Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr2 180846546 . T A CCDS46465.1:NM_020943.2:c.385Act>Tct_NP_065994.1:p.129T>S Homo sapiens CWC22 spliceosome associated protein homolog (CWC22), mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
5mqf 17 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2017-03-22 THR T:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5xjc 22 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2017-07-05 THR V:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5yzg 23 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2018-08-08 THR W:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5z56 42 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2018-09-19 THR ZA:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5z57 41 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2018-09-19 THR YA:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5z58 34 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2018-09-19 THR OA:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ff7 35 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2019-03-13 THR LA:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6icz 22 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2019-03-13 THR V:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6qdv 14 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2019-02-20 THR N:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6zym 17 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2020-10-14 THR Q:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7a5p 16 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2020-10-14 THR S:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7dvq 38 Q9HCG8 100.0 0.0 EM
2021-03-31 THR SA:129 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4c9b 2 Q9HCG8 100.0 0.0 X-RAY
2013-11-13 THR B:14 B:129 132.0 0.943 -113.8 94.3 80.0 0.571 0.372 A:P38919:0.371
HOH
8.539
OG1
O
6yvh 1 Q9HCG8 100.0 0.0 X-RAY
2020-05-13 THR A:14 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
THR B:14 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
THR D:14 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
THR E:14 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q9hcg8-f1 1 Q9HCG8 100.0 0.0 THR A:129 A:129 123.0 0.879 S -141.7 112.1