Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr18 51800445 . T A CCDS11954.2:NM_007195.2:c.391Tct>Act_NP_009126.2:p.131S>T Homo sapiens DNA polymerase iota (POLI), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
5kt6 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2016-08-31 SER C:131 A:131 0.0 0.0 H -54.6 -49.5 0.0 0.0 0.0 DG
DC
0KX
 9.398
9.717
9.066
 OG
OG
CB
 O5'
O2
C4'
5kt7 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2016-08-31 SER C:131 A:106 1.0 0.009 H -51.0 -48.3 1.0 0.009 0.0 DG
DG
0KX
 9.898
9.079
8.970
 OG
OG
CB
 O3'
O5'
C4'
5kt4 3 Q9UNA4 99.78 0.0 X-RAY
 2016-08-31 SER C:131 A:131 0.0 0.0 H -52.6 -50.7 0.0 0.0 0.0 DG
0KX
HOH
 9.277
9.077
7.093
 OG
CB
OG
 O5'
C4'
O
5kt5 3 Q9UNA4 99.78 0.0 X-RAY
 2016-08-31 SER C:131 A:131 0.0 0.0 H -54.5 -50.6 0.0 0.0 0.0 DG
0KX
HOH
 9.232
9.120
6.700
 OG
CB
O
 O5'
C4'
O
2dpi 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2006-07-04 SER C:106 A:106 1.0 0.009 H -63.0 -37.1 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
DCP
HOH
 9.753
9.834
8.966
8.781
2.782
 OG
OG
OG
OG
O
 O2
O3'
C5'
C5'
O
2dpj 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2006-07-04 SER C:106 A:106 1.0 0.009 H -57.6 -39.8 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
TTP
HOH
 9.772
9.840
8.889
8.847
2.809
 OG
OG
OG
OG
O
 O2
O3'
C5'
O4'
O
2fll 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2006-12-12 SER C:106 A:106 0.0 0.0 H -49.1 -48.4 0.0 0.0 0.0 DOC
DG
DG
TTP
HOH
 9.766
9.837
8.600
8.797
2.878
 OG
OG
OG
OG
O
 O2
O3'
C5'
O4'
O
2fln 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2006-12-05 SER C:106 A:106 0.0 0.0 H -54.6 -44.2 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DG
DOC
HOH
 9.956
9.831
9.151
9.733
2.875
 OG
OG
OG
OG
O
 N2
O3'
C4'
O2
O
2flp 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2006-12-05 SER C:106 A:106 0.0 0.0 H -50.3 -51.2 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DG
DOC
HOH
 9.904
9.759
8.768
9.628
2.842
 OG
OG
OG
OG
O
 N2
O3'
C5'
O2
O
3epg 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2008-12-16 SER A:106 A:106 1.0 0.009 H -65.2 -51.7 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DCP
HOH
 9.587
9.576
8.448
2.924
 OG
OG
OG
O
 O2
O5'
C5'
O
3epi 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2008-12-16 SER A:106 A:106 2.0 0.017 H -61.4 -47.6 2.0 0.017 0.0 DOC
DG
DG
HOH
 9.458
9.507
9.029
2.725
 OG
OG
OG
O
 O2
C2'
O4'
O
3g6v 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-05-12 SER A:106 A:106 0.0 0.0 H -59.0 -44.0 0.0 0.0 0.0 DOC
DG
DG
DG
ATP
HOH
 9.777
9.999
9.633
9.215
8.703
2.932
 OG
OG
OG
OG
OG
O
 O2
N2
C2'
C4'
C4'
O
3g6x 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-05-12 SER A:106 A:106 1.0 0.009 H -57.9 -41.9 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
DGT
HOH
 9.924
9.704
9.081
8.673
2.934
 OG
OG
OG
OG
O
 O2
C2'
C5'
C5'
O
3g6y 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-05-12 SER A:106 A:106 1.0 0.009 H -59.9 -42.6 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
TTP
HOH
 9.868
9.894
8.604
8.714
2.930
 OG
OG
OG
OG
O
 O2
C2'
C5'
C4'
O
3gv5 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-06-02 SER A:106 B:106 1.0 0.009 H -50.5 -48.8 1.0 0.009 0.0 DG
DT
DC
HOH
 9.746
9.642
8.417
2.978
 OG
OG
OG
O
 O3'
O3'
C5'
O
SER D:106 D:106 1.0 0.009 H -53.8 -48.2 NA NA NA
3gv7 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-06-02 SER A:106 B:106 0.0 0.0 H -55.8 -47.5 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DC
TTP
HOH
 9.588
9.041
9.796
8.975
2.744
 OG
OG
OG
CB
O
 O3'
OP1
C2'
C4'
O
3gv8 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-06-02 SER A:106 B:106 0.0 0.0 H -54.6 -47.4 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DC
DGT
MG
HOH
 9.929
9.411
9.818
8.931
8.329
2.887
 OG
CB
OG
OG
OG
O
 C2'
OP1
C2'
O4'
MG
O
3ngd 2 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2010-10-20 SER C:106 A:106 0.0 0.0 H -45.9 -48.2 0.0 0.0 0.0 DOC
DG
DG
DCP
HOH
 9.727
9.740
9.528
9.006
3.042
 OG
OG
OG
OG
O
 O2
C2'
O5'
C4'
O
3osn 2 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2010-10-20 SER C:106 A:106 1.0 0.009 H -61.5 -41.9 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
TTP
HOH
 9.789
9.685
9.488
9.080
2.791
 OG
OG
OG
OG
O
 C1'
C2'
C4'
C4'
O
3q8p 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2011-02-23 SER A:106 B:106 0.0 0.0 H -55.2 -44.9 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DG
DC
DCP
HOH
 9.974
9.674
8.778
9.771
9.937
2.906
 OG
OG
OG
OG
OG
O
 N2
C2'
C5'
O2
O4'
O
3q8q 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2011-02-23 SER A:106 B:106 0.0 0.0 H -53.7 -44.2 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DG
DC
HOH
 9.839
9.712
8.919
9.671
2.798
 OG
OG
OG
OG
O
 N2
C2'
C5'
O2
O
3q8r 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2011-02-23 SER A:106 B:106 0.0 0.0 H -48.4 -48.4 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DG
DC
DGT
HOH
 9.957
9.726
9.250
9.664
9.906
2.903
 OG
OG
OG
OG
OG
O
 N2
C2'
O5'
O2
O4'
O
3q8s 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2011-02-23 SER A:106 B:106 0.0 0.0 H -52.9 -50.1 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DC
TTP
HOH
 9.703
8.754
9.774
9.056
2.802
 OG
OG
OG
OG
O
 O3'
C5'
C2'
C4'
O
4ebc 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2012-06-13 SER A:106 A:106 0.0 0.0 H -48.7 -51.5 0.0 0.0 0.0 DG
0OH
HOH
 9.123
8.054
3.336
 OG
CB
OG
 O5'
CAN
O
4ebd 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2012-06-13 SER A:106 A:106 0.0 0.0 H -47.1 -49.0 0.0 0.0 0.0 DOC
DG
DG
0OJ
HOH
 8.970
9.877
9.246
9.746
2.976
 OG
OG
OG
OG
O
 H1'
C2'
O5'
H5
O
4ebe 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2012-06-13 SER A:106 A:106 0.0 0.0 H -57.7 -46.2 0.0 0.0 0.0 DOC
DG
DG
DTP
HOH
 9.724
9.800
9.297
9.582
2.748
 OG
OG
OG
CB
O
 O2
C2'
O5'
O3'
O
4eyh 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2013-01-09 SER A:106 B:106 0.0 0.0 H -49.8 -50.3 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DCP
HOH
 9.752
8.670
9.666
6.662
 OG
OG
OG
O
 O3'
OP1
C4'
O
4eyi 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2013-01-09 SER A:106 B:106 1.0 0.009 H -53.4 -46.7 1.0 0.009 0.0 DG
DTP
HOH
 9.533
9.767
2.833
 OG
OG
O
 O5'
C4'
O
4fs1 2 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2012-08-29 SER C:106 A:106 0.0 0.0 H -59.8 -33.0 0.0 0.0 0.0 DOC
DG
DG
MG
TTP
HOH
 9.810
9.822
9.320
3.652
9.067
2.846
 OG
OG
OG
OG
CB
O
 O2
C2'
O5'
MG
C4'
O
4fs2 2 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2012-08-29 SER C:106 A:106 1.0 0.009 H -58.0 -41.2 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
DCP
MG
HOH
 9.662
9.658
9.204
8.854
3.669
2.860
 OG
OG
OG
OG
OG
O
 C2'
C2'
O5'
C4'
MG
O
5kt2 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2016-08-31 SER C:106 A:131 1.0 0.009 H -53.9 -48.9 1.0 0.009 0.0 DG
DG
DC
0KX
HOH
 9.854
9.174
9.967
9.152
2.969
 OG
OG
OG
CB
O
 C2'
O5'
C1'
C4'
O
5kt3 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2016-08-31 SER C:106 A:131 1.0 0.009 H -48.3 -50.1 1.0 0.009 0.0 DG
DG
DC
0KX
HOH
 9.839
9.166
9.923
9.071
3.127
 OG
OG
OG
OG
O
 C2'
O5'
O2
O4'
O
5ulw 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2017-04-19 SER C:106 A:106 1.0 0.009 H -49.3 -39.8 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
TTP
HOH
 8.579
9.762
9.341
7.740
3.003
 OG
OG
OG
OG
O
 H2''
C2'
C4'
H5'2
O
5ulx 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2017-04-19 SER C:106 A:106 1.0 0.009 H -58.2 -43.6 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
HOH
 8.941
9.812
9.195
2.801
 OG
OG
OG
O
 H1'
O3'
O5'
O
2alz 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2005-10-25 SER C:82 A:106 1.0 0.009 H -55.1 -38.2 1.0 0.009 0.0 DG
DG
DOC
DCP
HOH
 9.864
8.809
9.844
8.799
2.894
 CB
OG
OG
OG
O
 O3'
C5'
O2
C4'
O
3h4b 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-07-21 SER A:82 A:106 1.0 0.009 H -59.9 -38.9 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
DG
HOH
 9.642
9.905
9.853
9.201
3.335
 OG
OG
OG
OG
O
 O4'
N2
O3'
C4'
O
3h4d 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-07-21 SER A:82 A:106 1.0 0.009 H -56.2 -42.6 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DGT
HOH
 9.796
9.313
8.977
2.873
 OG
OG
OG
O
 O4'
C4'
C4'
O
3h40 1 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2009-07-21 SER A:81 A:106 1.0 0.009 H -54.5 -44.1 1.0 0.009 0.0 DOC
DG
DG
HOH
 9.687
9.996
9.346
3.117
 OG
OG
OG
O
 O2
O3'
C4'
O
1t3n 3 Q9UNA4 100.0 0.0 X-RAY
 2004-07-20 SER C:80 A:106 1.0 0.009 H -56.4 -42.4 1.0 0.009 0.0 DG
DG
HOH
 9.302
8.809
2.884
 OG
OG
O
 O3'
O5'
O
SER D:80 B:526 0.0 0.0 H -54.4 -46.5 0.0 0.0 0.0 DG
DG
DG
DOC
TTP
HOH
 9.724
9.535
9.431
9.738
8.676
2.783
 OG
CB
OG
OG
OG
O
 N2
O3'
OP1
C2'
C4'
O
1zet 3 21619716 100.0 0.0 X-RAY
 2005-07-19 SER C:80 A:106 1.0 0.009 H -53.3 -47.8 1.0 0.009 0.0 DG
DG
DG
DOC
TTP
HOH
 9.922
9.015
8.680
9.590
8.661
2.803
 OG
OG
OG
OG
CB
O
 N2
O3'
OP1
O2
C4'
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q9una4-f1 1 Q9UNA4 100.0 0.0 SER A:131 A:131 0.0 0.0 H -63.9 -38.4