Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr18 | 45375053 | . | G | A | CCDS11934.1:NM_001003652.3:c.790Cag>Tag_NP_001003652.1:p.264Q>* | Homo sapiens SMAD family member 2 (SMAD2), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 1khx | 1 | Q15796 | 100.0 | 1e-169 |
X-RAY |
2002-02-06 | GLN | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6zvq | 1 | Q15796 | 100.0 | 1e-169 |
X-RAY |
2021-06-09 | GLN | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6m64 | 1 | Q15796 | 99.51 | 5e-152 |
X-RAY |
2020-11-25 | GLN | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | C:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | E:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7co1 | 1 | Q15796 | 99.51 | 5e-152 |
X-RAY |
2020-11-25 | GLN | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | C:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | E:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1mk2 | 1 | P84022 | 96.6 | 8e-150 |
X-RAY |
2002-10-16 | GLN | A:3 | A:221 | 132.0 | 0.733 | -101.8 | 128.8 | 101.0 | 0.561 | 0.172 |
B:O95405:0.172 |
||||||
| 5xod | 1 | Q15796 | 100.0 | 2e-146 |
X-RAY |
2018-03-28 | GLN | A:5 | A:264 | 169.0 | 0.939 | -68.8 | 136.2 | 46.0 | 0.256 | 0.683 |
A:Q15796:0.683 |
HOH |
8.367 |
O |
O |
||
| 5zoj | 1 | Q15796 | 100.0 | 3e-146 |
X-RAY |
2018-10-10 | GLN | A:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | C:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1dev | 1 | Q15796 | 100.0 | 7e-146 |
X-RAY |
2000-01-21 | GLN | A:4 | A:264 | 108.0 | 0.6 | -176.7 | -178.9 | 91.0 | 0.506 | 0.094 |
B:O95405:0.094 |
||||||
| GLN | C:4 | C:264 | 117.0 | 0.65 | -103.3 | 133.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5xoc | 1 | P84022 | 97.46 | 2e-143 |
X-RAY |
2018-03-28 | GLN | A:5 | A:222 | 133.0 | 0.739 | -82.0 | 129.7 | 133.0 | 0.739 | 0.0 | |||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q15796-f1 | 1 | Q15796 | 100.0 | 0.0 | GLN | A:264 | A:264 | 59.0 | 0.328 | E | -88.6 | 120.9 | |
| af-p84022-f1 | 1 | P84022 | 83.94 | 0.0 | GLN | A:222 | A:222 | 63.0 | 0.35 | E | -90.3 | 124.0 | |