Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr2 | 176043126 | . | G | A | CCDS2263.1:NM_001002258.4:c.319Cct>Tct_NP_001002258.1:p.107P>S | Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C3 (subunit 9) (ATP5G3), transcript variant 2, mRNA. |
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PDB
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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|||||||||||||
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||||||||||||
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LA:P05630:NA |
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LA:P05630:NA |
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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I:P05630:NA |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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EM |
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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I:P05630:NA |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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LA:P05630:NA |
||||||||||||
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LA:P05630:NA |
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||||||||||||
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LA:P05630:NA |
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||||||||||||
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||||||||||||
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|||||||||||||
PRO | Q:39 | R:40 | 91.0 | 0.628 | -68.4 | 75.1 | 86.0 | 0.593 | 0.035 |
J:Q4VT52:0.034 |
|||||||||||||
6j5i | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 2e-43 |
EM |
2019-06-26 | PRO | V:39 | K:40 | 101.0 | 0.697 | -77.7 | 72.0 | 72.0 | 0.497 | 0.2 |
H:A0A287A9I8:0.124 W:Q4VT52:0.083 |
||||||
PRO | W:39 | L:40 | 100.0 | 0.69 | -76.0 | 85.1 | 97.0 | 0.669 | 0.021 |
X:Q4VT52:0.021 |
|||||||||||||
PRO | X:39 | M:40 | 91.0 | 0.628 | -69.1 | 82.7 | 82.0 | 0.566 | 0.062 |
Y:Q4VT52:0.062 |
|||||||||||||
PRO | Y:39 | N:40 | 101.0 | 0.697 | -75.0 | 74.2 | 23.0 | 0.159 | 0.538 |
Z:Q4VT52:0.166 J:A5GFX4:0.386 |
|||||||||||||
PRO | Z:39 | O:40 | 99.0 | 0.683 | -93.3 | 65.5 | 75.0 | 0.517 | 0.166 |
J:A5GFX4:0.117 AA:Q4VT52:0.048 |
|||||||||||||
PRO | AA:39 | P:40 | 95.0 | 0.655 | -67.4 | 78.5 | 79.0 | 0.545 | 0.11 |
BA:Q4VT52:0.055 I:A0A286ZYL7:0.048 |
|||||||||||||
PRO | BA:39 | Q:40 | 100.0 | 0.69 | -70.4 | 80.8 | 53.0 | 0.366 | 0.324 |
I:A0A286ZYL7:0.31 CA:Q4VT52:0.069 |
|||||||||||||
PRO | CA:39 | R:40 | 92.0 | 0.634 | -68.3 | 75.1 | 30.0 | 0.207 | 0.427 |
V:Q4VT52:0.034 I:A0A286ZYL7:0.393 |
|||||||||||||
6j5j | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 2e-43 |
EM |
2019-06-26 | PRO | V:39 | K:40 | 100.0 | 0.69 | -77.9 | 72.1 | 35.0 | 0.241 | 0.449 |
W:Q4VT52:0.083 J:A5GFX4:0.379 |
||||||
PRO | W:39 | L:40 | 100.0 | 0.69 | -76.1 | 85.1 | 85.0 | 0.586 | 0.104 |
X:Q4VT52:0.021 I:A0A286ZYL7:0.069 J:A5GFX4:0.014 |
|||||||||||||
PRO | X:39 | M:40 | 90.0 | 0.621 | -69.1 | 82.8 | 71.0 | 0.49 | 0.131 |
I:A0A286ZYL7:0.069 Y:Q4VT52:0.069 |
|||||||||||||
PRO | Y:39 | N:40 | 100.0 | 0.69 | -75.1 | 74.3 | 40.0 | 0.276 | 0.414 |
I:A0A286ZYL7:0.297 Z:Q4VT52:0.172 |
|||||||||||||
PRO | Z:39 | O:40 | 97.0 | 0.669 | -93.3 | 65.5 | 44.0 | 0.303 | 0.366 |
AA:Q4VT52:0.041 I:A0A286ZYL7:0.324 |
|||||||||||||
PRO | AA:39 | P:40 | 100.0 | 0.69 | -67.3 | 78.5 | 66.0 | 0.455 | 0.235 |
H:A0A287A9I8:0.179 BA:Q4VT52:0.055 |
|||||||||||||
PRO | BA:39 | Q:40 | 105.0 | 0.724 | -70.4 | 80.8 | 87.0 | 0.6 | 0.124 |
H:A0A287A9I8:0.055 CA:Q4VT52:0.062 |
|||||||||||||
PRO | CA:39 | R:40 | 93.0 | 0.641 | -68.4 | 75.0 | 88.0 | 0.607 | 0.034 |
V:Q4VT52:0.034 |
|||||||||||||
6j5k | 18 | Q4VT52 | 98.61 | 2e-43 |
EM |
2019-06-26 | PRO | V:39 | K:40 | 100.0 | 0.69 | -77.9 | 72.2 | 35.0 | 0.241 | 0.449 |
J:A5GFX4:0.379 W:Q4VT52:0.083 |
||||||
PRO | W:39 | L:40 | 97.0 | 0.669 | -76.2 | 85.1 | 82.0 | 0.566 | 0.103 |
X:Q4VT52:0.021 J:A5GFX4:0.021 I:A0A286ZYL7:0.076 |
|||||||||||||
PRO | X:39 | M:40 | 92.0 | 0.634 | -69.1 | 82.8 | 74.0 | 0.51 | 0.124 |
I:A0A286ZYL7:0.069 Y:Q4VT52:0.062 |
|||||||||||||
PRO | Y:39 | N:40 | 100.0 | 0.69 | -75.0 | 74.3 | 52.0 | 0.359 | 0.331 |
I:A0A286ZYL7:0.241 Z:Q4VT52:0.09 |
|||||||||||||
PRO | Z:39 | O:40 | 106.0 | 0.731 | -93.3 | 65.5 | 44.0 | 0.303 | 0.428 |
AA:Q4VT52:0.048 I:A0A286ZYL7:0.379 |
|||||||||||||
PRO | AA:39 | P:40 | 95.0 | 0.655 | -67.3 | 78.5 | 64.0 | 0.441 | 0.214 |
H:A0A287A9I8:0.152 BA:Q4VT52:0.062 |
|||||||||||||
PRO | BA:39 | Q:40 | 99.0 | 0.683 | -70.4 | 80.9 | 80.0 | 0.552 | 0.131 |
H:A0A287A9I8:0.069 CA:Q4VT52:0.069 |
|||||||||||||
PRO | CA:39 | R:40 | 90.0 | 0.621 | -68.4 | 75.0 | 86.0 | 0.593 | 0.028 |
V:Q4VT52:0.028 |
|||||||||||||
PRO | ZA:39 | AK:40 | 100.0 | 0.69 | -77.9 | 72.1 | 36.0 | 0.248 | 0.442 |
NA:A5GFX4:0.372 AB:Q4VT52:0.083 |
|||||||||||||
PRO | AB:39 | AL:40 | 98.0 | 0.676 | -76.1 | 85.1 | 84.0 | 0.579 | 0.097 |
NA:A5GFX4:0.014 BB:Q4VT52:0.014 MA:A0A286ZYL7:0.069 |
|||||||||||||
PRO | BB:39 | AM:40 | 91.0 | 0.628 | -69.1 | 82.7 | 73.0 | 0.503 | 0.125 |
MA:A0A286ZYL7:0.069 CB:Q4VT52:0.062 |
|||||||||||||
PRO | CB:39 | AN:40 | 99.0 | 0.683 | -75.1 | 74.3 | 53.0 | 0.366 | 0.317 |
MA:A0A286ZYL7:0.228 DB:Q4VT52:0.09 |
|||||||||||||
PRO | DB:39 | AO:40 | 106.0 | 0.731 | -93.4 | 65.5 | 45.0 | 0.31 | 0.421 |
MA:A0A286ZYL7:0.379 EB:Q4VT52:0.041 |
|||||||||||||
PRO | EB:39 | AP:40 | 99.0 | 0.683 | -67.3 | 78.5 | 67.0 | 0.462 | 0.221 |
LA:A0A287A9I8:0.166 FB:Q4VT52:0.055 |
|||||||||||||
PRO | FB:39 | AQ:40 | 101.0 | 0.697 | -70.4 | 80.8 | 81.0 | 0.559 | 0.138 |
GB:Q4VT52:0.069 LA:A0A287A9I8:0.069 |
|||||||||||||
PRO | GB:39 | AR:40 | 92.0 | 0.634 | -68.5 | 75.1 | 87.0 | 0.6 | 0.034 |
ZA:Q4VT52:0.034 |
|||||||||||||
PRO | DC:39 | BK:40 | 100.0 | 0.69 | -77.7 | 71.9 | 72.0 | 0.497 | 0.193 |
PB:A0A287A9I8:0.124 EC:Q4VT52:0.076 |
|||||||||||||
PRO | EC:39 | BL:40 | 99.0 | 0.683 | -76.0 | 85.0 | 96.0 | 0.662 | 0.021 |
FC:Q4VT52:0.021 |
|||||||||||||
PRO | FC:39 | BM:40 | 90.0 | 0.621 | -69.1 | 82.7 | 80.0 | 0.552 | 0.069 |
GC:Q4VT52:0.069 |
|||||||||||||
PRO | GC:39 | BN:40 | 99.0 | 0.683 | -75.0 | 74.2 | 20.0 | 0.138 | 0.545 |
RB:A5GFX4:0.393 HC:Q4VT52:0.172 |
|||||||||||||
PRO | HC:39 | BO:40 | 100.0 | 0.69 | -93.3 | 65.6 | 77.0 | 0.531 | 0.159 |
IC:Q4VT52:0.041 RB:A5GFX4:0.117 |
|||||||||||||
PRO | IC:39 | BP:40 | 98.0 | 0.676 | -67.5 | 78.4 | 81.0 | 0.559 | 0.117 |
QB:A0A286ZYL7:0.062 JC:Q4VT52:0.062 |
|||||||||||||
PRO | JC:39 | BQ:40 | 99.0 | 0.683 | -70.3 | 80.8 | 51.0 | 0.352 | 0.331 |
QB:A0A286ZYL7:0.317 KC:Q4VT52:0.069 |
|||||||||||||
PRO | KC:39 | BR:40 | 90.0 | 0.621 | -68.4 | 75.2 | 30.0 | 0.207 | 0.414 |
QB:A0A286ZYL7:0.386 DC:Q4VT52:0.028 |
|||||||||||||
PRO | HD:39 | CK:40 | 101.0 | 0.697 | -77.7 | 72.0 | 73.0 | 0.503 | 0.194 |
TC:A0A287A9I8:0.124 ID:Q4VT52:0.076 |
|||||||||||||
PRO | ID:39 | CL:40 | 96.0 | 0.662 | -76.0 | 85.1 | 93.0 | 0.641 | 0.021 |
JD:Q4VT52:0.021 |
|||||||||||||
PRO | JD:39 | CM:40 | 91.0 | 0.628 | -69.1 | 82.8 | 82.0 | 0.566 | 0.062 |
KD:Q4VT52:0.062 |
|||||||||||||
PRO | KD:39 | CN:40 | 100.0 | 0.69 | -75.0 | 74.2 | 20.0 | 0.138 | 0.552 |
VC:A5GFX4:0.407 LD:Q4VT52:0.179 |
|||||||||||||
PRO | LD:39 | CO:40 | 99.0 | 0.683 | -93.3 | 65.6 | 74.0 | 0.51 | 0.173 |
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|||||||||||||
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|||||||||||||
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|||||||||||||
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