Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr19 8468338 . G A CCDS12201.1:NM_004218.3:c.553Gct>Act_NP_004209.2:p.185A>T Homo sapiens RAB11B, member RAS oncogene family (RAB11B), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4ojk 1 Q15907 100.0 3e-146 X-RAY
 2014-08-06 ALA A:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbl 2 P62491 91.28 1e-145 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:190 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbq 2 P62491 91.28 1e-145 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:190 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2f9l 1 Q15907 99.49 2e-145 X-RAY
 2006-04-04 ALA A:179 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2f9m 1 Q15907 99.49 2e-145 X-RAY
 2006-04-04 ALA A:179 A:185 61.0 0.53 H -57.7 -42.2 61.0 0.53 0.0 NI
HOH
 8.014
3.480
 N
CB
 NI
O
5fbr 2 P62491 90.83 2e-144 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:190 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbv 2 P62491 90.83 2e-144 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:190 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fbw 2 P62491 90.83 2e-144 X-RAY
 2016-12-28 ARG B:190 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4d0l 2 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2014-05-28 ARG B:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4d0m 2 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2014-05-28 ARG B:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG J:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG N:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG P:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG R:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG T:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG X:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG Z:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG DA:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG HA:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5c46 2 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2016-01-20 ARG B:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5c4g 1 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2016-01-20 ARG A:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5euq 1 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2016-02-24 ARG A:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6djl 1 P62491 90.83 3e-144 X-RAY
 2018-09-26 ARG A:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG G:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:188 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q15907-f1 1 Q15907 100.0 1e-164 ALA A:185 A:185 49.0 0.426 H -61.5 -40.9
af-p62491-f1 1 P62491 91.28 6e-146 ARG A:185 A:185 185.0 0.822 H -67.3 -37.1