Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr16 | 55862691 | . | G | A | CCDS32450.1:NM_001025195.1:c.248tCg>tTg_NP_001020366.1:p.83S>L | Homo sapiens carboxylesterase 1 (CES1), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1mx1 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2003-04-22 | SER | A:64 | A:1082 | 86.0 | 0.748 | S | -120.0 | 142.8 | 86.0 | 0.748 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.103 3.174 2.316 |
OG O O |
C6 C3 O |
||
SER | B:64 | B:2082 | 85.0 | 0.739 | S | -119.8 | 150.1 | 85.0 | 0.739 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.568 2.088 3.167 |
CB O OG |
C8 O1A O |
|||||||||
SER | C:64 | C:3082 | 84.0 | 0.73 | S | -124.8 | 144.0 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
NAG NDG HOH |
4.682 6.343 2.753 |
CB CB OG |
C6 O4 O |
|||||||||
SER | D:64 | D:4082 | 90.0 | 0.783 | S | -112.6 | 143.1 | 90.0 | 0.783 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.656 3.773 2.898 |
OG CB N |
C6 O8 O |
|||||||||
SER | E:64 | E:5082 | 81.0 | 0.704 | S | -127.0 | 149.1 | 81.0 | 0.704 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.964 2.703 2.918 |
OG OG N |
O6 O7 O |
|||||||||
SER | F:64 | F:6082 | 83.0 | 0.722 | S | -131.1 | 139.5 | 83.0 | 0.722 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
3.998 7.093 3.156 |
CB CB CA |
O6 C8 O |
|||||||||
1mx5 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2003-04-08 | SER | A:64 | A:1082 | 88.0 | 0.765 | S | -122.5 | 146.7 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.983 2.991 3.584 |
OG N CA |
O6 O4 O |
||
SER | B:64 | B:2082 | 84.0 | 0.73 | S | -129.4 | 143.0 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
5.353 2.798 5.412 |
N OG N |
C8 O2 O |
|||||||||
SER | C:64 | C:3082 | 79.0 | 0.687 | S | -138.0 | 133.9 | 79.0 | 0.687 | 0.0 |
NAG HOH |
4.568 2.765 |
CB OG |
O6 O |
|||||||||
SER | D:64 | D:4082 | 86.0 | 0.748 | S | -132.4 | 136.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:64 | E:5082 | 77.0 | 0.67 | S | -142.1 | 136.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:64 | F:6082 | 87.0 | 0.757 | S | -128.7 | 147.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1mx9 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2003-04-08 | SER | A:64 | A:1082 | 87.0 | 0.757 | S | -119.8 | 150.1 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
5.186 5.429 6.989 |
CB CA C |
O3 O6 O |
||
SER | B:64 | B:2082 | 80.0 | 0.696 | S | -145.0 | 133.3 | 80.0 | 0.696 | 0.0 |
NAG HOH |
3.702 2.741 |
CB O |
C6 O |
|||||||||
SER | C:64 | C:3082 | 84.0 | 0.73 | S | -112.3 | 140.0 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
NAG HOH |
6.836 2.940 |
OG CA |
O6 O |
|||||||||
SER | D:64 | D:4082 | 79.0 | 0.687 | S | -133.6 | 128.3 | 79.0 | 0.687 | 0.0 |
NAG HOH |
7.357 2.795 |
OG O |
O5 O |
|||||||||
SER | E:64 | E:5082 | 81.0 | 0.704 | S | -167.1 | 131.4 | 81.0 | 0.704 | 0.0 |
NAG HOH |
3.872 2.681 |
CB OG |
C6 O |
|||||||||
SER | F:64 | F:6082 | 83.0 | 0.722 | S | -130.8 | 133.5 | 83.0 | 0.722 | 0.0 |
NAG HOH |
7.333 2.928 |
OG N |
O6 O |
|||||||||
SER | G:64 | G:1082 | 84.0 | 0.73 | S | -145.9 | 147.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | H:64 | H:2082 | 79.0 | 0.687 | S | -140.9 | 137.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | I:64 | I:3082 | 76.0 | 0.661 | S | -116.2 | 144.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | J:64 | J:4082 | 79.0 | 0.687 | S | -144.9 | 140.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | K:64 | K:5082 | 82.0 | 0.713 | S | -133.1 | 147.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | L:64 | L:6082 | 79.0 | 0.687 | S | -136.7 | 148.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2dqy | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | SER | A:64 | A:1082 | 88.0 | 0.765 | S | -136.3 | 127.5 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
8.212 3.392 4.810 |
OG O O |
O7 O9 O |
||
SER | B:64 | B:2082 | 88.0 | 0.765 | S | -137.7 | 125.9 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.947 3.144 4.946 |
OG O O |
O7 O9 O |
|||||||||
SER | C:64 | C:3082 | 88.0 | 0.765 | S | -138.5 | 127.3 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.847 2.840 2.494 |
OG O OG |
C5 O9 O |
|||||||||
2dqz | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | SER | A:64 | A:1082 | 89.0 | 0.774 | S | -130.7 | 140.9 | 89.0 | 0.774 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
8.910 3.213 2.852 |
N CB N |
O5 O7 O |
||
SER | B:64 | B:2082 | 89.0 | 0.774 | S | -137.6 | 126.9 | 89.0 | 0.774 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.532 3.258 3.924 |
CB O OG |
C8 O9 O |
|||||||||
SER | C:64 | C:3082 | 86.0 | 0.748 | S | -147.0 | 146.7 | 86.0 | 0.748 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.681 4.353 2.650 |
CB O O |
O7 O9 O |
|||||||||
2dr0 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | SER | A:64 | A:1082 | 87.0 | 0.757 | S | -133.2 | 138.4 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
5.582 2.758 3.268 |
OG O O |
C8 O9 O |
||
SER | B:64 | B:2082 | 89.0 | 0.774 | S | -132.8 | 138.4 | 89.0 | 0.774 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
8.451 3.006 3.142 |
OG O N |
O7 O9 O |
|||||||||
SER | C:64 | C:3082 | 88.0 | 0.765 | S | -133.1 | 138.6 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.528 3.114 6.753 |
OG O O |
C1 O9 O |
|||||||||
2h7c | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | SER | A:64 | A:1082 | 88.0 | 0.765 | S | -122.7 | 138.7 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
2.699 5.925 2.992 |
OG OG O |
O6 O3 O |
||
SER | B:64 | B:2082 | 84.0 | 0.73 | S | -122.0 | 145.0 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
NAG HOH |
4.540 2.729 |
CB O |
C6 O |
|||||||||
SER | C:64 | C:3082 | 82.0 | 0.713 | S | -127.3 | 143.5 | 82.0 | 0.713 | 0.0 |
NAG HOH |
5.358 2.893 |
CB O |
C6 O |
|||||||||
SER | D:64 | D:4082 | 81.0 | 0.704 | S | -129.2 | 142.2 | 81.0 | 0.704 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.904 2.790 2.759 |
CB O OG |
C6 O4 O |
|||||||||
SER | E:64 | E:5082 | 81.0 | 0.704 | S | -129.4 | 141.4 | 81.0 | 0.704 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
5.300 2.953 2.740 |
CB OG O |
C6 O6 O |
|||||||||
SER | F:64 | F:6082 | 80.0 | 0.696 | S | -130.3 | 144.8 | 80.0 | 0.696 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
4.585 5.988 2.833 |
CB CB OG |
O6 C8 O |
|||||||||
1ya4 | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | SER | A:62 | A:82 | 86.0 | 0.748 | S | -141.1 | 137.2 | 86.0 | 0.748 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.993 2.554 4.445 |
OG O N |
C8 O9 O |
||
SER | B:62 | B:82 | 87.0 | 0.757 | S | -138.9 | 144.7 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
6.896 2.628 4.317 |
OG O CB |
C8 O9 O |
|||||||||
SER | C:62 | C:82 | 86.0 | 0.748 | S | -143.7 | 143.5 | 86.0 | 0.748 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
8.021 2.923 4.197 |
OG O N |
O7 O9 O |
|||||||||
1ya8 | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | SER | A:62 | A:82 | 85.0 | 0.739 | S | -113.4 | 153.8 | 85.0 | 0.739 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
8.570 3.737 5.996 |
OG N OG |
C1 O7 O |
||
SER | B:62 | B:82 | 88.0 | 0.765 | S | -141.7 | 124.3 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
8.399 2.483 2.857 |
OG O OG |
O7 O9 O |
|||||||||
SER | C:62 | C:82 | 89.0 | 0.774 | S | -139.8 | 132.1 | 89.0 | 0.774 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.403 2.907 2.863 |
OG O OG |
C8 O9 O |
|||||||||
1yah | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | SER | A:62 | A:82 | 88.0 | 0.765 | S | -123.4 | 138.9 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.974 2.710 2.905 |
OG O N |
O7 O9 O |
||
SER | B:62 | B:82 | 87.0 | 0.757 | S | -128.4 | 140.8 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.633 2.681 3.009 |
OG O O |
N2 O9 O |
|||||||||
SER | C:62 | C:82 | 84.0 | 0.73 | S | -124.1 | 141.1 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
SIA NAG HOH |
3.520 5.870 3.558 |
O OG C |
O7 O7 O |
|||||||||
1yaj | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | SER | A:62 | A:82 | 81.0 | 0.704 | S | -122.0 | 159.8 | 81.0 | 0.704 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
8.707 3.213 3.319 |
OG OG CB |
C1 O2 O |
||
SER | B:62 | B:82 | 87.0 | 0.757 | S | -138.6 | 148.0 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
NAG SIA |
8.217 2.440 |
OG O |
O7 O9 |
|||||||||
SER | C:62 | C:82 | 85.0 | 0.739 | S | -124.1 | 149.3 | 85.0 | 0.739 | 0.0 |
SIA NAG HOH |
4.162 7.896 2.888 |
OG OG O |
O4 C8 O |
|||||||||
SER | D:62 | D:82 | 89.0 | 0.774 | S | -113.0 | 159.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:62 | E:82 | 88.0 | 0.765 | S | -128.3 | 149.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:62 | F:82 | 94.0 | 0.817 | S | -152.4 | 118.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | G:62 | G:82 | 94.0 | 0.817 | S | -79.3 | 143.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | H:62 | H:82 | 88.0 | 0.765 | S | -120.7 | 156.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | I:62 | I:82 | 91.0 | 0.791 | S | -148.5 | 132.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | J:62 | J:82 | 86.0 | 0.748 | S | -118.9 | 147.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | K:62 | K:82 | 83.0 | 0.722 | S | -135.6 | 147.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | L:62 | L:82 | 93.0 | 0.809 | S | -135.0 | 134.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2hrq | 1 | Q9UK77 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-01 | SER | A:62 | A:1082 | 83.0 | 0.722 | S | -129.2 | 146.9 | 83.0 | 0.722 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.409 3.127 3.186 |
N O CA |
C1 O9 O |
||
SER | B:62 | B:2082 | 84.0 | 0.73 | S | -134.3 | 143.0 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.852 2.782 2.583 |
OG O OG |
C8 O9 O |
|||||||||
SER | C:62 | C:3082 | 87.0 | 0.757 | S | -140.0 | 145.4 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
7.066 3.071 3.304 |
OG OG CA |
C8 O4 O |
|||||||||
SER | D:62 | D:4082 | 83.0 | 0.722 | S | -131.9 | 152.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:62 | E:5082 | 84.0 | 0.73 | S | -131.6 | 147.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:62 | F:6082 | 84.0 | 0.73 | S | -132.2 | 143.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2hrr | 1 | Q9UK77 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-01 | SER | A:62 | A:1082 | 85.0 | 0.739 | S | -131.2 | 149.1 | 85.0 | 0.739 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
6.520 2.831 2.638 |
OG O N |
C1 O9 O |
||
SER | B:62 | B:2082 | 84.0 | 0.73 | S | -124.2 | 146.5 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
6.400 2.701 2.798 |
OG O OG |
C8 O9 O |
|||||||||
SER | C:62 | C:3082 | 83.0 | 0.722 | S | -135.8 | 143.2 | 83.0 | 0.722 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
6.581 3.732 2.838 |
OG CB OG |
O6 O8 O |
|||||||||
4ab1 | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2012-03-07 | SER | A:62 | A:82 | 84.0 | 0.73 | S | -130.3 | 145.3 | 84.0 | 0.73 | 0.0 |
NAG HOH |
3.999 3.030 |
CB CB |
O6 O |
||
5a7f | 1 | P23141-3 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2016-01-13 | SER | A:62 | A:82 | 88.0 | 0.765 | S | -123.3 | 143.8 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
NAG HOH |
3.058 2.966 |
OG O |
O6 O |
||
5a7g | 1 | P23141 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2016-01-13 | SER | A:62 | A:82 | 82.0 | 0.713 | S | -133.9 | 145.2 | 82.0 | 0.713 | 0.0 |
NAG HOH |
3.726 2.754 |
CB OG |
O6 O |
||
5a7h | 1 | P23141 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2016-01-13 | SER | A:61 | A:82 | 87.0 | 0.757 | S | -116.3 | 135.1 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
HOH |
2.759 |
N |
O |
||
3k9b | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2010-01-19 | SER | A:59 | A:1082 | 87.0 | 0.757 | S | -126.1 | 140.4 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
HOH |
6.426 |
CA |
O |
||
SER | B:59 | B:2082 | 88.0 | 0.765 | S | -139.8 | 140.1 | 88.0 | 0.765 | 0.0 |
HOH |
3.022 |
O |
O |
|||||||||
SER | C:59 | C:3082 | 87.0 | 0.757 | S | -139.6 | 140.2 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
HOH |
7.882 |
O |
O |
|||||||||
1k4y | 1 | 3219695 | 82.06 | 0.0 |
X-RAY |
2002-05-01 | SER | A:60 | A:82 | 87.0 | 0.757 | S | -135.8 | 136.2 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
4.951 7.545 2.466 |
CB OG O |
O6 O5 O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p23141-f1 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 | SER | A:82 | A:82 | 83.0 | 0.722 | S | -119.8 | 140.6 | |
af-q9uky3-f1 | 1 | Q9UKY3 | 93.63 | 3e-170 | SER | A:83 | A:83 | 86.0 | 0.748 | S | -118.0 | 143.0 |