Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr2 37580061 . A C CCDS1790.1:NM_012413.3:c.250Agc>Cgc_NP_036545.1:p.84S>R Homo sapiens glutaminyl-peptide cyclotransferase (QPCT), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4ywy 1 Q16769 99.45 0.0 X-RAY
 2015-08-05 SER A:84 A:84 1.0 0.009 H -58.5 -49.8 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.505
 OG
 O
SER B:84 B:84 1.0 0.009 H -61.4 -49.5 NA NA NA
SER C:84 C:84 1.0 0.009 H -63.6 -48.5 NA NA NA
2afm 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2005-08-23 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -62.9 -45.6 2.0 0.017 0.0 HOH
 2.604
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -63.2 -48.2 NA NA NA
2afo 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2005-08-23 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -59.0 -43.8 2.0 0.017 0.0 HOH
 2.747
 OG
 O
SER B:52 B:84 3.0 0.026 H -64.8 -45.4 NA NA NA
2afw 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2005-08-23 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -62.0 -44.7 2.0 0.017 0.0 HOH
 2.652
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -63.1 -46.4 NA NA NA
2afx 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2005-08-23 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -62.8 -44.4 2.0 0.017 0.0 HOH
 2.647
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -63.8 -48.8 NA NA NA
2afz 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2005-08-23 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -64.8 -45.5 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.611
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -61.9 -49.7 NA NA NA
3pbb 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2011-02-02 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -64.8 -45.4 2.0 0.017 0.0 HOH
 2.972
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -60.3 -49.8 NA NA NA
2zef 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -64.9 -44.6 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.578
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -65.0 -46.4 NA NA NA
2zed 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -63.1 -44.3 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.539
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -62.6 -48.0 NA NA NA
2afu 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2005-08-23 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -55.8 -45.0 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.752
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -66.0 -48.5 NA NA NA
2zeh 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -65.1 -43.1 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.672
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -65.0 -49.0 NA NA NA
2zeo 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -63.2 -43.1 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.529
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -62.1 -48.1 NA NA NA
2zee 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 3.0 0.026 H -61.5 -44.0 3.0 0.026 0.0 HOH
 2.731
 OG
 O
SER B:52 B:84 3.0 0.026 H -61.3 -49.9 NA NA NA
3pbe 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2011-02-02 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -64.7 -44.1 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.692
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -63.3 -46.2 NA NA NA
2zem 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -62.8 -43.2 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.788
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -65.6 -44.3 NA NA NA
2zen 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -63.9 -45.7 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.582
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -64.9 -47.0 NA NA NA
2zel 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -61.7 -45.5 2.0 0.017 0.0 HOH
 2.608
 OG
 O
SER B:52 B:84 1.0 0.009 H -64.8 -46.3 NA NA NA
2zeg 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -61.6 -46.1 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.626
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -64.7 -46.3 NA NA NA
2zep 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2008-04-22 SER A:52 A:84 4.0 0.035 H -63.9 -44.2 4.0 0.035 0.0 HOH
 2.703
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -64.6 -47.2 NA NA NA
7cm0 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2021-12-22 SER A:50 A:84 1.0 0.009 H -56.8 -44.1 1.0 0.009 0.0 HOH
 1.872
 OG
 O
SER B:50 B:84 2.0 0.017 H -62.9 -37.2 NA NA NA
SER C:50 C:84 3.0 0.026 H -61.5 -37.7 NA NA NA
SER D:50 D:84 0.0 0.0 H -61.6 -41.8 NA NA NA
2afs 1 Q16769 99.7 0.0 X-RAY
 2005-08-23 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -60.6 -44.3 2.0 0.017 0.0 HOH
 2.663
 OG
 O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -67.8 -43.6 NA NA NA
6yi1 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2020-07-01 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -58.7 -45.6 1.0 0.009 0.0 PEG
HOH
 8.729
2.545
 CB
OG
 O1
O
SER B:52 B:84 3.0 0.026 H -58.1 -52.2 NA NA NA
6yjy 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2020-07-01 SER A:52 A:84 2.0 0.017 H -60.0 -45.7 2.0 0.017 0.0 SO4
HOH
 8.676
2.661
 CB
OG
 O2
O
SER B:52 B:84 2.0 0.017 H -62.5 -47.4 NA NA NA
4yu9 1 Q16769 99.39 0.0 X-RAY
 2015-08-05 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -56.8 -51.3 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.613
 OG
 O
SER B:52 B:84 1.0 0.009 H -57.7 -55.7 NA NA NA
SER C:52 C:84 1.0 0.009 H -60.3 -52.4 NA NA NA
6gbx 1 Q16769 99.39 0.0 X-RAY
 2018-09-19 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -59.4 -51.6 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.622
 OG
 O
SER B:52 B:84 1.0 0.009 H -61.1 -50.2 NA NA NA
SER C:52 C:84 1.0 0.009 H -60.2 -51.2 NA NA NA
7d8e 1 Q16769 99.39 0.0 X-RAY
 2021-12-08 SER A:52 A:84 1.0 0.009 H -62.2 -46.8 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.819
 OG
 O
SER B:52 B:84 1.0 0.009 H -60.4 -47.7 NA NA NA
SER C:52 C:84 1.0 0.009 H -57.6 -48.7 NA NA NA
7coz 1 Q16769 99.39 0.0 X-RAY
 2021-01-13 SER A:50 A:84 1.0 0.009 H -57.7 -49.5 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.700
 OG
 O
SER B:50 B:84 1.0 0.009 H -60.8 -47.7 NA NA NA
SER C:50 C:84 1.0 0.009 H -64.8 -46.0 NA NA NA
7cp0 1 Q16769 99.39 0.0 X-RAY
 2021-01-13 SER A:50 A:84 1.0 0.009 H -55.9 -49.8 1.0 0.009 0.0 HOH
 2.488
 OG
 O
SER B:50 B:84 1.0 0.009 H -59.6 -48.1 NA NA NA
SER C:50 C:84 1.0 0.009 H -57.5 -51.6 NA NA NA
3si0 1 Q16769 100.0 0.0 X-RAY
 2011-06-29 SER A:53 A:84 0.0 0.0 H -49.3 -43.6 0.0 0.0 0.0 CL
HOH
 7.134
2.540
 CB
OG
 CL
O
3si2 1 B2RX76 86.24 0.0 X-RAY
 2011-06-29 SER A:50 A:85 3.0 0.026 H -62.3 -46.6 3.0 0.026 0.0 HOH
 2.611
 OG
 O
3si1 1 Q9CYK2 85.93 0.0 X-RAY
 2011-06-29 SER A:50 A:85 9.0 0.078 H -57.0 22.2 9.0 0.078 0.0 HOH
 8.984
 O
 O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q16769-f1 1 Q16769 100.0 0.0 SER A:84 A:84 2.0 0.017 H -58.4 -42.2