Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr15 | 63638800 | . | G | A | CCDS10185.1:NM_001218.3:c.215aCg>aTg_NP_001209.1:p.72T>M | Homo sapiens carbonic anhydrase XII (CA12), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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O |
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HOH |
2.626 |
OG1 |
O |
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| 1jd0 | 1 | O43570 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2001-08-17 | THR | A:44 | A:45 | 84.0 | 0.6 | -87.3 | 165.2 | 84.0 | 0.6 | 0.0 |
HOH |
2.643 |
OG1 |
O |
|||
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HOH |
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C |
O |
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X-RAY |
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C |
O |
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HOH |
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C |
O |
||||||||||
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X-RAY |
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N |
O |
|||
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HOH |
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OG1 |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2020-03-04 | THR | A:44 | A:45 | 79.0 | 0.564 | -83.9 | 163.1 | 79.0 | 0.564 | 0.0 |
HOH |
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C |
O |
|||
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HOH |
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OG1 |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2013-04-10 | THR | A:44 | A:44 | 81.0 | 0.579 | -102.8 | 166.4 | 81.0 | 0.579 | 0.0 |
EDO EDO HOH |
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N N C |
O1 O2 O |
|||
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X-RAY |
2013-11-06 | THR | A:44 | A:44 | 77.0 | 0.55 | -84.0 | 164.8 | 77.0 | 0.55 | 0.0 |
HOH |
3.270 |
C |
O |
|||
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EDO HOH |
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O OG1 |
C1 O |
||||||||||
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X-RAY |
2013-11-06 | THR | A:44 | A:44 | 80.0 | 0.571 | -102.1 | 164.1 | 80.0 | 0.571 | 0.0 |
HOH |
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C |
O |
|||
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HOH |
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O |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2015-01-28 | THR | A:44 | A:44 | 75.0 | 0.536 | -99.1 | 153.8 | 75.0 | 0.536 | 0.0 |
HOH |
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OG1 |
O |
|||
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HOH |
2.900 |
C |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2015-04-15 | THR | A:44 | A:44 | 85.0 | 0.607 | -83.1 | 172.3 | 85.0 | 0.607 | 0.0 |
HOH |
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C |
O |
|||
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EDO HOH |
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O OG1 |
C1 O |
||||||||||
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X-RAY |
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EDO HOH |
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C OG1 |
O1 O |
|||
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HOH |
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O |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2015-04-15 | THR | A:44 | A:44 | 78.0 | 0.557 | -88.8 | 160.3 | 78.0 | 0.557 | 0.0 |
EDO HOH |
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N C |
O1 O |
|||
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HOH |
3.049 |
N |
O |
||||||||||
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X-RAY |
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HOH |
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C |
O |
|||
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EDO HOH |
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O OG1 |
C2 O |
||||||||||
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X-RAY |
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HOH |
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OG1 |
O |
|||
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EDO HOH |
3.372 2.652 |
O OG1 |
C1 O |
||||||||||
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X-RAY |
2017-08-16 | THR | A:44 | A:44 | 78.0 | 0.557 | -78.2 | 163.9 | 78.0 | 0.557 | 0.0 |
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O OG1 |
C1 O |
|||
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EDO HOH |
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O OG1 |
C1 O |
||||||||||
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X-RAY |
2017-08-16 | THR | A:44 | A:44 | 85.0 | 0.607 | -89.7 | 169.7 | 85.0 | 0.607 | 0.0 |
HOH |
2.830 |
OG1 |
O |
|||
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EDO HOH |
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O OG1 |
C2 O |
||||||||||
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X-RAY |
2017-08-16 | THR | A:44 | A:44 | 78.0 | 0.557 | -83.6 | 169.0 | 78.0 | 0.557 | 0.0 |
HOH |
2.506 |
OG1 |
O |
|||
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HOH |
2.677 |
OG1 |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2018-01-17 | THR | A:44 | A:44 | 84.0 | 0.6 | -88.4 | 164.7 | 84.0 | 0.6 | 0.0 |
EDO HOH |
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CG2 OG1 |
O2 O |
|||
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EDO HOH |
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O OG1 |
C2 O |
||||||||||
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X-RAY |
2018-01-17 | THR | A:44 | A:44 | 85.0 | 0.607 | -86.5 | 167.1 | 85.0 | 0.607 | 0.0 |
HOH |
3.152 |
C |
O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 83.0 | 0.593 | -85.6 | 169.2 | 83.0 | 0.593 | 0.0 |
HOH |
3.197 |
C |
O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 80.0 | 0.571 | -81.3 | 170.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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X-RAY |
2019-03-13 | THR | A:44 | A:44 | 81.0 | 0.579 | -94.2 | 168.1 | 81.0 | 0.579 | 0.0 |
HOH |
3.191 |
C |
O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 83.0 | 0.593 | -84.0 | 167.8 | 83.0 | 0.593 | 0.0 |
EDO HOH |
3.583 2.655 |
O OG1 |
C1 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 80.0 | 0.571 | -73.2 | 169.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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| 6g7a | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-03-13 | THR | A:44 | A:44 | 84.0 | 0.6 | -83.0 | 165.8 | 84.0 | 0.6 | 0.0 |
HOH |
2.678 |
OG1 |
O |
|||
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EDO HOH |
3.576 2.615 |
O OG1 |
C2 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 75.0 | 0.536 | -77.7 | 169.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | D:44 | D:44 | 77.0 | 0.55 | -91.4 | 166.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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X-RAY |
2020-04-08 | THR | A:44 | A:44 | 77.0 | 0.55 | -84.8 | 167.1 | 77.0 | 0.55 | 0.0 |
HOH |
2.448 |
OG1 |
O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 84.0 | 0.6 | -81.4 | 167.9 | 84.0 | 0.6 | 0.0 |
EDO HOH |
3.547 2.734 |
O OG1 |
C2 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 78.0 | 0.557 | -78.7 | 165.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | D:44 | D:44 | 79.0 | 0.564 | -90.2 | 167.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6r71 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-08 | THR | A:44 | A:44 | 82.0 | 0.586 | -98.7 | 164.5 | 82.0 | 0.586 | 0.0 |
HOH |
2.708 |
OG1 |
O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 87.0 | 0.621 | -88.9 | 169.0 | 87.0 | 0.621 | 0.0 |
HOH |
2.972 |
C |
O |
||||||||||
| 6t5p | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-14 | THR | A:44 | A:44 | 79.0 | 0.564 | -76.7 | 165.6 | 79.0 | 0.564 | 0.0 |
HOH |
2.326 |
OG1 |
O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 81.0 | 0.579 | -79.3 | 167.8 | 81.0 | 0.579 | 0.0 |
EDO HOH |
3.353 2.665 |
O OG1 |
C1 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 81.0 | 0.579 | -76.8 | 169.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | D:44 | D:44 | 81.0 | 0.579 | -88.3 | 169.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6t5q | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-14 | THR | A:44 | A:44 | 93.0 | 0.664 | -93.1 | 170.0 | 93.0 | 0.664 | 0.0 |
HOH |
4.109 |
O |
O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 83.0 | 0.593 | -87.3 | 167.8 | 83.0 | 0.593 | 0.0 |
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3.587 3.129 |
O C |
C1 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 79.0 | 0.564 | -95.9 | 167.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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| 7puu | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | THR | A:44 | A:44 | 77.0 | 0.55 | -85.5 | 166.0 | 77.0 | 0.55 | 0.0 |
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O OG1 |
O1 O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 81.0 | 0.579 | -83.5 | 165.7 | 81.0 | 0.579 | 0.0 |
EDO HOH |
3.657 2.661 |
O OG1 |
C1 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 77.0 | 0.55 | -80.2 | 169.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | D:44 | D:44 | 79.0 | 0.564 | -93.1 | 167.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7puv | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | THR | A:44 | A:44 | 77.0 | 0.55 | -88.8 | 162.0 | 77.0 | 0.55 | 0.0 |
EDO HOH |
3.723 2.751 |
OG1 OG1 |
C2 O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 82.0 | 0.586 | -83.0 | 168.9 | 82.0 | 0.586 | 0.0 |
PEG HOH |
3.420 2.684 |
O OG1 |
C2 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 79.0 | 0.564 | -79.6 | 169.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | D:44 | D:44 | 84.0 | 0.6 | -89.1 | 164.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7puw | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-12 | THR | A:44 | A:44 | 79.0 | 0.564 | -83.1 | 165.0 | 79.0 | 0.564 | 0.0 |
HOH |
3.270 |
C |
O |
|||
| THR | B:44 | B:44 | 82.0 | 0.586 | -82.6 | 166.0 | 82.0 | 0.586 | 0.0 |
EDO HOH |
3.474 2.644 |
O OG1 |
C2 O |
||||||||||
| THR | C:44 | C:44 | 82.0 | 0.586 | -82.9 | 170.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| THR | D:44 | D:44 | 79.0 | 0.564 | -87.2 | 166.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6rps | 1 | O43570 | 96.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-13 | THR | A:43 | A:45 | 75.0 | 0.536 | -77.2 | 162.2 | 75.0 | 0.536 | 0.0 | |||||||
| THR | B:43 | B:45 | 72.0 | 0.514 | -75.9 | 162.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-o43570-f1 | 1 | O43570 | 100.0 | 0.0 | THR | A:72 | A:72 | 78.0 | 0.557 | -81.8 | 163.1 | ||