Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr15 | 63637723 | . | G | A | CCDS10185.1:NM_001218.3:c.382Ccg>Tcg_NP_001209.1:p.128P>S | Homo sapiens carbonic anhydrase XII (CA12), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 1jcz | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2001-08-17 | PRO | A:100 | A:102 | 32.0 | 0.221 | -75.9 | 57.0 | 28.0 | 0.193 | 0.028 |
B:O43570:0.028 |
HOH |
2.654 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:102 | 39.0 | 0.269 | -72.6 | 58.2 | 33.0 | 0.228 | 0.041 |
A:O43570:0.041 |
HOH |
2.759 |
O |
O |
|||||||||
| 1jd0 | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2001-08-17 | PRO | A:100 | A:102 | 35.0 | 0.241 | -75.8 | 55.5 | 31.0 | 0.214 | 0.027 |
B:O43570:0.028 |
HOH |
2.723 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:102 | 39.0 | 0.269 | -72.9 | 59.3 | 32.0 | 0.221 | 0.048 |
A:O43570:0.048 |
HOH |
2.761 |
O |
O |
|||||||||
| 6qn0 | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-26 | PRO | A:100 | A:102 | 25.0 | 0.172 | -82.4 | 67.1 | 25.0 | 0.172 | 0.0 |
HOH |
3.274 |
CA |
O |
|||
| PRO | B:100 | B:102 | 31.0 | 0.214 | -85.5 | 61.3 | 24.0 | 0.166 | 0.048 |
A:O43570:0.048 |
HOH |
2.769 |
O |
O |
|||||||||
| PRO | C:100 | C:102 | 26.0 | 0.179 | -82.5 | 65.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:102 | 32.0 | 0.221 | -82.7 | 65.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6qng | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-04 | PRO | A:100 | A:102 | 30.0 | 0.207 | -82.3 | 56.1 | 22.0 | 0.152 | 0.055 |
B:O43570:0.055 |
HOH |
2.608 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:102 | 28.0 | 0.193 | -83.4 | 60.0 | 21.0 | 0.145 | 0.048 |
A:O43570:0.048 |
HOH |
2.927 |
O |
O |
|||||||||
| PRO | C:100 | C:102 | 35.0 | 0.241 | -83.9 | 63.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:102 | 22.0 | 0.152 | -81.9 | 54.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6qnl | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-04 | PRO | A:100 | A:102 | 28.0 | 0.193 | -81.0 | 59.4 | 21.0 | 0.145 | 0.048 |
B:O43570:0.048 |
HOH |
2.848 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:102 | 23.0 | 0.159 | -79.7 | 66.1 | 23.0 | 0.159 | 0.0 |
HOH |
2.747 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:102 | 22.0 | 0.152 | -77.9 | 72.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:102 | 43.0 | 0.297 | -82.8 | 56.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4ht2 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-04-10 | PRO | A:100 | A:100 | 43.0 | 0.297 | -87.3 | 61.0 | 43.0 | 0.297 | 0.0 |
HOH |
2.659 |
O |
O |
|||
| PRO | B:100 | B:100 | 39.0 | 0.269 | -83.8 | 63.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 40.0 | 0.276 | -81.4 | 58.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 39.0 | 0.269 | -84.8 | 60.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4kp5 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-11-06 | PRO | A:100 | A:100 | 39.0 | 0.269 | -83.8 | 60.5 | 34.0 | 0.234 | 0.035 |
B:O43570:0.034 |
HOH |
2.923 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 24.0 | 0.166 | -79.6 | 64.7 | 24.0 | 0.166 | 0.0 |
HOH |
2.878 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 43.0 | 0.297 | -83.9 | 61.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 26.0 | 0.179 | -86.2 | 62.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4kp8 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-11-06 | PRO | A:100 | A:100 | 42.0 | 0.29 | -83.1 | 57.7 | 36.0 | 0.248 | 0.042 |
B:O43570:0.041 |
HOH |
2.641 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 31.0 | 0.214 | -87.8 | 60.3 | 24.0 | 0.166 | 0.048 |
A:O43570:0.048 |
HOH |
2.723 |
O |
O |
|||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 39.0 | 0.269 | -80.8 | 61.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 32.0 | 0.221 | -83.4 | 56.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4q0l | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-01-28 | PRO | A:100 | A:100 | 28.0 | 0.193 | -75.4 | 65.6 | 20.0 | 0.138 | 0.055 |
B:O43570:0.055 |
HOH |
3.120 |
C |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 45.0 | 0.31 | -82.6 | 63.2 | 38.0 | 0.262 | 0.048 |
A:O43570:0.048 |
HOH |
3.306 |
C |
O |
|||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 39.0 | 0.269 | -77.7 | 59.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 44.0 | 0.303 | -78.0 | 61.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4qj0 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-15 | PRO | A:100 | A:100 | 39.0 | 0.269 | -85.2 | 61.3 | 32.0 | 0.221 | 0.048 |
B:O43570:0.048 |
HOH |
2.903 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 25.0 | 0.172 | -78.8 | 65.1 | 24.0 | 0.166 | 0.006 |
A:O43570:0.007 |
HOH |
2.879 |
O |
O |
|||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 40.0 | 0.276 | -88.8 | 63.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 26.0 | 0.179 | -85.5 | 59.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4qjo | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-15 | PRO | A:100 | A:100 | 30.0 | 0.207 | -81.8 | 59.4 | 22.0 | 0.152 | 0.055 |
B:O43570:0.055 |
HOH |
2.756 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 22.0 | 0.152 | -81.5 | 64.1 | 16.0 | 0.11 | 0.042 |
A:O43570:0.041 |
HOH |
2.803 |
O |
O |
|||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 36.0 | 0.248 | -79.2 | 58.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 35.0 | 0.241 | -86.8 | 59.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4qjw | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-15 | PRO | A:100 | A:100 | 40.0 | 0.276 | -89.9 | 62.0 | 33.0 | 0.228 | 0.048 |
B:O43570:0.048 |
HOH |
2.716 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 40.0 | 0.276 | -80.0 | 64.0 | 35.0 | 0.241 | 0.035 |
A:O43570:0.034 |
HOH |
2.864 |
O |
O |
|||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 42.0 | 0.29 | -82.0 | 57.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 25.0 | 0.172 | -79.8 | 59.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4ww8 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-07-01 | PRO | A:100 | A:100 | 36.0 | 0.248 | -89.5 | 58.9 | 31.0 | 0.214 | 0.034 |
B:O43570:0.034 |
HOH |
2.881 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 24.0 | 0.166 | -79.6 | 65.6 | 24.0 | 0.166 | 0.0 |
HOH |
2.797 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 41.0 | 0.283 | -91.0 | 61.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 23.0 | 0.159 | -86.5 | 60.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5ll5 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | PRO | A:100 | A:100 | 41.0 | 0.283 | -84.4 | 59.5 | 34.0 | 0.234 | 0.049 |
B:O43570:0.048 |
HOH |
2.879 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 24.0 | 0.166 | -79.4 | 66.9 | 24.0 | 0.166 | 0.0 |
HOH |
2.800 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 36.0 | 0.248 | -88.3 | 59.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 27.0 | 0.186 | -84.2 | 61.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5ll9 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | PRO | A:100 | A:100 | 40.0 | 0.276 | -79.2 | 57.5 | 33.0 | 0.228 | 0.048 |
B:O43570:0.048 |
HOH |
2.842 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 22.0 | 0.152 | -81.2 | 66.1 | 22.0 | 0.152 | 0.0 |
HOH |
2.854 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 28.0 | 0.193 | -86.8 | 60.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 23.0 | 0.159 | -81.2 | 62.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5llo | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | PRO | A:100 | A:100 | 39.0 | 0.269 | -88.1 | 62.0 | 32.0 | 0.221 | 0.048 |
B:O43570:0.048 |
HOH |
2.980 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 25.0 | 0.172 | -82.9 | 68.6 | 25.0 | 0.172 | 0.0 |
HOH |
2.695 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 25.0 | 0.172 | -89.2 | 60.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 25.0 | 0.172 | -85.6 | 62.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5llp | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | PRO | A:100 | A:100 | 35.0 | 0.241 | -84.3 | 58.8 | 30.0 | 0.207 | 0.034 |
B:O43570:0.034 |
HOH |
2.844 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 25.0 | 0.172 | -81.2 | 66.1 | 25.0 | 0.172 | 0.0 |
HOH |
2.848 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 39.0 | 0.269 | -86.4 | 61.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 25.0 | 0.172 | -82.9 | 58.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5msa | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-17 | PRO | A:100 | A:100 | 40.0 | 0.276 | -83.8 | 62.1 | 34.0 | 0.234 | 0.042 |
B:O43570:0.041 |
HOH |
2.808 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 25.0 | 0.172 | -83.2 | 65.6 | 25.0 | 0.172 | 0.0 |
HOH |
2.759 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 30.0 | 0.207 | -88.0 | 67.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 25.0 | 0.172 | -85.0 | 63.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5msb | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-17 | PRO | A:100 | A:100 | 39.0 | 0.269 | -87.1 | 63.4 | 34.0 | 0.234 | 0.035 |
B:O43570:0.034 |
EDO HOH |
9.166 2.833 |
N O |
O1 O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 26.0 | 0.179 | -81.6 | 63.6 | 26.0 | 0.179 | 0.0 |
PEG HOH |
6.905 2.828 |
O O |
O1 O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 34.0 | 0.234 | -89.4 | 63.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 27.0 | 0.186 | -86.7 | 62.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6g5l | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-03-13 | PRO | A:100 | A:100 | 38.0 | 0.262 | -86.3 | 59.5 | 32.0 | 0.221 | 0.041 |
B:O43570:0.041 |
HOH |
2.799 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 26.0 | 0.179 | -84.8 | 66.7 | 26.0 | 0.179 | 0.0 |
HOH |
2.811 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 36.0 | 0.248 | -85.1 | 63.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 27.0 | 0.186 | -83.7 | 63.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6g7a | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-03-13 | PRO | A:100 | A:100 | 40.0 | 0.276 | -86.4 | 59.4 | 34.0 | 0.234 | 0.042 |
B:O43570:0.041 |
HOH |
2.878 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 23.0 | 0.159 | -84.1 | 69.1 | 23.0 | 0.159 | 0.0 |
HOH |
2.810 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 28.0 | 0.193 | -88.4 | 63.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 23.0 | 0.159 | -84.5 | 63.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6r6y | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-08 | PRO | A:100 | A:100 | 38.0 | 0.262 | -85.5 | 61.9 | 31.0 | 0.214 | 0.048 |
B:O43570:0.048 |
DMS HOH |
8.631 2.818 |
O O |
C1 O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 26.0 | 0.179 | -82.8 | 69.5 | 26.0 | 0.179 | 0.0 |
HOH |
2.822 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 33.0 | 0.228 | -83.7 | 62.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 26.0 | 0.179 | -82.3 | 60.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6r71 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-08 | PRO | A:100 | A:100 | 25.0 | 0.172 | -81.1 | 56.5 | 25.0 | 0.172 | 0.0 |
HOH |
2.852 |
O |
O |
|||
| PRO | B:100 | B:100 | 30.0 | 0.207 | -82.5 | 57.7 | 22.0 | 0.152 | 0.055 |
A:O43570:0.055 |
HOH |
2.897 |
O |
O |
|||||||||
| 6t5p | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-14 | PRO | A:100 | A:100 | 40.0 | 0.276 | -84.4 | 59.1 | 34.0 | 0.234 | 0.042 |
B:O43570:0.041 |
HOH |
2.805 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 26.0 | 0.179 | -81.4 | 67.9 | 26.0 | 0.179 | 0.0 |
HOH |
2.786 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 31.0 | 0.214 | -84.9 | 58.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 24.0 | 0.166 | -84.2 | 61.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6t5q | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-14 | PRO | A:100 | A:100 | 28.0 | 0.193 | -83.8 | 59.7 | 21.0 | 0.145 | 0.048 |
B:O43570:0.048 |
HOH |
2.695 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 26.0 | 0.179 | -86.0 | 55.4 | 26.0 | 0.179 | 0.0 |
HOH |
2.868 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 43.0 | 0.297 | -83.6 | 55.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 25.0 | 0.172 | -82.8 | 56.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7puu | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | PRO | A:100 | A:100 | 35.0 | 0.241 | -83.5 | 60.8 | 30.0 | 0.207 | 0.034 |
B:O43570:0.034 |
HOH |
2.882 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 23.0 | 0.159 | -82.5 | 66.5 | 23.0 | 0.159 | 0.0 |
HOH |
2.786 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 35.0 | 0.241 | -84.6 | 60.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 26.0 | 0.179 | -86.4 | 64.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7puv | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | PRO | A:100 | A:100 | 41.0 | 0.283 | -82.5 | 57.5 | 34.0 | 0.234 | 0.049 |
B:O43570:0.048 |
EDO EDO HOH |
6.280 9.102 2.864 |
C N O |
C1 O1 O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 26.0 | 0.179 | -81.7 | 66.9 | 26.0 | 0.179 | 0.0 |
HOH |
2.905 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 40.0 | 0.276 | -83.2 | 63.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 22.0 | 0.152 | -82.8 | 67.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7puw | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | PRO | A:100 | A:100 | 36.0 | 0.248 | -83.0 | 59.7 | 30.0 | 0.207 | 0.041 |
B:O43570:0.041 |
HOH |
2.833 |
O |
O |
||
| PRO | B:100 | B:100 | 23.0 | 0.159 | -82.3 | 67.5 | 23.0 | 0.159 | 0.0 |
HOH |
2.812 |
O |
O |
||||||||||
| PRO | C:100 | C:100 | 37.0 | 0.255 | -84.4 | 59.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:100 | D:100 | 24.0 | 0.166 | -84.0 | 63.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6rps | 1 | O43570 | 96.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-13 | PRO | A:99 | A:102 | 35.0 | 0.241 | -82.6 | 52.7 | 35.0 | 0.241 | 0.0 |
CD HOH |
6.529 3.443 |
N C |
CD O |
|||
| PRO | B:99 | B:102 | 47.0 | 0.324 | -82.8 | 54.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-o43570-f1 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 | PRO | A:128 | A:128 | 37.0 | 0.255 | -81.4 | 51.2 | ||