Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr2 | 241813460 | . | T | A | CCDS2543.1:NM_000030.2:c.661Tcc>Acc_NP_000021.1:p.221S>T | Homo sapiens alanine-glyoxylate aminotransferase (AGXT), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1h0c | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2003-06-12 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -144.3 | 137.6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.834 |
OG |
O |
||
5og0 | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-27 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -150.8 | 139.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
8.585 |
OG |
O |
||
6rv0 | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-08 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -141.0 | 137.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.634 |
OG |
O |
||
6rv1 | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-08 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -140.2 | 143.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||
3r9a | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-05-11 | SER | A:223 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -147.1 | 145.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.636 |
OG |
O |
||
SER | C:223 | C:221 | 0.0 | 0.0 | E | -143.9 | 146.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.967 |
OG |
O |
|||||||||
5ofy | 1 | P21549 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-27 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -140.1 | 145.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
9.688 |
OG |
O |
||
4kyo | 1 | P21549 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2014-11-19 | SER | A:223 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -145.2 | 146.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.795 |
OG |
O |
||
SER | B:223 | C:221 | 0.0 | 0.0 | E | -138.2 | 148.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.742 |
OG |
O |
|||||||||
4i8a | 1 | P21549 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-01 | SER | A:223 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -147.9 | 140.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||
SER | B:223 | B:221 | 0.0 | 0.0 | E | -148.2 | 142.9 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | |||||||||||||
SER | C:223 | C:221 | 0.0 | 0.0 | E | -148.7 | 140.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:223 | D:221 | 0.0 | 0.0 | E | -150.7 | 141.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1j04 | 1 | P21549 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2003-11-11 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -146.3 | 137.6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.888 |
OG |
O |
||
5luc | 1 | P21549 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | SER | A:232 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -146.5 | 147.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.770 |
OG |
O |
||
SER | B:232 | B:221 | 0.0 | 0.0 | E | -149.2 | 146.6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.703 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:232 | E:221 | 0.0 | 0.0 | E | -146.2 | 148.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:232 | G:221 | 0.0 | 0.0 | E | -147.6 | 146.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:232 | M:221 | 0.0 | 0.0 | E | -143.7 | 145.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:232 | N:221 | 0.0 | 0.0 | E | -147.4 | 147.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | G:232 | S:221 | 0.0 | 0.0 | E | -146.6 | 151.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | H:232 | T:221 | 0.0 | 0.0 | E | -148.9 | 146.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4kxk | 1 | P21549 | 99.49 | 0.0 |
X-RAY |
2014-11-19 | SER | A:223 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -144.7 | 150.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||
SER | B:223 | C:221 | 0.0 | 0.0 | E | -151.1 | 147.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.503 |
OG |
O |
|||||||||
4cbr | 1 | P21549 | 99.23 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-09 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -148.0 | 140.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.995 |
OG |
O |
||
4cbs | 1 | P21549 | 98.72 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-09 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -137.4 | 143.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.755 |
OG |
O |
||
5f9s | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-12-21 | SER | A:216 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -142.1 | 145.4 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.500 |
HG |
O |
||
SER | B:216 | B:221 | 0.0 | 0.0 | E | -141.4 | 149.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.459 |
HG |
O |
|||||||||
5hhy | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | SER | A:216 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -143.1 | 143.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.541 |
HG |
O |
||
SER | B:216 | B:221 | 0.0 | 0.0 | E | -139.6 | 150.4 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.410 |
HG |
O |
|||||||||
2yob | 1 | P21549 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-10-30 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -145.1 | 146.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
GOL HOH |
7.179 5.658 |
OG OG |
O1 O |
||
SER | B:221 | B:221 | 0.0 | 0.0 | E | -143.1 | 147.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.805 |
OG |
O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p21549-f1 | 1 | P21549 | 100.0 | 0.0 | SER | A:221 | A:221 | 0.0 | 0.0 | E | -141.0 | 147.7 |