Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr19 | 42474643 | . | C | A | CCDS12594.1:NM_152296.4:c.2315aGc>aTc_NP_689509.1:p.772S>I | Homo sapiens ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3 (ATP1A3), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3wgu | 1 | I7HD36 | 88.01 | 0.0 |
X-RAY |
2013-10-09 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -32.9 | -34.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NA NA NA HOH |
6.497 3.234 3.119 5.107 |
OG OG OG OG |
NA NA NA O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -32.0 | -37.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3wgv | 1 | I7HD36 | 88.01 | 0.0 |
X-RAY |
2013-10-09 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -38.1 | -29.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NA NA NA HOH |
6.655 3.148 3.540 4.805 |
OG OG OG OG |
NA NA NA O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -54.4 | -20.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4xe5 | 1 | Q08DA1 | 87.61 | 0.0 |
X-RAY |
2016-03-09 | SER | A:780 | A:780 | 0.0 | 0.0 | H | -74.9 | -25.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG OBN HOH |
3.685 9.392 2.205 |
OG O OG |
MG O21 O |
||
4hqj | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2013-10-02 | SER | A:780 | A:775 | 0.0 | 0.0 | H | -69.3 | -29.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NA NA NA |
5.990 2.402 3.134 |
OG OG N |
NA NA NA |
||
SER | D:780 | C:775 | 1.0 | 0.009 | H | -67.6 | -30.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4hyt | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2013-06-26 | SER | A:780 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -76.6 | -15.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG OBN HOH |
4.122 9.717 2.678 |
OG O OG |
MG O21 O |
||
SER | D:780 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -76.3 | -15.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4res | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2015-01-28 | SER | A:780 | A:775 | 0.0 | 0.0 | H | -76.8 | -14.9 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
BUF K K |
8.876 2.920 7.011 |
O OG OG |
O24 K K |
||
SER | D:780 | C:775 | 0.0 | 0.0 | H | -76.1 | -15.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4ret | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2015-01-28 | SER | A:780 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -73.3 | -16.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG DGX HOH |
3.950 9.605 2.532 |
OG O OG |
MG O21 O |
||
SER | D:780 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -73.0 | -16.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7evx | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-07-07 | SER | A:780 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -64.8 | -12.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG HOH |
4.607 3.411 |
OG OG |
MG O |
||
SER | D:780 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -64.2 | -11.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7d91 | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 1.0 | 0.009 | T | -71.0 | -17.1 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
MG HOH |
5.145 6.992 |
OG O |
MG O |
||
7d92 | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -69.6 | -12.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG HOH |
5.024 3.362 |
OG OG |
MG O |
||
7d93 | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -66.9 | -7.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG H0C HOH |
4.782 9.916 3.537 |
OG O OG |
MG O8 O |
||
SER | C:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -66.1 | -7.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7d94 | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -73.9 | -8.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG RB BUF HOH |
6.423 2.710 9.345 5.745 |
OG OG O OG |
MG RB O24 O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -71.9 | -6.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ddf | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -65.4 | -10.4 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG HOH |
4.895 3.449 |
OG OG |
MG O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -66.2 | -9.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ddh | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -66.1 | -10.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG DGX HOH |
4.890 9.605 3.727 |
OG O OG |
MG O21 O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -65.7 | -9.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ddi | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -66.4 | -10.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG F9R HOH |
5.024 9.648 3.690 |
OG O OG |
MG O21 O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -65.0 | -11.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ddj | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -67.4 | -6.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG OBN HOH |
4.941 9.639 3.727 |
OG O OG |
MG O21 O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -66.6 | -6.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ddk | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -65.8 | -10.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG E4R HOH |
5.055 9.591 3.680 |
OG O OG |
MG O23 O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -65.6 | -8.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ddl | 1 | P05024 | 87.51 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-27 | SER | A:775 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -72.1 | 0.6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
MG BUF HOH |
4.853 8.903 3.628 |
OG O OG |
MG O24 O |
||
SER | D:775 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -70.8 | 0.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3b8e | 1 | P05024 | 87.58 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | SER | A:757 | A:775 | 1.0 | 0.009 | T | -68.1 | 4.4 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
RB RB |
3.242 5.917 |
OG O |
RB RB |
||
SER | D:757 | C:775 | 3.0 | 0.026 | S | -89.6 | -4.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3kdp | 1 | P05024 | 87.58 | 0.0 |
X-RAY |
2010-02-16 | SER | A:757 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -77.2 | -2.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
RB RB |
2.913 6.402 |
OG O |
RB RB |
||
SER | D:757 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -75.7 | -2.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3n23 | 1 | P05024 | 87.8 | 0.0 |
X-RAY |
2011-01-19 | SER | A:751 | A:775 | 0.0 | 0.0 | T | -60.1 | -20.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||
SER | D:751 | C:775 | 0.0 | 0.0 | T | -59.5 | -19.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2zxe | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2009-05-19 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K K HOH |
2.718 5.715 3.238 |
OG O OG |
K K O |
||
3a3y | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-08 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -67.8 | -13.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K K HOH |
3.291 5.981 3.347 |
OG O OG |
K K O |
||
5avq | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K TL K TL HOH |
2.718 2.718 5.717 5.717 3.238 |
OG OG O O OG |
K TL K TL O |
||
5avr | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K TL K TL HOH |
2.718 2.718 5.715 5.715 3.239 |
OG OG O O OG |
K TL K TL O |
||
5avs | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K TL TL HOH |
2.718 2.718 5.716 3.238 |
OG OG O OG |
K TL TL O |
||
5avt | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.4 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K TL TL HOH |
2.717 2.717 5.715 3.239 |
OG OG O OG |
K TL TL O |
||
5avu | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.8 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K TL TL HOH |
2.718 2.718 5.714 3.239 |
OG OG O OG |
K TL TL O |
||
5avv | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.718 5.716 3.238 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5avw | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -75.0 | -1.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.718 5.715 3.239 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5avx | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -75.0 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.718 5.715 3.237 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5avy | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -75.0 | -1.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.718 5.715 3.238 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5avz | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.718 5.716 3.239 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5aw0 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.718 5.717 3.238 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5aw1 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K TL TL HOH |
2.718 2.718 5.714 3.238 |
OG OG O OG |
K TL TL O |
||
5aw2 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.718 5.716 3.238 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5aw3 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
TL TL HOH |
2.719 5.716 3.239 |
OG O OG |
TL TL O |
||
5aw4 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K RB K RB HOH |
2.720 2.720 5.715 5.715 3.239 |
OG OG O O OG |
K RB K RB O |
||
5aw5 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K RB K RB HOH |
2.719 2.719 5.715 5.715 3.240 |
OG OG O O OG |
K RB K RB O |
||
5aw6 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K RB K RB HOH |
2.718 2.718 5.716 5.716 3.238 |
OG OG O O OG |
K RB K RB O |
||
5aw7 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -75.0 | -1.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K RB RB HOH |
2.718 2.718 5.716 3.239 |
OG OG O OG |
K RB RB O |
||
5aw8 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -74.9 | -1.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
RB RB HOH |
2.719 5.717 3.240 |
OG O OG |
RB RB O |
||
5aw9 | 1 | Q4H132 | 85.56 | 0.0 |
X-RAY |
2015-09-02 | SER | A:787 | A:782 | 0.0 | 0.0 | T | -69.8 | 0.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
K K HOH |
2.826 5.621 3.296 |
OG O OG |
K K O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p13637-f1 | 1 | P13637 | 100.0 | 0.0 | SER | A:772 | A:772 | 0.0 | 0.0 | H | -71.6 | -19.4 | |
af-p50993-f1 | 1 | P50993 | 88.81 | 0.0 | SER | A:779 | A:779 | 0.0 | 0.0 | H | -71.2 | -20.4 | |
af-p05023-f1 | 1 | P05023 | 88.03 | 0.0 | SER | A:782 | A:782 | 0.0 | 0.0 | H | -71.6 | -20.8 |