Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr17 | 34416536 | . | C | A | CCDS11307.1:NM_002983.2:c.181Ggt>Tgt_NP_002974.1:p.61G>C | Homo sapiens C-C motif chemokine ligand 3 (CCL3), mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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X-RAY |
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X-RAY |
2010-11-03 | GLY | A:39 | A:39 | 1.0 | 0.013 | -153.4 | 150.1 | NA | NA | NA | |||||||
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HOH |
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N |
O |
||||||||||
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3h44 | 2 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
2010-04-14 | GLY | C:39 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLY | D:39 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5cor | 1 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
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O O N |
O1 O1 O |
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HOH |
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N |
O |
||||||||||
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O N |
O6 O |
||||||||||
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HEZ HOH |
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O N |
C2 O |
||||||||||
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HOH |
3.500 |
N |
O |
||||||||||
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X-RAY |
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N |
O4 |
|||
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N O |
C6 O1 |
||||||||||
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X-RAY |
2010-10-27 | GLY | A:39 | A:39 | 4.0 | 0.053 | -148.0 | 144.1 | 4.0 | 0.053 | 0.0 |
K HOH |
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N N |
K O |
|||
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3fpu | 2 | P10147 | 98.55 | 3e-46 |
X-RAY |
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HOH |
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N |
O |
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X-RAY |
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N |
O |
||||||||||
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N |
O |
||||||||||
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1999-07-22 | GLY | A:38 | A:38 | 9.0 | 0.12 | S | -167.9 | -171.2 | 9.0 | 0.12 | 0.0 | ||||||
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X-RAY |
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N |
O |
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X-RAY |
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EM |
2021-07-14 | GLY | A:38 | R:38 | 3.0 | 0.04 | -168.3 | 164.0 | 3.0 | 0.04 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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af-p10147-f1 | 1 | P10147 | 100.0 | 3e-64 | GLY | A:61 | A:61 | 5.0 | 0.067 | -158.9 | 145.5 | ||
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