Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr17 | 30322590 | . | C | A | CCDS11270.1:NM_015355.2:c.1603Cga>Aga_NP_056170.2:p.535R>R | Homo sapiens SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit (SUZ12), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6c23 | 1 | Q15022 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-01-24 | ARG | A:535 | A:535 | 236.0 | 1.0 | S | -172.9 | 132.2 | 98.0 | 0.436 | 0.564 |
F:Q09028:0.613 |
|||||
| ARG | E:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6c24 | 1 | Q15022 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-01-24 | ARG | A:535 | A:535 | 228.0 | 1.0 | S | -168.9 | 118.2 | 105.0 | 0.467 | 0.533 |
G:Q09028:0.547 |
|||||
| ARG | F:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | J:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6wkr | 2 | Q15022 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ARG | B:535 | A:535 | 189.0 | 0.84 | 60.7 | 59.9 | 95.0 | 0.422 | 0.418 |
D:Q09028:0.418 |
||||||
| 7at8 | 2 | Q15022 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2020-12-09 | ARG | B:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7kso | 3 | Q15022 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ARG | C:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ksr | 3 | Q15022 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ARG | C:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ktp | 3 | Q15022 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ARG | C:535 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5wai | 2 | Q15022 | 98.54 | 0.0 |
X-RAY |
2018-03-14 | ARG | B:460 | B:535 | 230.0 | 1.0 | S | -58.9 | -55.2 | 116.0 | 0.516 | 0.484 |
A:Q09028:0.507 |
|||||
| ARG | F:460 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5wak | 2 | Q15022 | 98.54 | 0.0 |
X-RAY |
2018-03-14 | ARG | B:460 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6nq3 | 2 | Q15022 | 98.54 | 0.0 |
X-RAY |
2020-01-29 | ARG | B:460 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | F:460 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q15022-f1 | 1 | Q15022 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:535 | A:535 | 245.0 | 1.0 | -96.9 | 53.8 | ||