Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr19 8468336 . G A CCDS12201.1:NM_004218.3:c.551cGc>cAc_NP_004209.2:p.184R>H Homo sapiens RAB11B, member RAS oncogene family (RAB11B), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4ojk 1 Q15907 100.0 3e-146 X-RAY
 2014-08-06 ARG A:179 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:179 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbl 2 P62491 91.28 1e-145 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:189 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbq 2 P62491 91.28 1e-145 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:189 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2f9l 1 Q15907 99.49 2e-145 X-RAY
 2006-04-04 ARG A:178 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2f9m 1 Q15907 99.49 2e-145 X-RAY
 2006-04-04 ARG A:178 A:184 133.0 0.591 H -54.8 -44.5 133.0 0.591 0.0 NI
HOH
 5.870
3.130
 N
NH2
 NI
O
5fbr 2 P62491 90.83 2e-144 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:189 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbv 2 P62491 90.83 2e-144 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:189 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbw 2 P62491 90.83 2e-144 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:189 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4d0l 2 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2014-05-28 ARG B:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4d0m 2 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2014-05-28 ARG B:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG N:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG P:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG R:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG T:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG X:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG Z:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG DA:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG HA:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5c46 2 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2016-01-20 ARG B:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5c4g 1 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2016-01-20 ARG A:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5euq 1 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2016-02-24 ARG A:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6djl 1 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2018-09-26 ARG A:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4uj4 1 P62491 95.63 9e-128 X-RAY
 2015-08-12 ARG A:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4uj3 1 P62491 95.08 3e-127 X-RAY
 2015-08-12 ARG A:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG M:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG P:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG S:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG V:185 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4uj5 1 P62491 94.54 8e-126 X-RAY
 2015-08-12 ARG A:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q15907-f1 1 Q15907 100.0 1e-164 ARG A:184 A:184 173.0 0.769 H -64.0 -42.9
af-p62491-f1 1 P62491 91.28 6e-146 ARG A:184 A:184 175.0 0.778 H -67.2 -40.2