Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr19 | 11031391 | . | G | A | CCDS12250.1:NM_199141.1:c.1391aGt>aAt_NP_954592.1:p.464S>N | Homo sapiens coactivator associated arginine methyltransferase 1 (CARM1), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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|
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PDB
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O |
O |
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O |
O |
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H |
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O |
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H |
O |
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O |
O |
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C1 O |
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O |
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O |
O |
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O |
O |
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N |
O |
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X-RAY |
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O |
O |
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H |
O |
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B:Q9WVG6:0.009 |
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O |
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H |
O |
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H11 O |
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O |
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||||||||||||
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X-RAY |
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O |
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X-RAY |
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O |
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O |
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HA |
O |
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H |
O |
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X-RAY |
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|||||||||
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H |
O |
|||||||||
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O |
|||||||||
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X-RAY |
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||||||||
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X-RAY |
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O H |
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H |
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|||||||||
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|||||||||
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O |
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X-RAY |
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||||||||||||
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O |
||
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|||||||||
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O |
|||||||||
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||||||||
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2017-06-21 | SER | A:339 | A:465 | 46.0 | 0.4 | E | -153.2 | -175.7 | 46.0 | 0.4 | 0.0 |
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H11 O |
||
| SER | B:339 | B:465 | 76.0 | 0.661 | E | -122.4 | 134.2 | 76.0 | 0.661 | 0.0 |
HOH |
1.947 |
HG |
O |
|||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 45.0 | 0.391 | E | -165.5 | 173.4 | 45.0 | 0.391 | 0.0 |
HOH |
2.808 |
HB2 |
O |
|||||||||
| SER | D:339 | D:465 | 87.0 | 0.757 | E | -127.0 | 127.9 | 87.0 | 0.757 | 0.0 |
HOH |
2.284 |
H |
O |
|||||||||
| 5k8x | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-06-21 | SER | A:339 | A:465 | 46.0 | 0.4 | E | -144.3 | -176.0 | 46.0 | 0.4 | 0.0 |
PE8 HOH |
3.036 2.318 |
OG H |
H92 O |
||
| SER | B:339 | B:465 | 69.0 | 0.6 | E | -139.1 | 160.7 | 68.0 | 0.591 | 0.009 |
D:Q9WVG6:0.009 |
HOH |
2.049 |
HG |
O |
||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 48.0 | 0.417 | E | -162.8 | 174.2 | 48.0 | 0.417 | 0.0 |
PEG HOH |
6.480 3.014 |
O HB2 |
H12 O |
|||||||||
| SER | D:339 | D:465 | 79.0 | 0.687 | E | -149.7 | 118.0 | 78.0 | 0.678 | 0.009 |
B:Q9WVG6:0.009 |
HOH |
2.496 |
H |
O |
||||||||
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X-RAY |
2017-03-22 | SER | A:339 | A:465 | 47.0 | 0.409 | E | -146.4 | 170.9 | 47.0 | 0.409 | 0.0 |
HOH |
2.630 |
H |
O |
||
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HOH |
1.681 |
H |
O |
|||||||||
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HOH |
2.781 |
HB2 |
O |
|||||||||
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HOH |
2.365 |
H |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2017-03-22 | SER | A:339 | A:465 | 48.0 | 0.417 | E | -143.5 | -178.7 | 48.0 | 0.417 | 0.0 |
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2.175 2.752 |
HG H |
H121 O |
||
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HOH |
1.966 |
H |
O |
|||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 45.0 | 0.391 | E | -154.8 | 178.7 | 45.0 | 0.391 | 0.0 |
EDO HOH |
6.481 2.820 |
O HB2 |
O2 O |
|||||||||
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HOH |
2.405 |
H |
O |
|||||||||
| 5lgr | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-22 | SER | A:339 | A:465 | 45.0 | 0.391 | E | -156.1 | 175.3 | 45.0 | 0.391 | 0.0 |
HOH |
2.581 |
OG |
O |
||
| SER | B:339 | B:465 | 68.0 | 0.591 | E | -133.8 | 135.7 | 68.0 | 0.591 | 0.0 |
HOH |
2.411 |
H |
O |
|||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 47.0 | 0.409 | E | -159.5 | 175.2 | 47.0 | 0.409 | 0.0 |
HOH |
2.784 |
HB2 |
O |
|||||||||
| SER | D:339 | D:465 | 70.0 | 0.609 | E | -130.9 | 138.0 | 70.0 | 0.609 | 0.0 |
HOH |
2.320 |
H |
O |
|||||||||
| 5lgs | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-22 | SER | A:339 | A:465 | 44.0 | 0.383 | E | -155.0 | 178.5 | 44.0 | 0.383 | 0.0 |
HOH |
2.655 |
H |
O |
||
| SER | B:339 | B:465 | 79.0 | 0.687 | E | -114.8 | 135.7 | 79.0 | 0.687 | 0.0 |
HOH |
3.785 |
H |
O |
|||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 47.0 | 0.409 | E | -158.8 | 178.0 | 47.0 | 0.409 | 0.0 |
HOH |
6.398 |
HB2 |
O |
|||||||||
| SER | D:339 | D:465 | 91.0 | 0.791 | E | -122.1 | 129.3 | 91.0 | 0.791 | 0.0 |
HOH |
2.374 |
H |
O |
|||||||||
| 5lv2 | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | SER | A:339 | A:465 | 54.0 | 0.47 | E | -132.4 | 159.1 | 54.0 | 0.47 | 0.0 |
HOH |
6.601 |
HB3 |
O |
||
| SER | B:339 | B:465 | 71.0 | 0.617 | E | -130.4 | 141.0 | 71.0 | 0.617 | 0.0 |
HOH |
2.339 |
H |
O |
|||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 49.0 | 0.426 | E | -135.9 | 157.8 | 49.0 | 0.426 | 0.0 |
HOH |
6.115 |
O |
O |
|||||||||
| SER | D:339 | D:465 | 74.0 | 0.643 | E | -129.2 | 144.0 | 74.0 | 0.643 | 0.0 |
HOH |
2.044 |
H |
O |
|||||||||
| SER | E:339 | E:465 | 48.0 | 0.417 | -129.7 | -170.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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| SER | G:339 | G:465 | 58.0 | 0.504 | E | -136.1 | 161.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | H:339 | H:465 | 76.0 | 0.661 | E | -129.9 | 144.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5lv3 | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | SER | A:339 | A:465 | 46.0 | 0.4 | E | -154.7 | 175.4 | 46.0 | 0.4 | 0.0 |
HOH |
2.233 |
HG |
O |
||
| SER | B:339 | B:465 | 80.0 | 0.696 | E | -123.9 | 135.1 | 80.0 | 0.696 | 0.0 |
HOH |
1.998 |
H |
O |
|||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 54.0 | 0.47 | E | -161.7 | 173.1 | 54.0 | 0.47 | 0.0 |
HOH |
2.910 |
HB2 |
O |
|||||||||
| SER | D:339 | D:465 | 79.0 | 0.687 | E | -130.5 | 124.3 | 79.0 | 0.687 | 0.0 |
HOH |
2.212 |
H |
O |
|||||||||
| 5tbh | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | SER | A:339 | A:465 | 51.0 | 0.443 | -132.2 | 179.0 | 51.0 | 0.443 | 0.0 |
HOH |
6.917 |
HA |
O |
|||
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HOH |
2.124 |
H |
O |
|||||||||
| SER | C:339 | C:465 | 53.0 | 0.461 | E | -144.4 | 161.5 | 53.0 | 0.461 | 0.0 |
HOH |
6.381 |
HB2 |
O |
|||||||||
| SER | D:339 | D:465 | 74.0 | 0.643 | E | -134.1 | 137.5 | 74.0 | 0.643 | 0.0 |
HOH |
2.347 |
H |
O |
|||||||||
| 5tbi | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | SER | A:339 | A:465 | 52.0 | 0.452 | E | -127.4 | 155.2 | 52.0 | 0.452 | 0.0 |
HOH |
2.188 |
H |
O |
||
| SER | B:339 | B:465 | 74.0 | 0.643 | E | -125.1 | 145.7 | 74.0 | 0.643 | 0.0 |
HOH |
2.358 |
H |
O |
|||||||||
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EDO HOH |
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O HB3 |
HO1 O |
|||||||||
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HOH |
2.353 |
H |
O |
|||||||||
| 5tbj | 1 | Q9WVG6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | SER | A:339 | A:465 | 48.0 | 0.417 | E | -132.4 | 158.2 | 48.0 | 0.417 | 0.0 |
HOH |
3.150 |
HB3 |
O |
||
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HOH |
2.518 |
H |
O |
|||||||||
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HOH |
3.300 |
H |
O |
|||||||||
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HOH |
2.137 |
H |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2011-03-23 | SER | A:330 | A:465 | 52.0 | 0.452 | E | -153.3 | -177.3 | 52.0 | 0.452 | 0.0 |
HOH |
8.125 |
N |
O |
||
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HOH |
2.972 |
N |
O |
|||||||||
| SER | C:330 | C:465 | 67.0 | 0.583 | E | -128.1 | 130.1 | 67.0 | 0.583 | 0.0 |
HOH |
7.161 |
CB |
O |
|||||||||
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HOH |
3.721 |
O |
O |
|||||||||
| 2y1x | 1 | Q86X55 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-03-23 | SER | A:330 | A:465 | 50.0 | 0.435 | E | -153.2 | 172.5 | NA | NA | NA | ||||||
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HOH |
2.862 |
N |
O |
|||||||||
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HOH |
7.259 |
CB |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2015-11-25 | SER | A:334 | A:464 | 75.0 | 0.652 | E | -112.2 | 131.7 | 75.0 | 0.652 | 0.0 |
HOH |
5.818 |
N |
O |
||
| SER | B:334 | B:464 | 52.0 | 0.452 | E | -156.9 | 174.9 | 52.0 | 0.452 | 0.0 |
HOH |
3.784 |
CB |
O |
|||||||||
| SER | C:334 | C:464 | 75.0 | 0.652 | E | -113.3 | 133.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
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X-RAY |
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N |
O |
||
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N |
O |
|||||||||
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X-RAY |
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HOH |
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OG |
O |
||
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N |
O |
|||||||||
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X-RAY |
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O |
O |
||
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O |
O |
|||||||||
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||
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|||||||||
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O |
O |
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O |
|||||||||
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||
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O |
|||||||||
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||
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|||||||||
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