Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr2 | 37594502 | . | C | A | CCDS1790.1:NM_012413.3:c.674tCg>tAg_NP_036545.1:p.225S>* | Homo sapiens glutaminyl-peptide cyclotransferase (QPCT), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 4ywy | 1 | Q16769 | 99.45 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-05 | SER | A:225 | A:225 | 100.0 | 0.87 | T | -92.1 | -3.9 | 100.0 | 0.87 | 0.0 |
EDO EDO HOH |
8.463 9.971 5.374 |
N N N |
O1 O1 O |
||
| SER | B:225 | B:225 | 94.0 | 0.817 | T | -96.9 | 3.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:225 | C:225 | 92.0 | 0.8 | H | -96.9 | 3.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2afm | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-23 | SER | A:193 | A:225 | 93.0 | 0.809 | T | -108.8 | 17.0 | 93.0 | 0.809 | 0.0 |
HOH |
2.563 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 94.0 | 0.817 | T | -115.9 | 15.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2afo | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-23 | SER | A:193 | A:225 | 94.0 | 0.817 | T | -108.9 | 20.5 | 94.0 | 0.817 | 0.0 |
HOH |
3.913 |
CB |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 96.0 | 0.835 | T | -107.2 | 14.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2afw | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-23 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -107.5 | 14.8 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.601 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 94.0 | 0.817 | T | -112.7 | 12.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2afx | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-23 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -105.8 | 16.0 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.694 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 96.0 | 0.835 | T | -110.8 | 11.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2afz | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-23 | SER | A:193 | A:225 | 90.0 | 0.783 | T | -106.0 | 15.5 | 90.0 | 0.783 | 0.0 |
HOH |
2.616 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 96.0 | 0.835 | T | -112.9 | 14.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3pbb | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-02-02 | SER | A:193 | A:225 | 96.0 | 0.835 | T | -104.1 | 15.1 | 96.0 | 0.835 | 0.0 |
HOH |
3.225 |
O |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 96.0 | 0.835 | T | -117.7 | 15.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zef | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -108.4 | 18.6 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.651 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 96.0 | 0.835 | T | -117.7 | 15.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zed | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -107.7 | 21.2 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.731 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 96.0 | 0.835 | T | -115.6 | 12.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2afu | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-23 | SER | A:193 | A:225 | 95.0 | 0.826 | T | -112.0 | 19.8 | 95.0 | 0.826 | 0.0 |
HOH |
2.915 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 95.0 | 0.826 | T | -105.3 | 12.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zeh | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 91.0 | 0.791 | T | -107.7 | 21.3 | 91.0 | 0.791 | 0.0 |
HOH |
2.515 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 96.0 | 0.835 | T | -116.5 | 16.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zeo | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -107.7 | 19.4 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.628 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 95.0 | 0.826 | T | -114.6 | 15.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zee | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -108.6 | 20.6 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.619 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 93.0 | 0.809 | T | -120.1 | 15.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3pbe | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2011-02-02 | SER | A:193 | A:225 | 93.0 | 0.809 | T | -108.7 | 18.8 | 93.0 | 0.809 | 0.0 |
HOH |
2.656 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 95.0 | 0.826 | T | -114.1 | 10.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zem | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -114.0 | 21.3 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
3.988 |
CB |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 95.0 | 0.826 | T | -117.7 | 21.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zen | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -109.6 | 17.3 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.680 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 94.0 | 0.817 | T | -112.2 | 13.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zel | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 93.0 | 0.809 | T | -112.9 | 22.8 | 93.0 | 0.809 | 0.0 |
HOH |
3.993 |
CB |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 93.0 | 0.809 | T | -116.1 | 15.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zeg | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -112.5 | 20.4 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
3.529 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 95.0 | 0.826 | T | -117.0 | 17.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zep | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-22 | SER | A:193 | A:225 | 89.0 | 0.774 | T | -111.7 | 16.8 | 89.0 | 0.774 | 0.0 |
HOH |
3.887 |
CB |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 94.0 | 0.817 | T | -111.8 | 15.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7cm0 | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-22 | SER | A:191 | A:225 | 96.0 | 0.835 | H | -104.4 | -17.2 | 96.0 | 0.835 | 0.0 |
HOH |
8.191 |
O |
O |
||
| SER | B:191 | B:225 | 98.0 | 0.852 | T | -110.4 | 2.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:191 | C:225 | 99.0 | 0.861 | T | -99.3 | 6.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | D:191 | D:225 | 103.0 | 0.896 | T | -103.3 | 1.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2afs | 1 | Q16769 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2005-08-23 | SER | A:193 | A:225 | 92.0 | 0.8 | T | -110.3 | 17.5 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.766 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 93.0 | 0.809 | T | -112.3 | 12.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6yi1 | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-07-01 | SER | A:193 | A:225 | 96.0 | 0.835 | T | -115.1 | 23.5 | 96.0 | 0.835 | 0.0 |
ZN HOH |
9.468 3.010 |
OG OG |
ZN O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 94.0 | 0.817 | T | -112.8 | 17.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6yjy | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-07-01 | SER | A:193 | A:225 | 93.0 | 0.809 | T | -108.3 | 17.5 | 93.0 | 0.809 | 0.0 |
HOH |
2.724 |
OG |
O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 92.0 | 0.8 | T | -115.5 | 13.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4yu9 | 1 | Q16769 | 99.39 | 0.0 |
X-RAY |
2015-08-05 | SER | A:193 | A:225 | 97.0 | 0.843 | H | -95.8 | 1.6 | 97.0 | 0.843 | 0.0 |
SO4 EDO HOH |
7.962 8.020 3.951 |
CB N OG |
O4 O1 O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 92.0 | 0.8 | T | -98.2 | 8.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:193 | C:225 | 95.0 | 0.826 | T | -99.0 | 9.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6gbx | 1 | Q16769 | 99.39 | 0.0 |
X-RAY |
2018-09-19 | SER | A:193 | A:225 | 98.0 | 0.852 | T | -85.5 | -13.1 | 98.0 | 0.852 | 0.0 |
EDO HOH |
8.518 2.918 |
N OG |
O2 O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 101.0 | 0.878 | T | -84.9 | -14.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:193 | C:225 | 99.0 | 0.861 | H | -85.1 | -14.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7d8e | 1 | Q16769 | 99.39 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-08 | SER | A:193 | A:225 | 105.0 | 0.913 | H | -91.9 | -4.0 | 105.0 | 0.913 | 0.0 |
EDO HOH |
8.518 5.449 |
N N |
O2 O |
||
| SER | B:193 | B:225 | 102.0 | 0.887 | H | -88.4 | -5.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:193 | C:225 | 92.0 | 0.8 | T | -98.3 | 0.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7coz | 1 | Q16769 | 99.39 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-13 | SER | A:191 | A:225 | 102.0 | 0.887 | H | -90.9 | -4.5 | 102.0 | 0.887 | 0.0 |
HOH |
2.616 |
O |
O |
||
| SER | B:191 | B:225 | 106.0 | 0.922 | T | -100.7 | 3.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:191 | C:225 | 101.0 | 0.878 | T | -92.0 | -4.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7cp0 | 1 | Q16769 | 99.39 | 0.0 |
X-RAY |
2021-01-13 | SER | A:191 | A:225 | 102.0 | 0.887 | T | -94.6 | -4.6 | 102.0 | 0.887 | 0.0 |
EDO HOH |
8.230 5.316 |
N N |
O1 O |
||
| SER | B:191 | B:225 | 100.0 | 0.87 | T | -94.1 | -3.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:191 | C:225 | 101.0 | 0.878 | T | -95.8 | -2.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3si0 | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-06-29 | SER | A:194 | A:225 | 93.0 | 0.809 | T | -114.6 | 18.3 | 93.0 | 0.809 | 0.0 |
HOH |
3.830 |
N |
O |
||
| 3si2 | 1 | B2RX76 | 86.24 | 0.0 |
X-RAY |
2011-06-29 | SER | A:191 | A:226 | 92.0 | 0.8 | T | -99.5 | 27.3 | 92.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
2.263 |
OG |
O |
||
| 3si1 | 1 | Q9CYK2 | 85.93 | 0.0 |
X-RAY |
2011-06-29 | SER | A:191 | A:226 | 99.0 | 0.861 | H | -48.1 | -58.7 | 99.0 | 0.861 | 0.0 | ||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q16769-f1 | 1 | Q16769 | 100.0 | 0.0 | SER | A:225 | A:225 | 91.0 | 0.791 | H | -90.6 | -17.1 | |