Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr20 55929144 . T A CCDS13458.1:NM_001015885.1:c.50aTg>aAg_NP_001015885.1:p.17M>K Homo sapiens ribonucleic acid export 1 (RAE1), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
3mmy 1 P78406 100.0 0.0 X-RAY
2010-06-02 MET A:17 A:17 177.0 0.957 -62.2 -20.1 177.0 0.957 0.0 HOH
2.692
O
O
MET C:17 C:17 176.0 0.951 -60.8 -17.5 NA NA NA
MET E:17 E:17 178.0 0.962 -61.4 -18.1 NA NA NA
MET G:17 G:17 174.0 0.941 -63.7 -14.7 NA NA NA
7vpg 1 P78406 100.0 0.0 X-RAY
2022-01-19 MET A:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET C:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET E:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET G:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7vph 1 P78406 100.0 0.0 X-RAY
2022-01-19 MET A:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET C:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET E:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
MET G:17 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p78406-f1 1 P78406 100.0 0.0 MET A:17 A:17 184.0 0.995 -108.3 141.0