Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr2 | 180846546 | . | T | A | CCDS46465.1:NM_020943.2:c.385Act>Tct_NP_065994.1:p.129T>S | Homo sapiens CWC22 spliceosome associated protein homolog (CWC22), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
5mqf | 17 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2017-03-22 | THR | T:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5xjc | 22 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2017-07-05 | THR | V:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5yzg | 23 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-08-08 | THR | W:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5z56 | 42 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-09-19 | THR | ZA:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5z57 | 41 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-09-19 | THR | YA:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5z58 | 34 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-09-19 | THR | OA:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6ff7 | 35 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-03-13 | THR | LA:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6icz | 22 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-03-13 | THR | V:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6qdv | 14 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-02-20 | THR | N:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6zym | 17 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2020-10-14 | THR | Q:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7a5p | 16 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2020-10-14 | THR | S:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7dvq | 38 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-03-31 | THR | SA:129 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
4c9b | 2 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-11-13 | THR | B:14 | B:129 | 132.0 | 0.943 | -113.8 | 94.3 | 80.0 | 0.571 | 0.372 |
A:P38919:0.371 |
HOH |
8.539 |
OG1 |
O |
||
6yvh | 1 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-05-13 | THR | A:14 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
THR | B:14 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
THR | D:14 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
THR | E:14 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q9hcg8-f1 | 1 | Q9HCG8 | 100.0 | 0.0 | THR | A:129 | A:129 | 123.0 | 0.879 | S | -141.7 | 112.1 |