Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr19 | 19261516 | . | C | A | CCDS12394.1:NM_005919.3:c.29cGc>cTc_NP_005910.1:p.10R>L | Homo sapiens BORCS8-MEF2B readthrough (BORCS8-MEF2B), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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HOH |
2.865 |
N |
O |
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C:Q02080:0.244 |
HOH |
2.573 |
NE |
O |
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1tqe | 3 | Q02080 | 100.0 | 2e-63 |
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2004-12-21 | ARG | E:10 | P:10 | 150.0 | 0.667 | -27.6 | 110.2 | 102.0 | 0.453 | 0.214 |
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E:Q02080:0.209 |
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6c9l | 1 | Q02080 | 100.0 | 2e-63 |
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2018-02-07 | ARG | A:10 | A:10 | 198.0 | 0.88 | -81.6 | 133.7 | 128.0 | 0.569 | 0.311 |
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NE |
O |
||
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HOH |
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O |
O |
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ARG | F:10 | F:10 | 189.0 | 0.84 | -82.8 | 134.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6wc5 | 1 | Q02080 | 100.0 | 5e-61 |
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2020-07-22 | ARG | A:9 | A:10 | 195.0 | 0.867 | -41.0 | 120.3 | 130.0 | 0.578 | 0.289 |
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A:Q02080:0.258 |
|||||||||||||
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ARG | D:9 | D:10 | 184.0 | 0.818 | -42.9 | 121.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6byy | 1 | Q02078,Q02080 | 93.41 | 5e-59 |
X-RAY |
2018-01-31 | ARG | A:10 | A:10 | 119.0 | 0.529 | -58.2 | 126.1 | 63.0 | 0.28 | 0.249 |
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HOH |
2.432 |
NH2 |
O |
||
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A:Q02078+Q02080:0.227 |
HOH |
2.819 |
O |
O |
|||||||||
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6wc2 | 1 | Q02078,Q02080 | 93.41 | 5e-59 |
X-RAY |
2020-07-22 | ARG | A:10 | A:10 | 138.0 | 0.613 | -59.4 | 131.5 | 84.0 | 0.373 | 0.24 |
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HOH |
9.296 |
C |
O |
||
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A:Q02078+Q02080:0.378 |
HOH |
3.025 |
N |
O |
|||||||||
ARG | C:10 | C:10 | 165.0 | 0.733 | -57.8 | 129.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ARG | D:10 | D:10 | 137.0 | 0.609 | -53.7 | 128.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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ARG | J:10 | J:10 | 185.0 | 0.822 | -60.1 | 130.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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||||||
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A:Q02078+Q02080:0.249 |
|||||||||||||
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5f28 | 1 | Q8CFN5 | 85.71 | 1e-54 |
X-RAY |
2016-07-13 | ARG | A:10 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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2010-02-16 | ARG | A:9 | A:10 | 187.0 | 0.831 | -46.8 | 117.6 | 120.0 | 0.533 | 0.298 |
B:Q02078:0.298 |
DA DA |
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C O |
OP1 OP2 |
||
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A:Q02078:0.276 |
DA |
9.416 |
O |
OP2 |
|||||||||
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ARG | D:9 | J:10 | 181.0 | 0.804 | -53.8 | 117.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3p57 | 1 | Q02078 | 85.56 | 5e-54 |
X-RAY |
2011-08-10 | ARG | A:9 | A:10 | 193.0 | 0.858 | -55.0 | 132.4 | 123.0 | 0.547 | 0.311 |
B:Q02078:0.311 |
HOH |
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N |
O |
||
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A:Q02078:0.338 |
HOH |
2.662 |
O |
O |
|||||||||
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D:Q02078:0.298 |
HOH |
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C |
O |
|||||||||
ARG | D:9 | D:10 | 193.0 | 0.858 | -51.2 | 126.3 | 126.0 | 0.56 | 0.298 |
C:Q02078:0.298 |
HOH |
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O |
O |
|||||||||
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F:Q02078:0.342 |
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2.842 |
NH2 |
O |
|||||||||
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E:Q02078:0.316 |
HOH |
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CD |
O |
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N |
O |
||
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E:Q02078:0.244 |
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O |
|||||||||
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X-RAY |
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AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
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ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q02080-f1 | 1 | Q02080 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:10 | A:10 | 180.0 | 0.8 | -66.1 | 117.9 |