Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr16 | 55862835 | . | A | C | CCDS32450.1:NM_001025195.1:c.104cTg>cGg_NP_001020366.1:p.35L>R | Homo sapiens carboxylesterase 1 (CES1), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1mx1 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2003-04-22 | LEU | A:16 | A:1034 | 33.0 | 0.194 | E | -116.1 | 123.9 | 33.0 | 0.194 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.531 5.521 4.173 |
CG O CD1 |
C8 O1B O |
||
LEU | B:16 | B:2034 | 29.0 | 0.171 | E | -107.4 | 129.2 | 29.0 | 0.171 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.689 5.855 4.046 |
CD1 O CD1 |
O6 O1B O |
|||||||||
LEU | C:16 | C:3034 | 34.0 | 0.2 | E | -104.9 | 125.2 | 34.0 | 0.2 | 0.0 |
NAG NDG HOH |
4.568 7.627 3.054 |
CG CD1 CD1 |
C8 O7 O |
|||||||||
LEU | D:16 | D:4034 | 47.0 | 0.276 | E | -107.2 | 124.9 | 47.0 | 0.276 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.468 6.871 6.131 |
CD2 O CD2 |
C8 O1A O |
|||||||||
LEU | E:16 | E:5034 | 25.0 | 0.147 | E | -112.1 | 129.7 | 25.0 | 0.147 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.637 6.739 3.419 |
CG O CD1 |
O7 O10 O |
|||||||||
LEU | F:16 | F:6034 | 34.0 | 0.2 | E | -113.0 | 123.3 | 34.0 | 0.2 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
4.545 9.735 3.282 |
CD1 CD1 CD1 |
N2 O6 O |
|||||||||
1mx5 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2003-04-08 | LEU | A:16 | A:1034 | 24.0 | 0.141 | E | -104.7 | 128.0 | 24.0 | 0.141 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.494 6.424 4.122 |
CD1 O CD1 |
N2 O4 O |
||
LEU | B:16 | B:2034 | 34.0 | 0.2 | E | -112.6 | 125.1 | 34.0 | 0.2 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.430 6.187 3.291 |
CD1 O CD1 |
O5 O4 O |
|||||||||
LEU | C:16 | C:3034 | 33.0 | 0.194 | E | -123.2 | 117.7 | 33.0 | 0.194 | 0.0 |
NAG HOH |
4.583 4.277 |
CD1 CD1 |
N2 O |
|||||||||
LEU | D:16 | D:4034 | 29.0 | 0.171 | E | -116.3 | 119.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | E:16 | E:5034 | 28.0 | 0.165 | E | -110.9 | 119.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | F:16 | F:6034 | 28.0 | 0.165 | E | -114.2 | 126.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1mx9 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2003-04-08 | LEU | A:16 | A:1034 | 28.0 | 0.165 | E | -125.4 | 111.5 | 28.0 | 0.165 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
5.264 9.060 3.910 |
CD1 CD1 CD1 |
O6 C6 O |
||
LEU | B:16 | B:2034 | 38.0 | 0.224 | E | -117.7 | 123.9 | 38.0 | 0.224 | 0.0 |
NAG HOH |
4.082 6.018 |
CD1 O |
C8 O |
|||||||||
LEU | C:16 | C:3034 | 37.0 | 0.218 | E | -102.1 | 119.5 | 37.0 | 0.218 | 0.0 |
NAG HOH |
4.288 6.924 |
CD1 CB |
O5 O |
|||||||||
LEU | D:16 | D:4034 | 34.0 | 0.2 | E | -106.9 | 139.0 | 34.0 | 0.2 | 0.0 |
NAG HOH |
4.788 6.478 |
CD1 CD1 |
C1 O |
|||||||||
LEU | E:16 | E:5034 | 39.0 | 0.229 | E | -111.7 | 113.2 | 39.0 | 0.229 | 0.0 |
NAG HOH |
5.112 3.390 |
CD1 CD1 |
C1 O |
|||||||||
LEU | F:16 | F:6034 | 26.0 | 0.153 | E | -117.9 | 124.8 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
NAG HOH |
4.640 5.762 |
CD1 O |
O5 O |
|||||||||
LEU | G:16 | G:1034 | 33.0 | 0.194 | E | -129.1 | 112.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | H:16 | H:2034 | 38.0 | 0.224 | E | -114.7 | 126.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | I:16 | I:3034 | 32.0 | 0.188 | E | -115.2 | 106.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | J:16 | J:4034 | 41.0 | 0.241 | E | -96.7 | 125.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | K:16 | K:5034 | 27.0 | 0.159 | E | -121.7 | 105.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | L:16 | L:6034 | 31.0 | 0.182 | E | -122.3 | 117.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2dqy | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | LEU | A:16 | A:1034 | 24.0 | 0.141 | E | -110.1 | 130.6 | 24.0 | 0.141 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.823 7.310 3.678 |
CD1 O CD1 |
O6 O7 O |
||
LEU | B:16 | B:2034 | 26.0 | 0.153 | E | -110.2 | 130.0 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.882 6.981 6.806 |
CD1 O CD1 |
O5 O2 O |
|||||||||
LEU | C:16 | C:3034 | 24.0 | 0.141 | E | -110.3 | 131.4 | 24.0 | 0.141 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.995 7.165 5.990 |
CD1 O CD1 |
C8 O7 O |
|||||||||
2dqz | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | LEU | A:16 | A:1034 | 25.0 | 0.147 | E | -115.2 | 124.7 | 25.0 | 0.147 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.517 7.638 3.683 |
CD1 O CD1 |
O6 O1B O |
||
LEU | B:16 | B:2034 | 26.0 | 0.153 | E | -107.3 | 141.5 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.966 6.838 8.375 |
CD1 CB N |
O5 O1A O |
|||||||||
LEU | C:16 | C:3034 | 24.0 | 0.141 | E | -111.0 | 135.8 | 24.0 | 0.141 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
5.322 7.155 3.349 |
CD1 O CD1 |
O5 O1B O |
|||||||||
2dr0 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | LEU | A:16 | A:1034 | 26.0 | 0.153 | E | -106.1 | 124.3 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
5.558 7.422 5.822 |
CD1 O CD1 |
C1 O7 O |
||
LEU | B:16 | B:2034 | 26.0 | 0.153 | E | -105.5 | 126.0 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.633 6.840 3.434 |
CD1 O CD1 |
O5 O2 O |
|||||||||
LEU | C:16 | C:3034 | 24.0 | 0.141 | E | -106.5 | 125.4 | 24.0 | 0.141 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.359 6.847 3.658 |
CD1 O CD1 |
O6 O2 O |
|||||||||
2h7c | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-29 | LEU | A:16 | A:1034 | 36.0 | 0.212 | E | -108.0 | 130.0 | 36.0 | 0.212 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
5.081 9.032 3.239 |
CD1 CD1 CD1 |
N2 C1 O |
||
LEU | B:16 | B:2034 | 32.0 | 0.188 | E | -106.8 | 126.4 | 32.0 | 0.188 | 0.0 |
NAG HOH |
5.376 3.746 |
CD1 CD1 |
N2 O |
|||||||||
LEU | C:16 | C:3034 | 24.0 | 0.141 | E | -104.3 | 126.1 | 24.0 | 0.141 | 0.0 |
NAG HOH |
5.096 3.518 |
CD1 CD1 |
N2 O |
|||||||||
LEU | D:16 | D:4034 | 30.0 | 0.176 | E | -102.0 | 132.0 | 30.0 | 0.176 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.924 7.354 3.577 |
CD1 O CD1 |
N2 O4 O |
|||||||||
LEU | E:16 | E:5034 | 29.0 | 0.171 | E | -112.0 | 129.6 | 29.0 | 0.171 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.096 6.847 3.541 |
CD1 O CD1 |
C8 O1B O |
|||||||||
LEU | F:16 | F:6034 | 44.0 | 0.259 | E | -103.6 | 124.7 | 44.0 | 0.259 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
3.426 9.632 4.439 |
CD2 CD2 CG |
C8 C1 O |
|||||||||
1ya4 | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | LEU | A:14 | A:34 | 26.0 | 0.153 | E | -104.1 | 132.9 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.897 7.172 5.495 |
CD1 O O |
C1 O7 O |
||
LEU | B:14 | B:34 | 25.0 | 0.147 | E | -102.3 | 127.6 | 25.0 | 0.147 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.105 6.696 4.185 |
CD1 O CD2 |
O5 O2 O |
|||||||||
LEU | C:14 | C:34 | 25.0 | 0.147 | E | -105.5 | 131.8 | 25.0 | 0.147 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.862 6.866 3.357 |
CD1 O CD1 |
O5 O2 O |
|||||||||
1ya8 | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | LEU | A:14 | A:34 | 28.0 | 0.165 | E | -110.2 | 124.1 | 28.0 | 0.165 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.348 7.198 5.348 |
CD1 O CD1 |
O5 O1B O |
||
LEU | B:14 | B:34 | 29.0 | 0.171 | E | -115.2 | 128.7 | 29.0 | 0.171 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.047 6.864 6.488 |
CD1 O O |
O5 O2 O |
|||||||||
LEU | C:14 | C:34 | 31.0 | 0.182 | E | -110.7 | 119.8 | 31.0 | 0.182 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.751 7.824 3.653 |
CD1 O CD1 |
O6 O1A O |
|||||||||
1yah | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | LEU | A:14 | A:34 | 28.0 | 0.165 | E | -111.8 | 125.2 | 28.0 | 0.165 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
5.024 7.621 6.589 |
CD1 O O |
O3 O2 O |
||
LEU | B:14 | B:34 | 28.0 | 0.165 | E | -105.3 | 123.1 | 28.0 | 0.165 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.921 7.120 4.269 |
CD1 O CD2 |
O6 O2 O |
|||||||||
LEU | C:14 | C:34 | 29.0 | 0.171 | E | -109.1 | 120.8 | 29.0 | 0.171 | 0.0 |
SIA NAG HOH |
7.445 3.925 3.592 |
O CD1 CD1 |
O7 O6 O |
|||||||||
1yaj | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-02 | LEU | A:14 | A:34 | 29.0 | 0.171 | E | -99.2 | 121.0 | 29.0 | 0.171 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.468 7.084 7.452 |
CD1 O CB |
O5 O7 O |
||
LEU | B:14 | B:34 | 21.0 | 0.124 | E | -127.8 | 127.3 | 21.0 | 0.124 | 0.0 |
NAG SIA |
3.994 6.446 |
CD1 O |
C6 O2 |
|||||||||
LEU | C:14 | C:34 | 26.0 | 0.153 | E | -107.8 | 129.8 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
SIA NAG HOH |
7.493 4.304 9.336 |
O CD1 O |
O7 C6 O |
|||||||||
LEU | D:14 | D:34 | 32.0 | 0.188 | E | -100.2 | 140.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | E:14 | E:34 | 16.0 | 0.094 | E | -129.1 | 124.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | F:14 | F:34 | 31.0 | 0.182 | E | -107.3 | 128.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | G:14 | G:34 | 25.0 | 0.147 | E | -114.8 | 121.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | H:14 | H:34 | 39.0 | 0.229 | E | -103.6 | 131.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | I:14 | I:34 | 24.0 | 0.141 | E | -114.6 | 129.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | J:14 | J:34 | 23.0 | 0.135 | E | -97.8 | 135.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | K:14 | K:34 | 20.0 | 0.118 | E | -105.1 | 148.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | L:14 | L:34 | 23.0 | 0.135 | E | -128.2 | 122.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2hrq | 1 | Q9UK77 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-01 | LEU | A:14 | A:1034 | 24.0 | 0.141 | E | -116.9 | 121.6 | 24.0 | 0.141 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.213 7.448 4.703 |
CD1 O CD1 |
O7 O9 O |
||
LEU | B:14 | B:2034 | 27.0 | 0.159 | E | -111.1 | 130.7 | 27.0 | 0.159 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.148 6.883 3.993 |
CD1 O CD1 |
O6 O2 O |
|||||||||
LEU | C:14 | C:3034 | 29.0 | 0.171 | E | -106.2 | 126.1 | 29.0 | 0.171 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
5.784 7.495 3.517 |
CD1 O CD1 |
O6 O2 O |
|||||||||
LEU | D:14 | D:4034 | 26.0 | 0.153 | E | -112.0 | 124.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | E:14 | E:5034 | 26.0 | 0.153 | E | -110.8 | 131.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | F:14 | F:6034 | 28.0 | 0.165 | E | -101.8 | 128.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2hrr | 1 | Q9UK77 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-01 | LEU | A:14 | A:1034 | 32.0 | 0.188 | E | -116.0 | 118.6 | 32.0 | 0.188 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.076 7.756 6.398 |
CD1 O O |
N2 O1B O |
||
LEU | B:14 | B:2034 | 25.0 | 0.147 | E | -111.3 | 123.1 | 25.0 | 0.147 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
4.193 6.734 3.400 |
CD1 O CD1 |
O5 O2 O |
|||||||||
LEU | C:14 | C:3034 | 29.0 | 0.171 | E | -103.1 | 121.3 | 29.0 | 0.171 | 0.0 |
NAG SIA HOH |
3.513 6.623 3.708 |
CG O CD1 |
C8 O2 O |
|||||||||
4ab1 | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2012-03-07 | LEU | A:14 | A:34 | 26.0 | 0.153 | E | -111.2 | 130.2 | 26.0 | 0.153 | 0.0 |
NAG HOH |
4.458 3.870 |
CD1 CD1 |
C8 O |
||
5a7f | 1 | P23141-3 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2016-01-13 | LEU | A:14 | A:34 | 31.0 | 0.182 | E | -110.4 | 130.2 | 31.0 | 0.182 | 0.0 |
NAG HOH |
4.327 3.837 |
CD1 CD1 |
N2 O |
||
5a7g | 1 | P23141 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2016-01-13 | LEU | A:14 | A:34 | 47.0 | 0.276 | E | -107.7 | 124.8 | 47.0 | 0.276 | 0.0 |
NAG HOH |
4.013 4.061 |
CD2 CD2 |
O7 O |
||
5a7h | 1 | P23141 | 99.62 | 0.0 |
X-RAY |
2016-01-13 | LEU | A:13 | A:34 | 40.0 | 0.235 | E | -114.0 | 127.3 | 40.0 | 0.235 | 0.0 |
IOD HOH |
9.400 5.963 |
N O |
I O |
||
3k9b | 1 | P23141 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2010-01-19 | LEU | A:11 | A:1034 | 54.0 | 0.318 | E | -108.5 | 125.4 | 54.0 | 0.318 | 0.0 |
HOH |
9.251 |
N |
O |
||
LEU | B:11 | B:2034 | 60.0 | 0.353 | E | -108.7 | 124.4 | 60.0 | 0.353 | 0.0 |
HOH |
8.568 |
O |
O |
|||||||||
LEU | C:11 | C:3034 | 57.0 | 0.335 | E | -108.2 | 125.1 | 57.0 | 0.335 | 0.0 |
HOH |
4.920 |
CD2 |
O |
|||||||||
1k4y | 1 | 3219695 | 82.06 | 0.0 |
X-RAY |
2002-05-01 | LEU | A:12 | A:34 | 38.0 | 0.224 | E | -111.3 | 112.6 | 38.0 | 0.224 | 0.0 |
NAG NAG HOH |
3.806 8.527 6.228 |
CD1 CD1 O |
C8 O6 O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p23141-f1 | 1 | P23141 | 99.82 | 0.0 | LEU | A:34 | A:34 | 49.0 | 0.288 | E | -99.5 | 121.3 | |
af-q9uky3-f1 | 1 | Q9UKY3 | 93.63 | 3e-170 | LEU | A:35 | A:35 | 51.0 | 0.3 | E | -98.7 | 120.5 |