Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr19 | 10568755 | . | G | A | CCDS58649.1:NM_001243121.1:c.1012Gat>Aat_NP_001230050.1:p.338D>N | Homo sapiens phosphodiesterase 4A (PDE4A), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
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X-RAY |
2016-12-21 | GLU | A:2 | A:87 | 172.0 | 0.905 | 360.0 | -10.4 | 172.0 | 0.905 | 0.0 | |||||||
| GLU | B:2 | B:87 | 163.0 | 0.858 | H | -53.2 | -48.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | C:2 | C:87 | 174.0 | 0.916 | 360.0 | -47.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| GLU | D:2 | D:87 | 154.0 | 0.811 | H | -39.8 | -50.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | E:2 | E:87 | 190.0 | 1.0 | 360.0 | 5.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| GLU | F:2 | F:87 | 149.0 | 0.784 | T | -77.8 | 36.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | G:2 | G:87 | 183.0 | 0.963 | 360.0 | -26.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| GLU | H:2 | H:87 | 147.0 | 0.774 | H | -50.3 | -27.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6kk0 | 1 | Q08499 | 85.54 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-18 | GLU | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:2 | B:87 | 148.0 | 0.779 | H | -54.6 | -47.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2pw3 | 1 | Q08499 | 85.02 | 0.0 |
X-RAY |
2007-10-23 | GLU | A:2 | A:87 | 147.0 | 0.774 | T | -73.8 | 2.3 | 147.0 | 0.774 | 0.0 |
HOH |
6.943 |
O |
O |
||
| GLU | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2qyl | 1 | Q5T3Z8 | 87.16 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-08 | GLU | A:11 | A:161 | 150.0 | 0.789 | S | -88.6 | -2.9 | 150.0 | 0.789 | 0.0 |
HOH |
4.849 |
CG |
O |
||
| 4kp6 | 1 | Q07343 | 87.16 | 0.0 |
X-RAY |
2013-07-10 | GLU | A:14 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3ly2 | 1 | Q07343 | 87.16 | 0.0 |
X-RAY |
2010-04-28 | GLU | A:31 | A:161 | 132.0 | 0.695 | G | -59.3 | -26.2 | 132.0 | 0.695 | 0.0 |
HOH |
6.055 |
C |
O |
||
| GLU | B:31 | B:161 | 131.0 | 0.689 | H | -67.3 | -12.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | C:31 | C:161 | 87.0 | NA | S | -117.7 | -31.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | D:31 | D:161 | 69.0 | NA | H | -73.7 | -28.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | E:31 | E:161 | 89.0 | NA | S | -117.7 | -31.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | F:31 | F:161 | 75.0 | NA | H | -76.2 | -27.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | G:31 | G:161 | 103.0 | 0.542 | H | -61.0 | -55.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | H:31 | H:161 | 52.0 | NA | H | -60.1 | -54.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p27815-f1 | 1 | P27815 | 100.0 | 0.0 | ASP | A:360 | A:360 | 177.0 | 1.0 | S | -82.0 | -8.8 | |