Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr17 | 34416092 | . | T | A | CCDS11307.1:NM_002983.2:c.205Agc>Tgc_NP_002974.1:p.69S>C | Homo sapiens C-C motif chemokine ligand 3 (CCL3), mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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X-RAY |
2015-07-08 | SER | B:46 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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X-RAY |
2010-11-03 | SER | A:47 | A:47 | 84.0 | 0.73 | 67.4 | 4.2 | NA | NA | NA | |||||||
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N |
O |
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3h44 | 2 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
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X-RAY |
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CB |
O |
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C C |
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HOH |
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O |
O |
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OG |
O |
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X-RAY |
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N |
O4 |
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X-RAY |
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X-RAY |
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O |
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A:P10147:0.017 |
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4ra8 | 1 | P10147 | 98.55 | 1e-45 |
X-RAY |
2014-09-24 | SER | A:47 | A:47 | 79.0 | 0.687 | 66.3 | 26.1 | 79.0 | 0.687 | 0.0 | |||||||
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X-RAY |
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7f1q | 1 | P10147,P51681 | 98.55 | 8e-43 |
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2021-07-14 | SER | A:46 | R:46 | 117.0 | 1.0 | S | -72.8 | -18.2 | 117.0 | 1.0 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
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ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
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af-p16619-f1 | 1 | P16619 | 94.62 | 3e-59 | GLY | A:70 | A:70 | 55.0 | 0.733 | S | 75.8 | 10.5 |