Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr15 99478258 . G A CCDS10378.1:NM_000875.3:c.3162atG>atA_NP_000866.1:p.1054M>I Homo sapiens insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6jk8 1 P08069 100.0 0.0 EM
 2020-03-04 MET A:1054 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET B:1054 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6pyh 1 Q60751 95.96 0.0 EM
 2019-10-23 MET A:1025 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET C:1025 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3lvp 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2010-07-21 MET A:104 A:1054 9.0 0.049 H -50.6 -30.0 9.0 0.049 0.0 PDR
 6.930
 CE
 C15
MET B:104 B:1054 7.0 0.038 H -48.8 -32.8 NA NA NA
MET C:104 C:1054 10.0 0.054 H -57.3 -31.1 NA NA NA
MET D:104 D:1054 3.0 0.016 T -65.0 2.8 NA NA NA
1m7n 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2003-01-07 MET A:82 A:1051 16.0 0.086 T -74.4 -8.4 16.0 0.086 0.0 HOH
 3.322
 O
 O
MET B:82 B:1051 17.0 0.092 G -73.0 -5.5 NA NA NA
1p4o 1 P08069 99.38 0.0 X-RAY
 2003-04-29 MET A:82 A:1024 14.0 0.076 G -76.5 -8.6 14.0 0.076 0.0 HOH
 2.839
 O
 O
MET B:82 B:1024 15.0 0.081 G -79.4 -7.4 NA NA NA
5fxq 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2016-10-19 MET A:76 A:1054 1.0 0.005 G -72.6 -8.7 1.0 0.005 0.0 GD5
HOH
 8.002
2.691
 CG
O
 CL
O
5fxr 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2016-10-19 MET A:76 A:1054 3.0 0.016 G -74.0 -6.0 3.0 0.016 0.0 8LN
HOH
 8.195
2.801
 CG
O
 CL
O
1jqh 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2002-04-19 MET A:76 A:1054 4.0 0.022 G -71.7 -14.4 4.0 0.022 0.0 MG
ANP
HOH
 9.626
9.416
2.565
 SD
CE
O
 MG
N6
O
MET B:76 B:1054 4.0 0.022 G -65.4 -15.1 NA NA NA
MET C:76 C:1054 5.0 0.027 G -69.2 -15.4 NA NA NA
2zm3 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2008-06-10 MET A:76 A:1054 6.0 0.032 H -66.1 -29.7 6.0 0.032 0.0 575
HOH
 5.919
2.794
 CE
O
 O1
O
MET B:76 B:1054 15.0 0.081 H -77.8 -36.8 NA NA NA
MET C:76 C:1054 7.0 0.038 H -73.5 -25.3 NA NA NA
MET D:76 D:1054 5.0 0.027 H -66.5 -39.1 NA NA NA
3f5p 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2008-12-30 MET A:76 A:1054 22.0 0.119 H -42.4 -58.2 22.0 0.119 0.0 741
HOH
 3.841
4.191
 CE
O
 C31
O
MET B:76 B:1054 19.0 0.103 H -42.2 -63.5 NA NA NA
MET C:76 C:1054 21.0 0.114 H -58.2 -58.5 NA NA NA
MET D:76 D:1054 16.0 0.086 H -39.0 -64.0 NA NA NA
MET E:76 E:1054 21.0 0.114 H -49.4 -58.9 NA NA NA
MET F:76 F:1054 18.0 0.097 H -43.5 -53.7 NA NA NA
MET G:76 G:1054 19.0 0.103 H -41.9 -48.1 NA NA NA
MET H:76 H:1054 23.0 0.124 H -45.0 -61.9 NA NA NA
MET I:76 I:1054 21.0 0.114 H -51.7 -59.7 NA NA NA
MET J:76 J:1054 22.0 0.119 H -38.4 -62.0 NA NA NA
MET K:76 K:1054 20.0 0.108 H -42.5 -64.6 NA NA NA
MET L:76 M:1054 19.0 0.103 H -52.8 -61.6 NA NA NA
MET M:76 L:1054 27.0 0.146 H -43.3 -58.0 NA NA NA
MET N:76 R:1054 20.0 0.108 H -49.6 -55.5 NA NA NA
MET O:76 S:1054 21.0 0.114 H -61.0 -57.3 NA NA NA
MET P:76 T:1054 24.0 0.13 H -46.9 -52.4 NA NA NA
3i81 1 P08069 99.67 0.0 X-RAY
 2009-12-22 MET A:75 A:1024 5.0 0.027 G -63.7 -24.1 5.0 0.027 0.0 EBI
HOH
 7.314
2.666
 CE
O
 C7
O
5fxs 1 P08069 99.35 0.0 X-RAY
 2016-10-19 MET A:76 A:1054 4.0 0.022 G -68.0 -14.9 4.0 0.022 0.0 OZN
HOH
 8.095
2.709
 CG
O
 CL36
O
2oj9 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2007-05-01 MET A:75 A:1024 11.0 0.059 G -69.4 -3.4 11.0 0.059 0.0 BMI
HOH
 7.809
2.782
 SD
O
 C3
O
3nw5 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2010-07-28 MET A:75 A:1024 4.0 0.022 G -69.5 -18.0 4.0 0.022 0.0 LGX
HOH
 8.085
2.477
 CE
O
 C16
O
3nw6 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2010-07-28 MET A:75 A:1024 5.0 0.027 G -68.2 -15.8 5.0 0.027 0.0 LGW
HOH
 8.130
2.398
 CE
O
 F32
O
3nw7 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2010-07-28 MET A:75 A:1024 3.0 0.016 G -64.1 -24.6 3.0 0.016 0.0 LGV
HOH
 7.825
2.586
 CE
O
 C18
O
3o23 1 P08069 99.67 0.0 X-RAY
 2011-05-04 MET A:73 A:1054 43.0 0.232 H -69.8 -21.7 43.0 0.232 0.0 MQY
HOH
 3.608
2.683
 CG
O
 O21
O
3lw0 1 P08069 99.34 0.0 X-RAY
 2010-09-29 MET A:72 A:1054 47.0 0.254 H -84.5 -5.7 47.0 0.254 0.0 CCX
HOH
 3.593
2.745
 CE
O
 N9
O
MET B:72 B:1054 48.0 0.259 H -86.1 -6.5 NA NA NA
MET C:72 C:1054 41.0 0.222 H -86.6 -4.7 NA NA NA
MET D:72 D:1054 47.0 0.254 H -87.2 -5.5 NA NA NA
5hzn 1 P08069 99.34 0.0 X-RAY
 2016-04-06 MET A:72 A:1051 20.0 0.108 H -70.9 -19.8 20.0 0.108 0.0 66A
HOH
 3.979
2.662
 SD
O
 C17
O
MET B:72 B:1051 20.0 0.108 G -68.4 -10.8 NA NA NA
MET C:72 C:1051 21.0 0.114 H -64.0 -31.5 NA NA NA
MET D:72 D:1051 22.0 0.119 G -61.3 -22.9 NA NA NA
MET E:72 E:1051 21.0 0.114 H -70.4 -20.6 NA NA NA
MET F:72 F:1051 21.0 0.114 G -68.2 -10.1 NA NA NA
MET G:72 G:1051 21.0 0.114 H -63.1 -32.8 NA NA NA
MET H:72 H:1051 21.0 0.114 G -61.5 -22.9 NA NA NA
4d2r 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2015-04-22 MET A:70 A:1054 5.0 0.027 G -62.3 -18.7 5.0 0.027 0.0 DYK
HOH
 9.953
2.688
 CE
O
 C15
O
3d94 1 P08069 99.67 0.0 X-RAY
 2008-07-29 MET A:69 A:1024 18.0 0.097 G -76.0 -8.9 18.0 0.097 0.0 D94
HOH
 3.589
2.660
 SD
O
 C14
O
3qqu 1 P08069 100.0 0.0 X-RAY
 2011-04-20 MET A:69 A:1051 9.0 0.049 G -80.7 -4.7 9.0 0.049 0.0 01P
HOH
 7.681
4.086
 CE
SD
 C1
O
MET B:69 B:1051 8.0 0.043 H -87.9 -3.8 NA NA NA
MET C:69 C:1051 13.0 0.07 S -90.6 -23.9 NA NA NA
MET D:69 D:1051 9.0 0.049 T -114.1 20.4 NA NA NA
1k3a 1 P08069 99.67 0.0 X-RAY
 2001-11-28 MET A:67 A:1024 5.0 0.027 H -65.3 -25.0 5.0 0.027 0.0 ACP
HOH
 7.524
2.875
 CE
O
 N6
O
2z8c 1 P06213 80.2 1e-175 X-RAY
 2008-08-12 MET A:71 A:1051 4.0 0.022 T -96.1 -24.1 4.0 0.022 0.0 S91
 7.282
 CE
 N5
1gag 1 P06213 80.2 2e-175 X-RAY
 2001-01-17 MET A:74 A:1051 6.0 0.032 H -62.6 -37.0 6.0 0.032 0.0 112
HOH
 7.619
3.585
 CE
SD
 N6
O
1ir3 1 P06213 80.2 2e-175 X-RAY
 1998-01-07 MET A:74 A:1051 7.0 0.038 H -61.3 -37.2 7.0 0.038 0.0 ANP
HOH
 6.920
2.714
 CE
O
 N6
O
1irk 1 P06213 80.2 2e-175 X-RAY
 1995-02-27 MET A:74 A:1051 54.0 0.292 H -57.9 -22.0 54.0 0.292 0.0 HOH
 2.741
 O
 O
5e1s 1 P06213 80.2 2e-175 X-RAY
 2015-10-14 MET A:76 A:1051 14.0 0.076 H -61.2 -23.3 14.0 0.076 0.0 5JA
HOH
 8.706
2.607
 SD
O
 C26
O
1rqq 1 P06213 80.2 3e-175 X-RAY
 2003-12-30 MET A:74 A:1051 2.0 0.011 H -65.0 -25.5 2.0 0.011 0.0 112
HOH
 7.099
2.754
 CE
O
 N6
O
MET B:74 B:1051 2.0 0.011 H -66.2 -24.9 2.0 0.011 0.0 112
HOH
 7.142
2.742
 CE
O
 N6
O
2auh 1 P06213 80.2 3e-175 X-RAY
 2005-11-01 MET A:74 A:1051 5.0 0.027 H -64.7 -37.9 5.0 0.027 0.0 CA
 8.739
 SD
 CA
2b4s 2 P06213 80.2 3e-175 X-RAY
 2005-11-15 MET B:74 B:1051 4.0 0.022 H -62.6 -22.5 4.0 0.022 0.0 HOH
 2.858
 O
 O
MET D:74 D:1051 5.0 0.027 H -64.9 -24.5 5.0 0.027 0.0 HOH
 2.818
 O
 O
3bu3 1 P06213 80.2 3e-175 X-RAY
 2008-02-19 MET A:74 A:1051 7.0 0.038 H -67.5 -20.1 7.0 0.038 0.0 HOH
 2.708
 O
 O
3bu5 1 P06213 80.2 3e-175 X-RAY
 2008-02-19 MET A:74 A:1051 5.0 0.027 H -63.7 -25.3 5.0 0.027 0.0 MG
ATP
HOH
 9.512
6.319
2.530
 CE
CE
O
 MG
O1A
O
3bu6 1 P06213 80.2 3e-175 X-RAY
 2008-02-19 MET A:74 A:1051 5.0 0.027 H -64.9 -26.6 5.0 0.027 0.0 HOH
 2.748
 O
 O
5hhw 1 P06213 80.2 4e-175 X-RAY
 2016-04-13 MET A:75 A:1078 38.0 0.205 H -63.9 -18.3 38.0 0.205 0.0 HOH
 2.740
 O
 O
4ibm 1 P06213 80.73 8e-175 X-RAY
 2013-08-21 MET A:74 A:1051 6.0 0.032 G -83.6 -4.9 6.0 0.032 0.0 IR1
HOH
 7.364
2.703
 CE
O
 N26
O
MET B:74 B:1051 5.0 0.027 H -65.4 -20.2 NA NA NA
3eta 1 P06213 80.41 2e-170 X-RAY
 2009-05-26 MET A:73 A:1051 26.0 0.141 H -72.5 -12.3 26.0 0.141 0.0 351
HOH
 3.358
2.767
 SD
O
 N24
O
MET B:73 B:1051 25.0 0.135 H -66.9 -22.4 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p08069-f1 1 P08069 100.0 0.0 MET A:1054 A:1054 4.0 0.022 H -64.3 -17.2