Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr17 | 34416577 | . | A | C | CCDS11307.1:NM_002983.2:c.140aTa>aGa_NP_002974.1:p.47I>R | Homo sapiens C-C motif chemokine ligand 3 (CCL3), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
4zkb | 2 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
2015-07-08 | ILE | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2x69 | 1 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
2010-11-03 | ILE | A:25 | A:25 | 15.0 | 0.086 | E | -78.6 | 126.6 | NA | NA | NA | ||||||
ILE | B:25 | B:25 | 17.0 | 0.097 | E | -75.9 | 125.0 | 17.0 | 0.097 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | C:25 | C:25 | 17.0 | 0.097 | E | -74.3 | 116.9 | 17.0 | 0.097 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | D:25 | D:25 | 16.0 | 0.091 | E | -65.0 | 129.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:25 | E:25 | 16.0 | 0.091 | E | -47.5 | 141.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3h44 | 2 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
2010-04-14 | ILE | C:25 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ILE | D:25 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5cor | 1 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
2016-04-13 | ILE | A:25 | A:25 | 15.0 | 0.086 | E | -73.4 | 131.4 | 15.0 | 0.086 | 0.0 |
HOH |
4.519 |
CB |
O |
||
ILE | B:25 | B:25 | 17.0 | 0.097 | E | -69.1 | 130.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:25 | C:25 | 18.0 | 0.103 | E | -71.9 | 125.1 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HEZ HEZ HOH |
3.912 7.636 7.594 |
CG2 CD1 C |
O1 C4 O |
|||||||||
ILE | D:25 | D:25 | 15.0 | 0.086 | E | -67.6 | 127.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:25 | E:25 | 15.0 | 0.086 | E | -73.4 | 127.9 | 15.0 | 0.086 | 0.0 |
HEZ HEZ HOH |
7.689 7.193 4.579 |
CG1 CD1 CB |
O1 C4 O |
|||||||||
ILE | F:25 | F:25 | 14.0 | 0.08 | E | -73.1 | 131.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | G:25 | G:25 | 15.0 | 0.086 | E | -75.1 | 127.7 | 15.0 | 0.086 | 0.0 |
HOH |
4.539 |
CG2 |
O |
|||||||||
ILE | H:25 | H:25 | 15.0 | 0.086 | E | -75.7 | 128.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | I:25 | I:25 | 17.0 | 0.097 | E | -73.8 | 127.4 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
HOH |
6.998 |
C |
O |
|||||||||
ILE | J:25 | J:25 | 17.0 | 0.097 | E | -73.8 | 127.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5d65 | 1 | P10147 | 100.0 | 2e-47 |
X-RAY |
2016-04-20 | ILE | A:25 | A:25 | 13.0 | 0.074 | E | -71.9 | 125.7 | 13.0 | 0.074 | 0.0 |
BGC |
3.648 |
O |
O5 |
||
ILE | B:25 | B:25 | 16.0 | 0.091 | E | -68.5 | 122.5 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
IDS SGN IDS SGN BGC |
4.513 3.998 9.665 8.023 9.513 |
O O CG1 CG1 N |
C5 C3 O3 C3 O1 |
|||||||||
ILE | C:25 | C:25 | 12.0 | 0.069 | E | -74.5 | 131.5 | 12.0 | 0.069 | 0.0 |
BGC |
3.408 |
O |
O4 |
|||||||||
ILE | D:25 | D:25 | 17.0 | 0.097 | E | -63.8 | 139.1 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
BGC |
9.633 |
CD1 |
O6 |
|||||||||
ILE | E:25 | E:25 | 19.0 | 0.109 | E | -67.5 | 135.8 | 19.0 | 0.109 | 0.0 | |||||||||||||
3kbx | 1 | P10147 | 97.14 | 1e-46 |
X-RAY |
2010-10-27 | ILE | A:25 | A:25 | 15.0 | 0.086 | E | -79.4 | 129.8 | 15.0 | 0.086 | 0.0 | ||||||
ILE | B:25 | B:25 | 11.0 | 0.063 | E | -69.2 | 135.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:25 | C:25 | 12.0 | 0.069 | E | -75.5 | 128.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:25 | D:25 | 15.0 | 0.086 | E | -70.3 | 132.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:25 | E:25 | 15.0 | 0.086 | E | -84.6 | 137.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3fpu | 2 | P10147 | 98.55 | 3e-46 |
X-RAY |
2010-01-12 | ILE | B:25 | B:25 | 13.0 | 0.074 | E | -102.5 | 128.6 | 13.0 | 0.074 | 0.0 |
HOH |
5.033 |
CG2 |
O |
||
2x6g | 1 | P10147 | 98.57 | 3e-46 |
X-RAY |
2010-11-03 | ILE | A:25 | A:25 | 10.0 | 0.057 | E | -96.2 | 131.5 | NA | NA | NA | ||||||
ILE | B:25 | B:25 | 11.0 | 0.063 | E | -82.7 | 127.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:25 | C:25 | 15.0 | 0.086 | E | -77.2 | 117.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:25 | D:25 | 13.0 | 0.074 | E | -91.7 | 124.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:25 | E:25 | 12.0 | 0.069 | E | -95.7 | 130.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | F:25 | F:25 | 15.0 | 0.086 | E | -84.8 | 130.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | G:25 | G:25 | 12.0 | 0.069 | E | -101.8 | 132.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | H:25 | H:25 | 11.0 | 0.063 | E | -98.1 | 120.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | I:25 | I:25 | 10.0 | 0.057 | E | -98.4 | 130.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | J:25 | J:25 | 13.0 | 0.074 | E | -73.6 | 116.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | K:25 | K:25 | 14.0 | 0.08 | E | -80.7 | 142.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | L:25 | L:25 | 21.0 | 0.12 | E | -111.5 | 125.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | M:25 | M:25 | 14.0 | 0.08 | E | -78.8 | 122.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | N:25 | N:25 | 17.0 | 0.097 | E | -93.5 | 128.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | O:25 | O:25 | 12.0 | 0.069 | E | -95.8 | 122.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | P:25 | P:25 | 13.0 | 0.074 | E | -89.5 | 123.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | Q:25 | Q:25 | 16.0 | 0.091 | E | -66.5 | 133.1 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
4.077 |
CG2 |
O |
|||||||||
ILE | R:25 | R:25 | 10.0 | 0.057 | E | -94.8 | 128.4 | 10.0 | 0.057 | 0.0 |
HOH |
2.834 |
O |
O |
|||||||||
1b50 | 1 | P10147 | 98.55 | 1e-45 |
NMR |
1999-07-22 | ILE | A:24 | A:24 | 11.0 | 0.063 | -65.4 | 165.8 | 11.0 | 0.063 | 0.0 | |||||||
ILE | B:24 | B:24 | 11.0 | 0.063 | -65.4 | 165.9 | 11.0 | 0.063 | 0.0 | ||||||||||||||
1b53 | 1 | P10147 | 98.55 | 1e-45 |
NMR |
1999-07-22 | ILE | A:24 | A:24 | 9.0 | 0.051 | -127.7 | 166.8 | 9.0 | 0.051 | 0.0 | |||||||
ILE | B:24 | B:24 | 9.0 | 0.051 | -127.7 | 166.8 | 9.0 | 0.051 | 0.0 | ||||||||||||||
4ra8 | 1 | P10147 | 98.55 | 1e-45 |
X-RAY |
2014-09-24 | ILE | A:25 | A:25 | 14.0 | 0.08 | E | -74.5 | 127.0 | 14.0 | 0.08 | 0.0 | ||||||
ILE | B:25 | B:25 | 17.0 | 0.097 | E | -69.1 | 123.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:25 | C:25 | 13.0 | 0.074 | E | -76.4 | 124.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:25 | D:25 | 16.0 | 0.091 | E | -78.4 | 127.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:25 | E:25 | 17.0 | 0.097 | E | -59.1 | 136.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7f1t | 1 | P10147,P51681,P00268 | 98.55 | 3e-43 |
X-RAY |
2021-07-14 | ILE | A:24 | A:-72 | 11.0 | 0.063 | E | -101.3 | 119.4 | 11.0 | 0.063 | 0.0 | ||||||
7f1q | 1 | P10147,P51681 | 98.55 | 8e-43 |
EM |
2021-07-14 | ILE | A:24 | R:24 | 11.0 | 0.063 | -107.0 | 104.9 | 11.0 | 0.063 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p10147-f1 | 1 | P10147 | 100.0 | 3e-64 | ILE | A:47 | A:47 | 13.0 | 0.074 | E | -78.4 | 137.7 | |
af-p16619-f1 | 1 | P16619 | 94.62 | 3e-59 | ILE | A:48 | A:48 | 12.0 | 0.069 | E | -79.0 | 137.0 |