Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr17 30322617 . C A CCDS11270.1:NM_015355.2:c.1630Ctt>Att_NP_056170.2:p.544L>I Homo sapiens SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit (SUZ12), mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6c23 1 Q15022 100.0 0.0 EM
2018-01-24 LEU A:544 A:544 68.0 NA H -22.2 -45.5 68.0 NA NA
LEU E:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU I:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6c24 1 Q15022 100.0 0.0 EM
2018-01-24 LEU A:544 A:544 58.0 NA H -25.7 -52.3 58.0 NA NA
LEU F:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU J:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6wkr 2 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 LEU B:544 A:544 146.0 0.859 -138.5 360.0 146.0 0.859 0.0
7at8 2 Q15022 100.0 0.0 EM
2020-12-09 LEU B:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7kso 3 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 LEU C:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7ksr 3 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 LEU C:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7ktp 3 Q15022 100.0 0.0 EM
2021-02-03 LEU C:544 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5wai 2 Q15022 98.54 0.0 X-RAY
2018-03-14 LEU B:469 B:544 114.0 0.671 -77.9 129.0 37.0 0.218 0.453 A:Q09028:0.453
LEU F:469 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5wak 2 Q15022 98.54 0.0 X-RAY
2018-03-14 LEU B:469 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6nq3 2 Q15022 98.54 0.0 X-RAY
2020-01-29 LEU B:469 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU F:469 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5wg6 1 Q15910,Q15022 100.0 1e-98 X-RAY
2018-06-27 LEU A:708 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU C:708 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q15022-f1 1 Q15022 100.0 0.0 LEU A:544 A:544 111.0 0.653 T -118.7 -26.2