Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr17 34523311 . A C CCDS32626.1:NM_001001437.3:c.77cTt>cGt_NP_001001437.2:p.26L>R Homo sapiens C-C motif chemokine ligand 3 like 3 (CCL3L3), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
2x69 1 P10147 95.71 5e-45 X-RAY
 2010-11-03 LEU A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU D:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU E:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3h44 2 P10147 95.71 5e-45 X-RAY
 2010-04-14 LEU C:3 C:3 179.0 1.0 -68.9 144.4 65.0 0.382 0.618 A:P14735:0.671
 DIO
HOH
 7.715
2.467
 CD1
O
 O1'
O
LEU D:3 D:3 176.0 1.0 -62.9 138.1 NA NA NA
5cor 1 P10147 95.71 5e-45 X-RAY
 2016-04-13 LEU A:3 A:3 193.0 1.0 S -78.2 -38.4 193.0 1.0 0.0 HOH
 6.389
 C
 O
LEU B:3 B:3 227.0 1.0 360.0 -3.3 NA NA NA
LEU C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU D:3 D:3 235.0 1.0 360.0 84.4 NA NA NA
LEU E:3 E:3 230.0 1.0 360.0 18.0 218.0 1.0 0.0 C:P10147:0.071
 HOH
 3.524
 CA
 O
LEU F:3 F:3 189.0 1.0 S -76.4 -40.0 NA NA NA
LEU G:3 G:3 183.0 1.0 S -89.9 -37.5 165.0 0.971 0.029 E:P10147:0.106
 HOH
 8.967
 O
 O
LEU H:3 H:3 229.0 1.0 360.0 164.8 NA NA NA
LEU I:3 I:3 161.0 0.947 -99.7 164.2 161.0 0.947 0.0 ACT
HOH
 2.826
8.929
 N
O
 O
O
LEU J:3 J:3 187.0 1.0 S -78.7 -45.2 NA NA NA
5d65 1 P10147 95.71 5e-45 X-RAY
 2016-04-20 LEU A:3 A:3 152.0 0.894 -125.9 167.9 22.0 0.129 0.765 C:P10147:0.529
D:P10147:0.135
B:P10147:0.394
LEU B:3 B:3 240.0 1.0 360.0 114.8 106.0 0.624 0.376 C:P10147:0.047
D:P10147:0.782
E:P10147:0.082
 BGC
 9.955
 C
 C6
LEU C:3 C:3 230.0 1.0 360.0 56.6 175.0 1.0 0.0 A:P10147:0.324
LEU D:3 D:3 226.0 1.0 360.0 -34.3 57.0 0.335 0.665 C:P10147:0.135
A:P10147:0.194
B:P10147:0.9
 BGC
 6.633
 O
 O1
LEU E:3 E:3 162.0 0.953 -83.7 136.1 162.0 0.953 0.0
4zkb 2 P10147 97.06 1e-44 X-RAY
 2015-07-08 LEU B:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3kbx 1 P10147 92.86 3e-44 X-RAY
 2010-10-27 MSE A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MSE B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MSE C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MSE D:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MSE E:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3fpu 2 P10147 95.59 5e-44 X-RAY
 2010-01-12 LEU B:3 B:3 121.0 0.712 -94.7 139.6 108.0 0.635 0.077 A:P0C8E7:0.076
 HOH
 3.663
 CB
 O
2x6g 1 P10147 94.29 8e-44 X-RAY
 2010-11-03 LEU A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU D:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU E:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU F:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU G:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU H:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU I:3 I:3 149.0 NA 360.0 74.9 NA NA NA
LEU J:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU K:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU L:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU M:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU N:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU O:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU P:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU Q:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU R:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1b50 1 P10147 95.59 2e-43 NMR
 1999-07-22 LEU A:2 A:2 178.0 1.0 -66.3 -22.4 178.0 1.0 0.0
LEU B:2 B:2 174.0 1.0 -66.2 -22.4 174.0 1.0 0.0
1b53 1 P10147 95.59 2e-43 NMR
 1999-07-22 LEU A:2 A:2 100.0 0.588 -161.1 -155.4 99.0 0.582 0.006 B:P10147:0.006
LEU B:2 B:2 98.0 0.576 -161.2 -155.4 98.0 0.576 0.0
4ra8 1 P10147 94.2 2e-43 X-RAY
 2014-09-24 LEU A:3 A:3 181.0 1.0 -89.9 162.7 181.0 1.0 0.0 HOH
 5.552
 CB
 O
LEU B:3 B:3 175.0 1.0 S -85.9 -3.0 NA NA NA
LEU C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU D:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
LEU E:3 E:3 177.0 1.0 -110.7 18.2 NA NA NA
7f1q 1 P10147,P51681 95.59 2e-40 EM
 2021-07-14 LEU A:2 R:2 2.0 0.012 -104.7 120.4 2.0 0.012 0.0
7f1t 1 P10147,P51681,P00268 95.59 7e-40 X-RAY
 2021-07-14 LEU A:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p16619-f1 1 P16619 100.0 6e-65 LEU A:26 A:26 158.0 0.929 T -49.4 -21.3
af-p10147-f1 1 P10147 94.62 3e-59 LEU A:25 A:25 130.0 0.765 T -64.5 -25.5