Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr17 | 46973024 | . | T | A | CCDS11539.1:NM_001002027.1:c.304Tct>Act_NP_001002027.1:p.102S>T | Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C1 (subunit 9) (ATP5G1), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
6tt7 | 10 | P17605 | 91.91 | 1e-83 |
EM |
2020-09-23 | SER | N:102 | 1:41 | 111.0 | 0.965 | G | -79.0 | -3.6 | 90.0 | 0.783 | 0.182 |
G:None:0.183 |
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I:W5Q3H8:0.113 |
||||||||||||
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||||||||||||
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H:W5PP03:0.548 |
||||||||||||
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||||||||||||
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H:W5PP03:0.574 |
||||||||||||
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6za9 | 1 | P17605 | 91.91 | 1e-83 |
EM |
2020-09-23 | SER | A:102 | 1:41 | 112.0 | 0.974 | G | -68.9 | -16.7 | 112.0 | 0.974 | 0.0 | ||||||
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6z1r | 7 | P07926 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | K:41 | K:41 | 100.0 | 0.87 | G | -59.8 | -52.3 | 99.0 | 0.861 | 0.009 |
H:P05630:0.009 |
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G:P05631:0.183 |
||||||||||||
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I:P05632:0.287 |
||||||||||||
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||||||||||||
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H:P05630:0.339 |
||||||||||||
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H:P05630:0.383 |
||||||||||||
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H:P05630:0.452 |
||||||||||||
6z1u | 7 | P07926 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | K:41 | K:41 | 112.0 | 0.974 | G | -84.0 | 20.8 | 108.0 | 0.939 | 0.035 |
G:P05631:0.035 |
|||||
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G:P05631:0.417 |
||||||||||||
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I:P05632:0.087 |
||||||||||||
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H:P05630:0.191 |
||||||||||||
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H:P05630:0.6 |
||||||||||||
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||||||||||||
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I:P05632:0.304 |
||||||||||||
6zbb | 2 | P32876 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | B:41 | K:41 | 100.0 | 0.87 | T | -58.2 | -24.6 | 100.0 | 0.87 | 0.0 | ||||||
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6zg7 | 4 | P07926 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | D:41 | R:41 | 121.0 | 1.0 | G | -86.5 | 20.3 | 57.0 | 0.496 | 0.504 |
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|||||
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A:P05631:0.052 |
||||||||||||
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A:P05631:0.357 |
||||||||||||
SER | G:41 | M:41 | 100.0 | 0.87 | G | -72.4 | -20.7 | 100.0 | 0.87 | 0.0 | |||||||||||||
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C:P05632:0.2 |
||||||||||||
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B:P05630:0.243 |
||||||||||||
SER | J:41 | Q:41 | 104.0 | 0.904 | G | -85.5 | -4.3 | 55.0 | 0.478 | 0.426 |
B:P05630:0.426 |
||||||||||||
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||||||||||||
6zg8 | 4 | P07926 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | D:41 | K:41 | 108.0 | 0.939 | G | -55.3 | -29.4 | 106.0 | 0.922 | 0.017 |
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|||||
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A:P05631:0.096 |
||||||||||||
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C:P05632:0.226 |
||||||||||||
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B:P05630:0.087 C:P05632:0.33 |
||||||||||||
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B:P05630:0.383 |
||||||||||||
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B:P05630:0.365 |
||||||||||||
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B:P05630:0.565 |
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6zik | 4 | P07926 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | D:41 | K:41 | 108.0 | 0.939 | G | -73.5 | -0.3 | 101.0 | 0.878 | 0.061 |
A:P05631:0.061 |
|||||
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A:P05631:0.374 |
||||||||||||
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C:P05632:0.139 |
||||||||||||
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B:P05630:0.2 |
||||||||||||
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B:P05630:0.53 |
||||||||||||
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B:P05630:0.487 |
||||||||||||
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C:P05632:0.243 |
||||||||||||
6ziq | 9 | P32876 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | I:41 | M:41 | 106.0 | 0.922 | T | -103.7 | 15.3 | 106.0 | 0.922 | 0.0 | ||||||
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6zit | 9 | P07926 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | I:41 | R:41 | 107.0 | 0.93 | T | -116.7 | 26.8 | 107.0 | 0.93 | 0.0 | ||||||
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SER | K:41 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6zmr | 2 | F1RWF6 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | B:41 | K:41 | 107.0 | 0.93 | G | -86.9 | 19.6 | 107.0 | 0.93 | 0.0 | ||||||
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6zna | 2 | F1RWF6 | 100.0 | 2e-46 |
EM |
2020-09-09 | SER | B:41 | AK:41 | 108.0 | NA | T | -94.7 | 30.0 | 108.0 | NA | NA | ||||||
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SER | H:41 | AQ:41 | 102.0 | NA | T | -111.0 | -7.3 | 102.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | I:41 | AR:41 | 105.0 | NA | G | -102.6 | 37.8 | 105.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | S:41 | BK:41 | 103.0 | NA | T | -110.9 | -7.3 | 103.0 | NA | NA | |||||||||||||
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SER | U:41 | BM:41 | 111.0 | NA | T | -94.7 | 29.9 | 111.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | V:41 | BN:41 | 107.0 | NA | T | -120.7 | 29.6 | 107.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | W:41 | BO:41 | 106.0 | NA | G | -85.3 | 22.0 | 106.0 | NA | NA | |||||||||||||
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SER | Y:41 | BQ:41 | 93.0 | NA | S | -90.0 | -55.3 | 93.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | Z:41 | BR:41 | 107.0 | NA | G | -85.2 | 17.3 | 107.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | JA:41 | CK:41 | 110.0 | NA | T | -94.6 | 29.9 | 110.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | KA:41 | CL:41 | 104.0 | NA | T | -120.8 | 29.6 | 104.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | LA:41 | CM:41 | 104.0 | NA | G | -85.2 | 21.9 | 104.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | MA:41 | CN:41 | 97.0 | NA | S | -73.6 | -61.6 | 97.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | NA:41 | CO:41 | 94.0 | NA | S | -90.0 | -55.3 | 94.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | OA:41 | CP:41 | 108.0 | NA | G | -85.1 | 17.4 | 108.0 | NA | NA | |||||||||||||
SER | PA:41 | CQ:41 | 103.0 | NA | T | -111.0 | -7.3 | 103.0 | NA | NA | |||||||||||||
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SER | ZA:41 | K:41 | 109.0 | NA | G | -85.2 | 17.4 | 109.0 | NA | NA | |||||||||||||
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SER | CB:41 | N:41 | 110.0 | NA | T | -94.8 | 30.0 | 110.0 | NA | NA | |||||||||||||
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|||||||||||||
SER | X:40 | M:41 | 50.0 | 0.435 | -137.1 | 51.7 | 40.0 | 0.348 | 0.087 |
W:Q4VT52:0.087 |
|||||||||||||
SER | Y:40 | N:41 | 45.0 | 0.391 | -128.8 | 53.5 | 45.0 | 0.391 | 0.0 | ||||||||||||||
SER | Z:40 | O:41 | 40.0 | 0.348 | -101.2 | 77.1 | 37.0 | 0.322 | 0.026 |
Y:Q4VT52:0.026 |
|||||||||||||
SER | AA:40 | P:41 | 28.0 | 0.243 | -117.5 | 47.9 | 21.0 | 0.183 | 0.06 |
I:A0A286ZYL7:0.009 Z:Q4VT52:0.052 |
|||||||||||||
SER | BA:40 | Q:41 | 32.0 | 0.278 | -125.4 | 51.4 | 17.0 | 0.148 | 0.13 |
AA:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | CA:40 | R:41 | 44.0 | 0.383 | -118.3 | 47.1 | 17.0 | 0.148 | 0.235 |
BA:Q4VT52:0.113 I:A0A286ZYL7:0.157 |
|||||||||||||
6j5j | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 1e-43 |
EM |
2019-06-26 | SER | V:40 | K:41 | 30.0 | 0.261 | -118.2 | 51.5 | 16.0 | 0.139 | 0.122 |
CA:Q4VT52:0.122 |
||||||
SER | W:40 | L:41 | 41.0 | 0.357 | -137.7 | 53.8 | 35.0 | 0.304 | 0.053 |
V:Q4VT52:0.052 |
|||||||||||||
SER | X:40 | M:41 | 50.0 | 0.435 | -137.1 | 51.7 | 25.0 | 0.217 | 0.218 |
W:Q4VT52:0.087 I:A0A286ZYL7:0.13 |
|||||||||||||
SER | Y:40 | N:41 | 44.0 | 0.383 | -128.9 | 53.5 | 44.0 | 0.383 | 0.0 | ||||||||||||||
SER | Z:40 | O:41 | 38.0 | 0.33 | -101.2 | 77.2 | 22.0 | 0.191 | 0.139 |
I:A0A286ZYL7:0.113 Y:Q4VT52:0.026 |
|||||||||||||
SER | AA:40 | P:41 | 28.0 | 0.243 | -117.7 | 48.0 | 22.0 | 0.191 | 0.052 |
Z:Q4VT52:0.052 |
|||||||||||||
SER | BA:40 | Q:41 | 33.0 | 0.287 | -125.4 | 51.3 | 18.0 | 0.157 | 0.13 |
AA:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | CA:40 | R:41 | 44.0 | 0.383 | -118.3 | 47.1 | 31.0 | 0.27 | 0.113 |
BA:Q4VT52:0.113 |
|||||||||||||
6j5k | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 1e-43 |
EM |
2019-06-26 | SER | V:40 | K:41 | 31.0 | 0.27 | -118.2 | 51.6 | 17.0 | 0.148 | 0.122 |
CA:Q4VT52:0.122 |
||||||
SER | W:40 | L:41 | 41.0 | 0.357 | -137.7 | 53.8 | 34.0 | 0.296 | 0.061 |
V:Q4VT52:0.061 |
|||||||||||||
SER | X:40 | M:41 | 49.0 | 0.426 | -137.2 | 51.7 | 26.0 | 0.226 | 0.2 |
W:Q4VT52:0.078 I:A0A286ZYL7:0.122 |
|||||||||||||
SER | Y:40 | N:41 | 44.0 | 0.383 | -128.9 | 53.6 | 44.0 | 0.383 | 0.0 | ||||||||||||||
SER | Z:40 | O:41 | 45.0 | 0.391 | -101.2 | 77.2 | 30.0 | 0.261 | 0.13 |
I:A0A286ZYL7:0.113 Y:Q4VT52:0.017 |
|||||||||||||
SER | AA:40 | P:41 | 28.0 | 0.243 | -117.7 | 47.9 | 23.0 | 0.2 | 0.043 |
Z:Q4VT52:0.043 |
|||||||||||||
SER | BA:40 | Q:41 | 31.0 | 0.27 | -125.4 | 51.3 | 16.0 | 0.139 | 0.131 |
AA:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | CA:40 | R:41 | 46.0 | 0.4 | -118.3 | 47.1 | 31.0 | 0.27 | 0.13 |
BA:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | ZA:40 | AK:41 | 29.0 | 0.252 | -118.3 | 51.5 | 16.0 | 0.139 | 0.113 |
GB:Q4VT52:0.113 |
|||||||||||||
SER | AB:40 | AL:41 | 40.0 | 0.348 | -137.7 | 53.8 | 34.0 | 0.296 | 0.052 |
ZA:Q4VT52:0.052 |
|||||||||||||
SER | BB:40 | AM:41 | 52.0 | 0.452 | -137.2 | 51.8 | 26.0 | 0.226 | 0.226 |
AB:Q4VT52:0.096 MA:A0A286ZYL7:0.139 |
|||||||||||||
SER | CB:40 | AN:41 | 44.0 | 0.383 | -128.9 | 53.6 | 44.0 | 0.383 | 0.0 | ||||||||||||||
SER | DB:40 | AO:41 | 45.0 | 0.391 | -101.2 | 77.2 | 30.0 | 0.261 | 0.13 |
MA:A0A286ZYL7:0.104 CB:Q4VT52:0.026 |
|||||||||||||
SER | EB:40 | AP:41 | 28.0 | 0.243 | -117.7 | 47.9 | 22.0 | 0.191 | 0.052 |
DB:Q4VT52:0.052 |
|||||||||||||
SER | FB:40 | AQ:41 | 33.0 | 0.287 | -125.4 | 51.3 | 17.0 | 0.148 | 0.139 |
LA:A0A287A9I8:0.009 EB:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | GB:40 | AR:41 | 45.0 | 0.391 | -118.4 | 47.2 | 31.0 | 0.27 | 0.121 |
FB:Q4VT52:0.122 |
|||||||||||||
SER | DC:40 | BK:41 | 31.0 | 0.27 | -118.2 | 51.7 | 16.0 | 0.139 | 0.131 |
KC:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | EC:40 | BL:41 | 41.0 | 0.357 | -137.8 | 53.9 | 34.0 | 0.296 | 0.061 |
DC:Q4VT52:0.061 |
|||||||||||||
SER | FC:40 | BM:41 | 50.0 | 0.435 | -137.0 | 51.6 | 41.0 | 0.357 | 0.078 |
EC:Q4VT52:0.078 |
|||||||||||||
SER | GC:40 | BN:41 | 44.0 | 0.383 | -128.8 | 53.5 | 44.0 | 0.383 | 0.0 | ||||||||||||||
SER | HC:40 | BO:41 | 39.0 | 0.339 | -101.2 | 77.2 | 36.0 | 0.313 | 0.026 |
GC:Q4VT52:0.026 |
|||||||||||||
SER | IC:40 | BP:41 | 28.0 | 0.243 | -117.5 | 47.8 | 21.0 | 0.183 | 0.06 |
QB:A0A286ZYL7:0.009 HC:Q4VT52:0.052 |
|||||||||||||
SER | JC:40 | BQ:41 | 32.0 | 0.278 | -125.4 | 51.4 | 17.0 | 0.148 | 0.13 |
IC:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | KC:40 | BR:41 | 45.0 | 0.391 | -118.4 | 47.2 | 17.0 | 0.148 | 0.243 |
QB:A0A286ZYL7:0.157 JC:Q4VT52:0.113 |
|||||||||||||
SER | HD:40 | CK:41 | 29.0 | 0.252 | -118.2 | 51.7 | 15.0 | 0.13 | 0.122 |
OD:Q4VT52:0.122 |
|||||||||||||
SER | ID:40 | CL:41 | 41.0 | 0.357 | -137.7 | 53.9 | 34.0 | 0.296 | 0.061 |
HD:Q4VT52:0.061 |
|||||||||||||
SER | JD:40 | CM:41 | 50.0 | 0.435 | -137.1 | 51.7 | 40.0 | 0.348 | 0.087 |
ID:Q4VT52:0.087 |
|||||||||||||
SER | KD:40 | CN:41 | 43.0 | 0.374 | -128.8 | 53.5 | 43.0 | 0.374 | 0.0 | ||||||||||||||
SER | LD:40 | CO:41 | 38.0 | 0.33 | -101.2 | 77.1 | 36.0 | 0.313 | 0.017 |
KD:Q4VT52:0.017 |
|||||||||||||
SER | MD:40 | CP:41 | 28.0 | 0.243 | -117.6 | 47.9 | 21.0 | 0.183 | 0.06 |
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|||||||||||||
SER | ND:40 | CQ:41 | 33.0 | 0.287 | -125.4 | 51.4 | 18.0 | 0.157 | 0.13 |
MD:Q4VT52:0.13 |
|||||||||||||
SER | OD:40 | CR:41 | 43.0 | 0.374 | -118.4 | 47.2 | 16.0 | 0.139 | 0.235 |
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