Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr2 29006797 . T A CCDS33169.1:NM_002709.2:c.545aTg>aAg_NP_002700.1:p.182M>K Homo sapiens protein phosphatase 1 catalytic subunit beta (PPP1CB), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1s70 1 P62140 100.0 0.0 X-RAY
2004-06-22 MET A:185 A:183 18.0 0.097 T -47.7 -34.6 18.0 0.097 0.0 HOH
3.701
CE
O
1fjm 1 P08129 88.79 0.0 X-RAY
1996-06-20 MET A:183 A:183 19.0 0.103 H -64.1 -23.1 19.0 0.103 0.0 HOH
6.926
CE
O
MET B:183 B:183 19.0 0.103 T -65.5 -29.6 NA NA NA
4g9j 1 P62136 88.79 0.0 X-RAY
2012-09-19 MET A:184 A:183 22.0 0.119 T -65.1 -30.7 22.0 0.119 0.0 HOH
4.198
CB
O
MET B:184 B:183 24.0 0.13 T -61.5 -20.1 NA NA NA
6g0i 1 P62136 88.79 0.0 X-RAY
2018-11-21 MET A:184 A:183 21.0 0.114 H -63.3 -29.1 21.0 0.114 0.0 HOH
3.041
N
O
6g0j 1 P62136 88.79 0.0 X-RAY
2018-11-21 MET A:184 A:183 22.0 0.119 H -62.3 -26.0 22.0 0.119 0.0 HOH
2.884
N
O
3egg 1 P62136 89.26 0.0 X-RAY
2010-03-23 MET A:182 A:183 19.0 0.103 T -58.7 -23.2 19.0 0.103 0.0 HOH
3.900
CE
O
MET B:182 B:183 19.0 0.103 T -58.0 -22.1 NA NA NA
3egh 1 P62136 89.26 0.0 X-RAY
2010-03-23 MET A:182 A:183 18.0 0.097 T -57.0 -26.1 18.0 0.097 0.0 HOH
2.920
N
O
MET B:182 B:183 19.0 0.103 T -61.1 -17.4 NA NA NA
3hvq 1 P62136 89.26 0.0 X-RAY
2010-03-23 MET A:182 A:183 19.0 0.103 T -58.5 -26.0 19.0 0.103 0.0 HOH
3.025
N
O
MET B:182 B:183 19.0 0.103 T -58.9 -22.6 19.0 0.103 0.0 HOH
2.908
N
O
6ghm 1 P62136 89.26 0.0 X-RAY
2019-02-27 MET A:182 A:183 21.0 0.114 H -57.6 -23.8 21.0 0.114 0.0 EDO
HOH
8.548
2.913
CE
N
O1
O
MET B:182 B:183 19.0 0.103 H -61.2 -25.6 NA NA NA
6dcx 1 P62136 88.79 0.0 X-RAY
2019-05-15 MET A:192 A:183 22.0 0.119 T -56.9 -24.4 22.0 0.119 0.0
MET B:192 B:183 18.0 0.097 T -56.4 -24.2 NA NA NA
6zk6 1 P62136 88.48 0.0 X-RAY
2020-11-18 MET A:184 A:183 21.0 0.114 H -61.7 -19.9 21.0 0.114 0.0 HOH
2.929
N
O
5zqv 1 P62137 89.23 0.0 X-RAY
2019-03-13 MET A:183 A:183 23.0 0.124 H -65.7 -21.9 23.0 0.124 0.0
MET B:183 B:183 21.0 0.114 H -60.9 -22.7 NA NA NA
MET C:183 C:183 22.0 0.119 H -63.0 -20.3 22.0 0.119 0.0
MET D:183 D:183 17.0 0.092 T -64.3 -24.5 NA NA NA
4v0u 2 P63087 89.06 0.0 X-RAY
2015-03-25 MET D:183 D:183 19.0 0.103 H -55.4 -27.3 NA NA NA
MET F:183 F:183 18.0 0.097 T -55.4 -27.3 NA NA NA
MET H:183 H:183 18.0 0.097 T -55.4 -27.3 NA NA NA
MET J:183 J:183 18.0 0.097 H -55.4 -27.3 18.0 0.097 0.0
MET N:183 N:183 18.0 0.097 T -55.4 -27.2 NA NA NA
1it6 1 P36873 89.06 0.0 X-RAY
2002-05-22 MET A:183 A:183 18.0 0.097 H -62.0 -22.1 18.0 0.097 0.0 HOH
4.401
CG
O
MET B:183 B:183 21.0 0.114 H -61.9 -21.1 NA NA NA
1jk7 1 P36873 89.06 0.0 X-RAY
2001-08-15 MET A:183 A:183 18.0 0.097 H -64.4 -29.4 18.0 0.097 0.0 HOH
3.198
N
O
2bcd 1 P36873 89.06 0.0 X-RAY
2006-01-17 MET A:183 A:183 22.0 0.119 T -64.5 -24.5 22.0 0.119 0.0 MN
HOH
3.442
4.288
N
CG
MN
O
2bdx 1 P36873 89.06 0.0 X-RAY
2006-01-17 MET A:183 A:183 18.0 0.097 H -68.5 -27.5 18.0 0.097 0.0 HOH
9.728
N
O
4ut2 1 P36873 89.06 0.0 X-RAY
2015-07-22 MET A:183 A:183 19.0 0.103 H -66.2 -24.8 19.0 0.103 0.0 HOH
2.926
N
O
MET B:183 B:183 17.0 0.092 H -66.7 -24.9 NA NA NA
4ut3 1 P36873 89.06 0.0 X-RAY
2015-07-22 MET A:183 A:183 16.0 0.086 H -64.1 -23.0 16.0 0.086 0.0 HOH
2.879
N
O
4ut3 2 P36873 89.06 0.0 X-RAY
2015-07-22 MET B:183 B:183 15.0 0.081 H -62.3 -24.0 NA NA NA
2o8a 1 P63088 89.52 0.0 X-RAY
2007-07-17 MET A:189 A:183 20.0 0.108 T -60.5 -25.8 20.0 0.108 0.0 HOH
6.725
CE
O
MET C:189 B:183 20.0 0.108 T -58.5 -24.4 NA NA NA
2o8g 1 P63088 89.52 0.0 X-RAY
2007-07-17 MET A:189 A:183 19.0 0.103 H -58.2 -26.4 19.0 0.103 0.0 HOH
2.940
N
O
MET C:189 B:183 21.0 0.114 H -56.0 -26.0 NA NA NA
6zej 1 P62136,Q4VY12 86.42 0.0 X-RAY
2020-09-30 MET A:182 D:182 17.0 0.092 H -55.8 -28.3 17.0 0.092 0.0 HOH
1.917
H
O
MET B:182 A:182 29.0 0.157 H -55.3 -25.3 NA NA NA
MET C:182 F:182 20.0 0.108 T -51.9 -30.7 NA NA NA
MET D:182 I:182 29.0 0.157 H -52.8 -25.2 NA NA NA
MET E:182 L:182 28.0 0.151 T -55.3 -24.5 NA NA NA
MET F:182 O:182 18.0 0.097 H -57.3 -25.7 NA NA NA
3v4y 1 P62136 92.05 0.0 X-RAY
2012-10-31 MET A:182 A:183 24.0 0.13 H -58.1 -32.3 24.0 0.13 0.0 HOH
2.042
H
O
MET C:182 C:183 23.0 0.124 H -61.6 -28.4 NA NA NA
MET E:182 E:183 25.0 0.135 H -60.3 -31.8 NA NA NA
MET G:182 G:183 22.0 0.119 H -59.9 -31.2 NA NA NA
6zeh 1 P62136,Q13813 92.28 0.0 X-RAY
2020-09-30 MET A:182 A:183 19.0 0.103 H -61.9 -23.4 19.0 0.103 0.0 HOH
2.049
H
O
MET C:182 B:183 18.0 0.097 T -65.5 -18.7 NA NA NA
6obn 1 P62136 92.0 0.0 X-RAY
2019-09-18 MET A:188 A:183 20.0 0.108 H -60.0 -26.3 20.0 0.108 0.0 CL
HOH
3.609
6.551
N
O
CL
O
MET B:188 B:183 20.0 0.108 H -59.4 -25.6 NA NA NA
6obp 1 P62136 92.0 0.0 X-RAY
2019-09-18 MET A:188 A:183 20.0 0.108 T -68.4 -18.2 20.0 0.108 0.0 CL
HOH
3.857
6.839
N
O
CL
O
3n5u 1 P62136 92.0 0.0 X-RAY
2010-08-11 MET A:183 A:183 28.0 0.151 H -60.7 -9.2 28.0 0.151 0.0
MET B:183 B:183 28.0 0.151 H -60.5 -10.0 28.0 0.151 0.0
6zeg 1 P62136,Q9UQB8 92.28 0.0 X-RAY
2020-09-30 MET A:182 A:183 19.0 0.103 H -60.6 -25.6 19.0 0.103 0.0 EDO
HOH
8.603
2.041
O
H
HO2
O
MET C:182 B:183 16.0 0.086 T -62.5 -20.7 NA NA NA
6zei 1 P62136,Q9UQB8 92.28 0.0 X-RAY
2020-09-30 MET A:182 A:183 20.0 0.108 T -63.2 -23.4 20.0 0.108 0.0 HOH
2.064
H
O
MET C:182 B:183 18.0 0.097 T -62.6 -19.9 NA NA NA
3e7a 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2008-11-04 MET A:182 A:183 21.0 0.114 T -61.4 -29.7 21.0 0.114 0.0 HOH
2.936
N
O
MET B:182 B:183 20.0 0.108 T -59.3 -26.5 NA NA NA
3e7b 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2008-11-04 MET A:182 A:183 20.0 0.108 T -66.8 -26.6 20.0 0.108 0.0 HOH
3.025
N
O
MET B:182 B:183 20.0 0.108 H -66.5 -28.4 NA NA NA
4mov 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2014-03-26 MET A:182 A:183 20.0 0.108 T -63.6 -25.0 20.0 0.108 0.0 HOH
2.900
N
O
MET B:182 B:183 20.0 0.108 T -60.9 -25.9 NA NA NA
4moy 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2014-03-26 MET A:182 A:183 20.0 0.108 H -61.4 -27.6 20.0 0.108 0.0 HOH
2.982
N
O
4mp0 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2014-03-26 MET A:182 A:183 17.0 0.092 T -64.0 -20.5 17.0 0.092 0.0 HOH
5.608
CB
O
MET B:182 C:183 19.0 0.103 T -64.3 -21.8 NA NA NA
4xpn 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2015-07-01 MET A:182 A:183 19.0 0.103 T -67.0 -24.7 19.0 0.103 0.0 HOH
2.757
N
O
MET C:182 C:183 17.0 0.092 T -66.1 -24.6 NA NA NA
5ioh 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2016-10-05 MET A:182 A:183 19.0 0.103 T -62.4 -22.1 19.0 0.103 0.0 HOH
6.727
CE
O
MET C:182 C:183 21.0 0.114 T -61.8 -23.0 NA NA NA
6alz 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2017-11-29 MET A:182 A:183 20.0 0.108 T -64.4 -23.1 20.0 0.108 0.0 HOH
3.039
N
O
MET B:182 B:183 18.0 0.097 T -64.3 -22.9 NA NA NA
6czo 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2019-01-23 MET A:182 A:183 21.0 0.114 T -70.8 -20.4 21.0 0.114 0.0 HOH
7.898
O
O
MET C:182 C:183 18.0 0.097 T -71.2 -21.6 NA NA NA
6dno 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2019-01-23 MET A:182 A:183 18.0 0.097 H -59.2 -24.5 18.0 0.097 0.0 HOH
5.698
CB
O
6zee 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2020-09-30 MET A:182 P:183 19.0 0.103 T -56.0 -24.6 19.0 0.103 0.0 EDO
EDO
HOH
9.112
2.217
5.271
O
H
HE2
H12
O2
O
MET B:182 Q:183 20.0 0.108 T -53.8 -32.5 20.0 0.108 0.0 EDO
HOH
1.781
6.081
H
HE3
O2
O
MET C:182 B:183 16.0 0.086 H -56.0 -28.2 16.0 0.086 0.0 EDO
HOH
1.999
4.180
H
HB2
O2
O
MET D:182 A:183 18.0 0.097 H -58.1 -27.9 18.0 0.097 0.0 EDO
16P
HOH
1.884
6.534
3.323
H
O
HG2
O2
H42
O
MET E:182 I:183 15.0 0.081 H -55.6 -29.8 15.0 0.081 0.0 HOH
2.091
H
O
MET F:182 K:183 28.0 0.151 H -59.0 -27.8 28.0 0.151 0.0 GOL
HOH
9.307
7.441
O
O
HO3
O
6zef 1 P62136 92.57 0.0 X-RAY
2020-09-30 MET A:182 A:183 30.0 0.162 T -57.0 -27.7 30.0 0.162 0.0 EDO
HOH
5.506
5.465
HB3
HE2
HO1
O
MET B:182 B:183 30.0 0.162 T -58.0 -27.1 NA NA NA
5inb 1 P36873 92.57 0.0 X-RAY
2016-10-05 MET A:180 A:183 22.0 0.119 H -59.7 -25.6 22.0 0.119 0.0 NA
HOH
5.257
2.945
CG
N
NA
O
5j28 1 P36873 92.57 0.0 X-RAY
2016-10-05 MET A:180 A:183 23.0 0.124 T -55.1 -25.2 23.0 0.124 0.0 NA
HOH
4.953
2.867
CG
N
NA
O
MET B:180 B:183 22.0 0.119 T -64.7 -28.3 NA NA NA
6obr 1 P62136 92.23 0.0 X-RAY
2019-09-18 MET A:182 A:183 19.0 0.103 H -60.0 -23.6 19.0 0.103 0.0 HOH
2.958
N
O
MET B:182 B:183 21.0 0.114 H -60.9 -24.8 NA NA NA
6obq 1 P62136 92.23 0.0 X-RAY
2019-09-18 MET A:182 A:183 20.0 0.108 H -61.3 -24.1 20.0 0.108 0.0 HOH
5.951
CG
O
MET B:182 B:183 20.0 0.108 H -61.7 -23.5 NA NA NA
6obs 1 P62136 92.23 0.0 X-RAY
2019-09-18 MET A:182 A:183 19.0 0.103 H -60.4 -28.3 19.0 0.103 0.0 HOH
3.192
N
O
MET B:182 B:183 19.0 0.103 H -61.0 -28.4 NA NA NA
6obu 1 P62136 92.23 0.0 X-RAY
2019-09-18 MET A:182 A:183 20.0 0.108 H -58.9 -22.1 20.0 0.108 0.0 HOH
2.842
N
O
MET B:182 B:183 22.0 0.119 H -59.2 -22.3 NA NA NA
5zt0 1 P62137 92.52 0.0 X-RAY
2019-03-13 MET A:177 A:183 18.0 0.097 T -71.1 -18.7 18.0 0.097 0.0
MET B:177 B:183 20.0 0.108 T -70.0 -18.5 NA NA NA
MET C:177 C:183 21.0 0.114 T -68.8 -20.9 NA NA NA
MET D:177 D:183 26.0 0.141 H -72.0 -31.7 NA NA NA
MET E:177 E:183 22.0 0.119 T -71.1 -22.1 NA NA NA
MET F:177 F:183 20.0 0.108 T -65.9 -23.4 NA NA NA
4v0v 1 P63087 92.52 0.0 X-RAY
2015-03-25 MET A:178 A:183 18.0 0.097 H -55.1 -26.6 18.0 0.097 0.0 HOH
6.694
O
O
MET C:178 C:183 23.0 0.124 T -59.8 -22.2 NA NA NA
4v0w 1 P63087 92.52 0.0 X-RAY
2015-03-25 MET A:178 A:183 19.0 0.103 T -58.9 -24.7 19.0 0.103 0.0 HOH
5.342
C
O
MET C:178 C:183 21.0 0.114 T -57.8 -25.5 NA NA NA
4v0x 1 P63087 92.52 0.0 X-RAY
2015-03-25 MET A:178 A:183 19.0 0.103 H -51.8 -26.7 19.0 0.103 0.0 HOH
8.011
HE3
O
7nzm 2 P62139 92.52 0.0 EM
2021-09-29 MET B:177 B:183 52.0 0.281 T -62.9 -25.3 52.0 0.281 0.0
1u32 1 P36873 90.78 0.0 X-RAY
2004-08-17 MET A:178 A:183 22.0 0.119 H -69.2 -21.1 22.0 0.119 0.0 HOH
3.694
N
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p62140-f1 1 P62140 100.0 0.0 MET A:182 A:182 16.0 0.086 H -59.2 -24.2
af-p62136-f1 1 P62136 88.79 0.0 MET A:183 A:183 15.0 0.081 H -58.7 -24.5
af-p36873-f1 1 P36873 89.06 0.0 MET A:183 A:183 16.0 0.086 H -58.1 -23.8