Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr17 | 34624338 | . | T | A | CCDS11310.1:NM_021006.4:c.203aAg>aTg_NP_066286.1:p.68K>M | Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 3-like 1 (CCL3L1), mRNA. |
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|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
2x69 | 1 | P10147 | 95.71 | 5e-45 |
X-RAY |
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HOH |
4.498 |
O |
O |
|||||||||
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LYS | E:45 | E:45 | 149.0 | 0.745 | T | -55.3 | -37.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3h44 | 2 | P10147 | 95.71 | 5e-45 |
X-RAY |
2010-04-14 | LYS | C:45 | C:16 | 235.0 | 1.0 | 360.0 | -62.0 | 103.0 | 0.515 | 0.485 |
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DIO HOH |
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CE N |
C1 O |
||
LYS | D:45 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5cor | 1 | P10147 | 95.71 | 5e-45 |
X-RAY |
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C:P10147:0.28 |
HOH |
8.369 |
C |
O |
|
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E:P10147:0.255 |
HEZ HEZ HOH |
5.903 7.714 3.949 |
CE N O |
C6 C5 O |
||||||||
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G:P10147:0.275 |
HEZ HOH |
7.909 6.743 |
N NZ |
C6 O |
||||||||
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I:P10147:0.255 |
HOH |
7.626 |
C |
O |
||||||||
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HOH |
3.787 |
O |
O |
|||||||||
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5d65 | 1 | P10147 | 95.71 | 5e-45 |
X-RAY |
2016-04-20 | LYS | A:45 | A:45 | 146.0 | 0.73 | T | -69.2 | -17.1 | 146.0 | 0.73 | 0.0 |
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4.248 |
CE |
C6 |
||
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A:P10147:0.21 |
IDS SGN SGN BGC |
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NZ NZ NZ O |
C4 O5 O4 O3 |
||||||||
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D:P10147:0.215 |
BGC |
3.458 |
NZ |
O3 |
||||||||
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B:P10147:0.255 |
SGN |
9.063 |
O |
O2S |
||||||||
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X-RAY |
2015-07-08 | LYS | B:44 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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X-RAY |
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3fpu | 2 | P10147 | 95.59 | 5e-44 |
X-RAY |
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NZ |
O |
||
2x6g | 1 | P10147 | 94.29 | 8e-44 |
X-RAY |
2010-11-03 | LYS | A:45 | A:45 | 131.0 | 0.655 | T | -63.0 | -24.4 | NA | NA | NA | ||||||
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HOH |
9.236 |
CE |
O |
|||||||||
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HOH |
4.306 |
NZ |
O |
|||||||||
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NMR |
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1b53 | 1 | P10147 | 95.59 | 2e-43 |
NMR |
1999-07-22 | LYS | A:44 | A:44 | 142.0 | 0.71 | T | -61.6 | -13.3 | 142.0 | 0.71 | 0.0 | ||||||
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X-RAY |
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2021-07-14 | LYS | A:44 | R:44 | 103.0 | NA | S | -62.6 | -36.5 | 103.0 | NA | NA | ||||||
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AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
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ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
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