Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr17 30320326 . C A CCDS11270.1:NM_015355.2:c.1267Cga>Aga_NP_056170.2:p.423R>R Homo sapiens SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit (SUZ12), mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6c23 1 Q15022 100.0 0.0 EM
2018-01-24 ARG A:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6c24 1 Q15022 100.0 0.0 EM
2018-01-24 ARG A:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6wkr 2 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 ARG B:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7at8 2 Q15022 100.0 0.0 EM
2020-12-09 ARG B:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7kso 3 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 ARG C:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7ksr 3 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 ARG C:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7ktp 3 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 ARG C:423 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5wai 2 Q15022 98.54 0.0 X-RAY
2018-03-14 ARG B:348 B:423 285.0 1.0 360.0 -23.1 285.0 1.0 0.0
ARG F:348 F:423 278.0 1.0 360.0 -56.1 NA NA NA
5wak 2 Q15022 98.54 0.0 X-RAY
2018-03-14 ARG B:348 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6nq3 2 Q15022 98.54 0.0 X-RAY
2020-01-29 ARG B:348 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:348 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q15022-f1 1 Q15022 100.0 0.0 ARG A:423 A:423 208.0 0.924 -73.0 91.5