Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr2 187540571 . T A CCDS2292.1:NM_002210.4:c.2845Tct>Act_NP_002201.1:p.949S>T Homo sapiens integrin subunit alpha V (ITGAV), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6uja 1 P06756 99.9 0.0 EM
 2020-02-05 SER A:919 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ujb 1 P06756 99.9 0.0 EM
 2020-02-05 SER A:919 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ujc 1 P06756 99.9 0.0 EM
 2020-02-05 SER A:919 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3ije 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2009-09-29 SER A:919 A:919 13.0 0.113 E -109.7 101.7 13.0 0.113 0.0 NAG
NAG
 3.860
7.015
 OG
OG
 C6
N2
6msl 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2019-10-23 SER A:919 A:919 14.0 0.122 E -117.0 100.2 14.0 0.122 0.0 NAG
NAG
 3.379
7.418
 OG
OG
 O5
C1
6msu 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2019-10-23 SER A:919 A:919 9.0 0.078 E -113.0 106.0 9.0 0.078 0.0 NAG
NAG
 3.602
6.828
 OG
OG
 O5
C1
6djp 1 P06756 99.9 0.0 EM
 2018-07-25 SER A:919 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4o02 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2014-04-02 SER A:919 A:919 67.0 NA E -109.4 102.7 67.0 NA NA
4g1e 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2012-12-12 SER A:919 A:919 6.0 0.052 E -121.0 104.5 6.0 0.052 0.0 NAG
HOH
 3.909
7.057
 OG
CB
 O5
O
4g1m 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2012-12-12 SER A:919 A:919 7.0 0.061 E -113.7 99.0 7.0 0.061 0.0 NAG
NAG
 3.850
7.226
 OG
OG
 O5
O7
4mmx 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2014-03-26 SER A:919 A:919 8.0 0.07 E -116.7 123.0 8.0 0.07 0.0 NAG
NAG
 3.908
8.059
 CB
OG
 C1
C1
4mmy 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2014-03-26 SER A:919 A:919 9.0 0.078 E -112.5 109.7 9.0 0.078 0.0 NAG
NAG
BMA
 4.125
7.307
9.780
 OG
OG
OG
 O6
O3
C1
4mmz 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2014-03-26 SER A:919 A:919 13.0 0.113 E -109.3 109.1 13.0 0.113 0.0 NAG
 4.251
 OG
 C1
6avq 1 P06756 100.0 0.0 EM
 2017-11-01 SER A:919 A:919 40.0 NA E -114.0 106.7 40.0 NA NA
6avr 1 P06756 100.0 0.0 EM
 2017-11-01 SER A:919 A:919 38.0 NA E -113.7 107.3 38.0 NA NA
6avu 1 P06756 100.0 0.0 EM
 2017-11-01 SER A:919 A:919 39.0 NA E -112.8 109.2 39.0 NA NA
1jv2 1 14743192 99.9 0.0 X-RAY
 2001-10-17 SER A:919 A:919 20.0 0.174 -126.1 -32.7 20.0 0.174 0.0 NAG
NAG
 4.032
7.188
 OG
OG
 C1
C1
1l5g 1 14743192 99.9 0.0 X-RAY
 2002-04-17 SER A:919 A:919 16.0 0.139 E -127.5 86.1 16.0 0.139 0.0 NAG
NAG
 4.254
6.701
 CB
OG
 O6
O5
1m1x 1 14743192 99.9 0.0 X-RAY
 2002-08-14 SER A:919 A:919 20.0 0.174 E -126.0 101.4 20.0 0.174 0.0 NAG
NAG
 4.318
7.212
 OG
OG
 C1
O5
1u8c 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2004-12-28 SER A:919 A:919 19.0 0.165 E -116.5 88.5 19.0 0.165 0.0 NAG
NAG
 4.099
6.833
 OG
OG
 O5
C1
6mk0 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2019-09-25 SER A:919 A:919 16.0 0.139 E -112.8 95.6 16.0 0.139 0.0 NAG
 3.814
 OG
 C1
6naj 1 P06756 99.9 0.0 X-RAY
 2019-12-11 SER A:919 A:919 14.0 0.122 E -115.1 95.8 14.0 0.122 0.0 NAG
 3.956
 OG
 C1

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p06756-f1 1 P06756 99.9 0.0 SER A:949 A:949 8.0 0.07 E -111.5 108.1