Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr20 2297790 . G A CCDS33435.1:NM_003245.3:c.746aGc>aAc_NP_003236.3:p.249S>N Homo sapiens transglutaminase 3 (TGM3), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1l9m 1 Q08188 99.42 0.0 X-RAY
 2002-05-29 SER A:248 A:248 6.0 0.052 G -80.5 -26.8 6.0 0.052 0.0 HOH
 2.976
 O
 O
SER B:248 B:248 7.0 0.061 G -80.7 -23.8 7.0 0.061 0.0 HOH
 2.649
 O
 O
1l9n 1 Q08188 99.42 0.0 X-RAY
 2002-05-29 SER A:248 A:248 7.0 0.061 T -76.3 -28.4 7.0 0.061 0.0 HOH
 2.691
 OG
 O
SER B:248 B:248 7.0 0.061 T -80.6 -27.7 7.0 0.061 0.0 HOH
 2.911
 O
 O
1nud 1 Q08188 99.42 0.0 X-RAY
 2003-04-22 SER A:248 A:248 7.0 0.061 G -88.0 -22.4 7.0 0.061 0.0 HOH
 3.193
 OG
 O
SER B:248 B:248 3.0 0.026 T -82.2 -22.3 NA NA NA
1nuf 1 Q08188 99.42 0.0 X-RAY
 2003-04-22 SER A:248 A:248 5.0 0.043 G -85.1 -21.7 5.0 0.043 0.0 HOH
 3.338
 CB
 O
1nug 1 Q08188 99.42 0.0 X-RAY
 2003-04-22 SER A:248 A:248 5.0 0.043 G -81.0 -21.7 5.0 0.043 0.0 HOH
 3.279
 O
 O
SER B:248 B:248 6.0 0.052 T -75.7 -28.6 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q08188-f1 1 Q08188 100.0 0.0 SER A:249 A:249 5.0 0.043 G -73.0 -17.1