Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr19 49458972 . G A CCDS12742.1:NM_138761.3:c.115Ggg>Agg_NP_620116.1:p.39G>R Homo sapiens BCL2 associated X, apoptosis regulator (BAX), transcript variant alpha, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
2lr1 1 Q07812 100.0 2e-140 NMR
 2012-12-05 GLY A:39 A:39 77.0 1.0 T 83.7 9.7 77.0 1.0 0.0
4s0p 1 Q07812 99.48 3e-139 X-RAY
 2016-07-20 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6eb6 1 Q07812 99.48 4e-139 X-RAY
 2019-04-10 GLY A:39 A:39 32.0 0.427 H -150.6 16.7 32.0 0.427 0.0 HOH
 6.267
 N
 O
4s0o 1 Q07812 99.48 6e-139 X-RAY
 2016-07-20 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5w5x 3 Q07812 98.44 1e-136 X-RAY
 2018-06-27 GLY C:39 A:39 70.0 0.933 T 81.1 -11.5 5.0 0.067 0.866 B:None:0.04
A:None:0.867
 HOH
 7.355
 C
 O
5w60 1 Q07812 98.44 1e-136 X-RAY
 2018-06-27 GLY A:39 A:39 4.0 0.053 S 52.9 -75.4 4.0 0.053 0.0 HOH
 3.198
 CA
 O
5w61 1 Q07812 98.44 1e-136 X-RAY
 2018-06-27 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5w62 1 Q07813 91.15 3e-125 X-RAY
 2018-06-27 ALA A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bd2 1 Q07812 98.83 1e-122 X-RAY
 2013-02-13 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bd6 1 Q07812 98.83 1e-122 X-RAY
 2013-02-13 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bd7 1 Q07812 98.83 1e-122 X-RAY
 2013-02-13 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY C:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY D:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bd8 1 Q07812 98.83 1e-122 X-RAY
 2013-02-13 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY C:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY D:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4zii 1 Q07812 98.82 1e-121 X-RAY
 2015-07-22 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4zie 1 Q07812 98.2 2e-118 X-RAY
 2015-07-22 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4zif 1 Q07812 98.2 2e-118 X-RAY
 2015-07-22 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4zig 1 Q07812 98.2 2e-118 X-RAY
 2015-07-22 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4zih 1 Q07812 98.78 2e-116 X-RAY
 2015-07-22 GLY A:39 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5w5z 3 Q07812 98.14 3e-113 X-RAY
 2018-06-27 GLY C:8 A:39 58.0 0.773 T 90.4 -10.2 0.0 0.0 0.773 B:None:0.08
A:None:0.747
 HOH
 5.174
 C
 O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q07812-f1 1 Q07812 100.0 1e-140 GLY A:39 A:39 65.0 0.867 71.4 131.5