -15.4 36.0 0.313 0.0 HOH
2.724
OG
O
SER B:123 B:123 35.0 0.304 T -80.1 -11.7 35.0 0.304 0.0 HOH
2.585
OG
O
SER C:123 C:123 35.0 0.304 T -85.2 -15.0 NA NA NA
SER D:123 D:123 36.0 0.313 T -80.5 -8.7 NA NA NA
7puv 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2022-01-12 SER A:123 A:123 37.0 0.322 T -85.1 -11.4 37.0 0.322 0.0 HOH
2.648
OG
O
SER B:123 B:123 36.0 0.313 T -83.1 -6.4 36.0 0.313 0.0 HOH
2.559
OG
O
SER C:123 C:123 36.0 0.313 T -82.4 -10.5 NA NA NA
SER D:123 D:123 37.0 0.322 T -83.9 -7.6 NA NA NA
7puw 1 O43570 100.0 0.0 X-RAY
2022-01-12 SER A:123 A:123 35.0 0.304 T -82.4 -13.7 35.0 0.304 0.0 HOH
2.716
OG
O
SER B:123 B:123 36.0 0.313 T -83.6 -11.6 36.0 0.313 0.0 HOH
2.664
OG
O
SER C:123 C:123 36.0 0.313 T -82.8 -16.7 NA NA NA
SER D:123 D:123 38.0 0.33 T -76.2 -12.1 NA NA NA
6rps 1 O43570 96.7 0.0 X-RAY
2019-11-13 SER A:122 A:125 38.0 0.33 T -84.7 -6.4 38.0 0.33 0.0
SER B:122 B:125 37.0 0.322 T -84.2 -6.9 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-o43570-f1 1 O43570 100.0 0.0 SER A:151 A:151 36.0 0.313 T -82.4 -11.7