Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr20 | 55929144 | . | T | A | CCDS13458.1:NM_001015885.1:c.50aTg>aAg_NP_001015885.1:p.17M>K | Homo sapiens ribonucleic acid export 1 (RAE1), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3mmy | 1 | P78406 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-06-02 | MET | A:17 | A:17 | 177.0 | 0.957 | -62.2 | -20.1 | 177.0 | 0.957 | 0.0 |
HOH |
2.692 |
O |
O |
|||
MET | C:17 | C:17 | 176.0 | 0.951 | -60.8 | -17.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
MET | E:17 | E:17 | 178.0 | 0.962 | -61.4 | -18.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
MET | G:17 | G:17 | 174.0 | 0.941 | -63.7 | -14.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7vpg | 1 | P78406 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-19 | MET | A:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
MET | C:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
MET | E:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
MET | G:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7vph | 1 | P78406 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2022-01-19 | MET | A:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
MET | C:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
MET | E:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
MET | G:17 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p78406-f1 | 1 | P78406 | 100.0 | 0.0 | MET | A:17 | A:17 | 184.0 | 0.995 | -108.3 | 141.0 |