Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr19 10577761 . T A CCDS58649.1:NM_001243121.1:c.2059Ttt>Att_NP_001230050.1:p.687F>I Homo sapiens phosphodiesterase 4A (PDE4A), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
3g4i 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g4k 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g4l 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3g58 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2010-01-19 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:358 D:600 147.0 0.7 T -74.3 -19.8 NA NA NA
5tkb 1 Q08499 81.57 0.0 X-RAY
2016-12-28 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2fm0 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2006-03-28 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2fm5 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2006-03-28 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl3 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl4 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl6 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl8 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2011-10-26 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ogb 1 Q08499 82.92 0.0 X-RAY
2015-01-21 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5lbo 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2018-03-14 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6akr 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2020-02-12 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fdi 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-10 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fe7 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-10 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6feb 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-10 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fet 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-04-24 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ft0 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fta 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ftw 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fw3 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-03-20 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6hwo 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-07-24 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6iag 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-12-18 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ibf 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-12-18 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6rcw 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2019-07-24 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7a8q 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7a9v 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7aag 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7ab9 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7abd 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7abe 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7abj 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2021-10-06 PHE A:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:360 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1oyn 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2003-07-15 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1ptw 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2003-11-11 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1q9m 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2003-09-02 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3v9b 1 Q08499 82.87 0.0 X-RAY
2012-01-18 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w1o 1 Q08499 82.83 0.0 X-RAY
2014-11-05 PHE A:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:356 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4wcu 1 Q08499 82.83 0.0 X-RAY
2014-10-08 PHE A:356 A:434 145.0 0.69 H -60.9 -46.3 145.0 0.69 0.0 3KQ
HOH
7.648
7.335
N
O
O25
O
PHE B:356 B:434 156.0 0.743 -64.0 360.0 156.0 0.743 0.0 3KQ
HOH
7.529
6.361
N
O
O25
O
PHE C:356 C:434 145.0 0.69 H -62.8 -54.2 145.0 0.69 0.0 3KQ
HOH
7.475
9.348
N
CE2
O25
O
PHE D:356 D:434 141.0 0.671 H -67.2 -52.5 141.0 0.671 0.0 3KQ
HOH
7.802
8.189
N
CD1
O25
O
6zba 1 Q08499 82.78 0.0 X-RAY
2020-09-23 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sl5 1 Q08499 82.14 0.0 X-RAY
2011-10-26 PHE A:354 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:354 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE C:354 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE D:354 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4myq 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2014-01-01 PHE A:361 A:680 131.0 NA 93.1 360.0 131.0 NA NA HOH
2.965
N
O
4nw7 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2014-10-15 PHE A:361 A:680 132.0 NA 71.6 360.0 132.0 NA NA HOH
3.131
N
O
1tb5 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-08-03 PHE A:361 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:361 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3w5e 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2013-05-29 PHE A:357 A:508 129.0 0.614 H -61.4 -36.7 129.0 0.614 0.0 NVW
HOH
8.077
3.477
C
CD2
C25
O
PHE B:357 B:508 162.0 0.771 H -61.4 -31.3 NA NA NA
3wd9 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2013-10-23 PHE A:357 A:508 139.0 0.662 H -59.8 -51.8 139.0 0.662 0.0 QPC
HOH
8.067
3.362
N
CD2
C22
O
PHE B:357 B:508 164.0 0.781 H -46.8 -51.8 NA NA NA
1xlx 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xlz 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xm4 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xm4 2 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xm6 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 A:508 94.0 0.448 H -74.0 -41.1 94.0 0.448 0.0 5RM
HOH
8.410
5.232
O
O
O19
O
PHE B:378 B:508 129.0 0.614 H -69.2 -34.0 NA NA NA
1xmu 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xmu 2 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xmy 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xmy 2 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xn0 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xos 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1xot 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2004-12-14 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1y2h 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2005-03-01 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1y2j 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2005-03-01 PHE A:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:378 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3kkt 1 Q07343 84.24 0.0 X-RAY
2009-11-24 PHE A:378 A:508 158.0 0.752 85.2 39.3 158.0 0.752 0.0 HOH
7.882
O
O
PHE B:378 B:508 144.0 0.686 H -70.0 -33.3 NA NA NA
1ro6 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2004-12-07 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1ro9 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2004-12-07 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1ror 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2004-12-07 PHE A:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PHE B:358 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1f0j 1 Q07343 83.7 0.0 X-RAY
2000-07-26 PHE A:357 A:508 108.0 0.514 -72.4 360.0 108.0 0.514 0.0 HOH
3.205
O
O
PHE B:357 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3hmv 1 Q07343 83.42 0.0 X-RAY
2010-06-09 PHE A:358 A:508 33.0 0.157 -55.6 124.4 33.0 0.157 0.0 HBT
HOH
9.405
3.944
CE1
CB
C9
O
PHE B:358 B:508 33.0 0.157 -58.1 130.1 NA NA NA
2qym 1 Q7KYS4 81.27 0.0 X-RAY
2008-04-08 PHE A:353 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p27815-f1 1 P27815 100.0 0.0 PHE A:709 A:709 125.0 0.595 -66.1 112.8