Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr19 10577735 . A C CCDS58649.1:NM_001243121.1:c.2033cAc>cCc_NP_001230050.1:p.678H>P Homo sapiens phosphodiesterase 4A (PDE4A), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
3g4i 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 ARG A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g4k 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 ARG A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g4l 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 ARG A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g58 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 ARG A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5tkb 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2016-12-28 ARG A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2fm0 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2006-03-28 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2fm5 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2006-03-28 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl3 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl4 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl6 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl8 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ogb 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2015-01-21 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5lbo 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2018-03-14 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6akr 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2020-02-12 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fdi 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-10 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fe7 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-10 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6feb 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-10 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fet 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-24 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ft0 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fta 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ftw 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fw3 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6hwo 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-07-24 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6iag 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-12-18 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ibf 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-12-18 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6rcw 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-07-24 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7a8q 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7a9v 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7aag 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7ab9 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7abd 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7abe 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7abj 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 ARG A:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:351 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1oyn 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2003-07-15 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1ptw 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2003-11-11 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1q9m 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2003-09-02 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3v9b 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2012-01-18 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w1o 1 Q08499 82.83 0.0 X-RAY
2014-11-05 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4wcu 1 Q08499 82.83 0.0 X-RAY
2014-10-08 ARG A:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:347 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6zba 1 Q08499 82.78 0.0 X-RAY
2020-09-23 ARG A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl5 1 Q08499 82.14 0.0 X-RAY
2011-10-26 GLN A:350 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:350 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:350 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:350 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4myq 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2014-01-01 CYS A:352 A:671 113.0 0.837 360.0 -34.5 113.0 0.837 0.0 19T
HOH
6.942
7.536
O
SG
CL1
O
4nw7 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2014-10-15 CYS A:352 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1tb5 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-08-03 CYS A:352 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:352 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3w5e 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2013-05-29 CYS A:348 A:499 100.0 0.741 360.0 160.8 100.0 0.741 0.0 HOH
3.279
N
O
CYS B:348 B:499 102.0 0.756 360.0 136.0 NA NA NA
3wd9 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2013-10-23 CYS A:348 A:499 104.0 0.77 360.0 179.8 104.0 0.77 0.0 HOH
3.907
CB
O
CYS B:348 B:499 97.0 0.719 360.0 99.5 NA NA NA
1xlx 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xlz 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xm4 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xm4 2 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xm6 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 A:499 122.0 0.904 360.0 -57.3 122.0 0.904 0.0 HOH
5.780
SG
O
CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xmu 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xmu 2 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xmy 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xmy 2 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xn0 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xos 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xot 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1y2h 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2005-03-01 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1y2j 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2005-03-01 CYS A:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:369 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3kkt 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2009-11-24 CYS A:369 A:499 15.0 0.111 S -71.7 165.3 15.0 0.111 0.0 HOH
2.665
O
O
CYS B:369 B:499 110.0 0.815 360.0 138.2 NA NA NA
1ro6 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2004-12-07 CYS A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1ro9 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2004-12-07 CYS A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1ror 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2004-12-07 CYS A:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
CYS B:349 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1f0j 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2000-07-26 CYS A:348 A:499 33.0 0.244 H -32.2 -53.5 33.0 0.244 0.0 ZN
MG
ARS
ARS
HOH
9.633
8.219
6.039
2.379
2.622
SG
CB
SG
SG
N
ZN
MG
AS
AS
O
CYS B:348 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3hmv 1 Q07343 83.42 0.0 X-RAY
2010-06-09 CYS A:349 A:499 21.0 0.156 H -86.1 -0.2 21.0 0.156 0.0 HOH
3.224
C
O
CYS B:349 B:499 17.0 0.126 H -97.0 -5.3 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p27815-f1 1 P27815 100.0 0.0 HIS A:700 A:700 180.0 0.923 -97.1 136.6